FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4050.ptfa, 762 aa vs ./tmplib.26680 library 1768255 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4265+/-0.00595; mu= 7.3112+/- 0.394 mean_var=253.1602+/-61.626, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 136 in 1/35 Lambda= 0.0806 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744) 1254 160 2.4e-39 mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520) 538 76 2.6e-14 mKIAA1823 ( 376 res) mbh00306 ( 376) 225 39 0.001 mKIAA1333 ( 731 res) mpm08381 ( 731) 229 40 0.0011 >>mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744 aa) initn: 1696 init1: 729 opt: 1254 Z-score: 798.7 bits: 159.7 E(): 2.4e-39 Smith-Waterman score: 2616; 51.801% identity (57.538% ungapped) in 722 aa overlap (1-718:233-886) 10 20 30 mKIAA4 DCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLC ::. :::: ::::..::::: : .::.:: mKIAA0 PGPFASFPNGWTGKQKSPDGVHRVRVDFKEDCDLENVWLMGGLSVLTSVPGGPPMVCLLC 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 ASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLE ::.: :.:.:::::.::: ::::: ::: .. ..::::::::::::::. ...:.::: mKIAA0 ASKGLHELVFCQVCCDPFHPFCLEEAERPSPQHRDTWCCRRCKFCHVCGRKGRGSKHLLE 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 CNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWDAQWSHDFSLCH :..::..::: ::::.:::. :.... :::. ::::::::.: :::.::..:: :.::: mKIAA0 CERCRHAYHPACLGPSYPTRATRRRRHWICSACVRCKSCGAT-PGKNWDVEWSGDYSLCP 330 340 350 360 370 380 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 DCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCESLSGTEDEMYEILSNLP :..:. :::.::.: .::.:.:::::::::..::.:::.:::.:: :: :::::.:: mKIAA0 RCTELYEKGNYCPICTRCYEDNDYESKMMQCAQCDHWVHAKCEGLS---DEDYEILSGLP 390 400 410 420 430 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 ESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQASLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNP .:: ::: :. .:: :: ::..:.::: .::.:.... :: : mKIAA0 DSVLYTCGPCAGATQPRWREALSGALQGGLRQVLQGLLSSKVAGPLLLCTQC-------- 440 450 460 470 480 490 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 ETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDEQQPLDLEGVKKRMDQGSYVSVLEFSDDIVKII : : .:: . : ::..: ::...: : :: : .:.: :. mKIAA0 -------------GQD-------GKQLHPGPCDLQAVGKRFEEGLYKSVHSFMEDVVAIL 500 510 520 530 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 QAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSNNSGMLPNAVL . . .: :: ..:.:..:..... .: .: ::... ..:. . : :.:::::: mKIAA0 MRH-SEEGETPE-RRAGSQMKGLLLKLLESAFCWFDAHDPKYWRRSTRLPN-GVLPNAVL 540 550 560 570 580 400 410 420 430 440 mKIAA4 PPSLDHNYAQWQERE-ESSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDR :::::: ::::...: :. .. ::: : . .. : .: mKIAA0 PPSLDHVYAQWRQQESETPESGQPP----------------ADPSAAFQSKDPAAFSH-- 590 600 610 620 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 SREDSPELNPPPGIDDNRQCALCLMYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFED .:: ::::::: ::: ....::::::::::::::::::.:::::::. mKIAA0 -------------LDDPRQCALCLKYGDADSKEAGRLLYIGQNEWTHVNCAIWSAEVFEE 630 640 650 660 670 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 DDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVY .:::::::: :: ::.:.:::.: ::::::::::.:: ::.::::.::. :.: :::::. mKIAA0 NDGSLKNVHAAVARGRQMRCELCLKPGATVGCCLSSCLSNFHFMCARASYCIFQDDKKVF 680 690 700 710 720 730 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 CQRHRDLIKG-EVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLG ::.: ::. : :.: .::.:.:::.::::::...::::.::::. :...:::. :. :: mKIAA0 CQKHTDLLDGKEIVTPDGFDVLRRVYVDFEGINFKRKFLTGLEPDVINVLIGSIRINSLG 740 750 760 770 780 790 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 ILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIMECRP--PVVEPDINSTVEHD :.:::::: .::::::::::.::::.:::.:: : :.:.: :: : :: ..: mKIAA0 TLSDLSDCEGRLFPIGYQCSRLYWSTVDARRRCWYRCRILEYRPWGPREEPVYLEAAE-- 800 810 820 830 840 850 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 DNRTIAHSPSSFIDASCKDSQSTAAILSPPSPDRPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSSP .:.::.:::. . .:. . : : .: mKIAA0 ENQTIVHSPTPSSEPPNHDDLPDTDSLIPGDPVHHSPIQNLDPPLRTDSSNGPPPTPRSF 860 870 880 890 900 910 750 760 mKIAA4 LSNPGQSNKHHAATLI mKIAA0 SGARIKVPNYSPSRRPLGGVSFGPLPSPGSPSSLTHHIPTVGDSDFPAPPRRSRRPSPLA 920 930 940 950 960 970 >>mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520 aa) initn: 546 init1: 347 opt: 538 Z-score: 349.3 bits: 76.4 E(): 2.6e-14 Smith-Waterman score: 538; 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