FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4184.ptfa, 905 aa vs ./tmplib.26680 library 1768112 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4357+/-0.00412; mu= 17.9288+/- 0.276 mean_var=74.7677+/-17.275, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 17 in 1/35 Lambda= 0.1483 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1973 ( 1031 res) mfj04206 (1031) 316 78 7.4e-15 >>mKIAA1973 ( 1031 res) mfj04206 (1031 aa) initn: 408 init1: 126 opt: 316 Z-score: 359.1 bits: 77.9 E(): 7.4e-15 Smith-Waterman score: 612; 22.525% identity (24.695% ungapped) in 808 aa overlap (91-856:70-848) 70 80 90 100 110 mKIAA4 AFRFAVQLYNTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFC-SQFSRGVYAIFGF-YDQ ::. :: .. : . .:: :...: .: mKIAA1 YNLSLEVVMAIEAGLGDLPLMPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 MSMNTLTSFCGALHT---SFVTPSFPTDADVQFVIQM--RPALKG---AILSLLGYYKWE : : ..:: :.: :: ... . .:. . .:.. . .:.: . .: mKIAA1 GEMMELDLVSSVLHIPVLSIVRHEFPRESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILTMNNWY 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 mKIAA4 KFVYLYDTERGFSILQAIMEAAVQNNWQVTARSVGNI-------KDIQEFRRI-IEEMDR .: : : ..: . .. ..:: . .:. :: ::. : .. .:.. mKIAA1 NFSLLLCQE-DWNITDFLL--LTENNSKFHLESIINITANLSSTKDLLSFLQVQLENIRN 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 mKIAA4 RQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHSRGYHYMLAN------LGFTDIVLERVMHGGA .. :.. : :.:. . .: :..:.. : . : . :: . mKIAA1 STPTMVMFGCDMGSIRQIFEMSTQFGLSPPDLHWVLGDSQNVEELRTEGLPLGLIAHGKT 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 NITGFQI-VNNENPMVQQFIQ--RWVRLDEREFPEAKNAPLKYISALTHDAILVIAEAFR . . :. :.. .: . . .. . .: . : . :: : : mKIAA1 TQSVFEYYVQDAMELVARAVATATMIQPELALLPSTMNCMDVKTTNLTSGQYLSRFLANT 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 YLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGID-IERAL--KMVQVQG----MTGNIQFDTY .: ... .::. : :. : . . . .. . :: : ..: . mKIAA1 TFRGLSGSIKVKGSTIVSSENNFFIWNLQYDPMGKPMWTRLGSWQGGRIVMDSGIWPEQA 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 GRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSSSSENRTIVVTTILESPY :. .. .... . . : : .:. . .. . ..::.: . mKIAA1 QRHKTHFHHPNKLHLRVVTLIEHPFVFTREV--DDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSILDSLF 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 VMYKKNHEQLEGNERY--EGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGM ..... . . . :::.:: ..:. . . . : ::::::::: .. :.:. mKIAA1 SSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAW--KNGHWTGL 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 VGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAY ::.:. : :..::. ..:. .: .::::..::.: ...:... . . : . .:. :: . mKIAA1 VGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAP-IGAFMWPLHW 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 EIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLE-DNNEEPRDPQSPPDPPNEFGIFNSLWFS .:. : :. . ...... . :::. . . :. .. . . ... .: :. mKIAA1 TMWLGI-FVALHITAIFLTL-----YEWKSPFGMTPKGRNRNKVFSFSSALNVCYALLFG 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 LGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED-- : .. :. .::.. ..: .: .. .:.::::::: .. :.. . . .: mKIAA1 RTAAIKP-----PKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPK 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 LAKQTE-IAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSK : . .. . .::. .:.... :.: ..: : : : : ::: .... mKIAA1 LHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATP--------DGVQYLKNDP 690 700 710 720 730 750 760 770 780 790 mKIAA4 GKF-AFLLESTMNEY-IEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSE :. ::...... .: . : . :: . .:::.. : .: : . .. . . . mKIAA1 EKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKS 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 mKIAA4 QGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMMVALIEFC .:..: :..:: : :: : : . .: ..... .:.: .: :.::...... : mKIAA1 HGFMDVLHDKW-YKVVPCG-KRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHI 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 mKIAA4 YKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI mKIAA1 VYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRFHRALNTSFVEEKQPCSKTKRVEKSRWRRWTCKTEG 860 870 880 890 900 910 905 residues in 1 query sequences 1768112 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:04:22 2006 done: Mon Mar 27 11:04:23 2006 Scan time: 0.970 Display time: 0.080 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]