FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0359.ptfa, 757 aa vs ./tmplib.26680 library 1768260 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9799+/-0.00845; mu= -2.7797+/- 0.560 mean_var=368.2278+/-89.739, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0668 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4058 ( 832 res) mic12051 ( 832) 1337 143 8.9e-35 mKIAA4086 ( 1158 res) mbg06649 (1158) 943 106 3e-23 mKIAA0706 ( 1120 res) mfj19350 (1120) 912 103 2.3e-22 mKIAA0531 ( 987 res) mbg05983 ( 987) 897 101 5.8e-22 mKIAA0591 ( 1162 res) mpm05364 (1162) 873 99 3.2e-21 mKIAA4102 ( 1138 res) mbg06734 (1138) 263 40 0.0016 mKIAA1236 ( 1309 res) mpm04158 (1309) 244 38 0.0062 >>mKIAA4058 ( 832 res) mic12051 (832 aa) initn: 2416 init1: 1291 opt: 1337 Z-score: 716.7 bits: 143.5 E(): 8.9e-35 Smith-Waterman score: 2985; 61.839% identity (66.985% ungapped) in 794 aa overlap (10-745:37-827) 10 20 30 mKIAA0 PLRLNWSEFIMSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYD . :: :.::...::.::::.. ::.::... mKIAA4 WASPTDPDLGVGQKDRPGCRAAHLEGQRCKMASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 KVVDVDVKLGQVSVKNPKGTSHEMPKTFTFDAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFN ... .:::::::...::... :.::::::::::: ..:: .::::: :::.:::::::: mKIAA4 QILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFN 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 GTIFAYGQTGTGKTYTMEGVRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQ ::.::::::::::::::.:. .:: ::::::.:.::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 GTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQ 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 EEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMN :::::::::. ::::::: :.::::.:::::::::.:::::::::.::: :.::.:.:: mKIAA4 EEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQARAVGSTHMN 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 mKIAA0 EHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVGKLNLVDLAGSERQAKTG------------- : :::::::::::.:::: : ::..:::::::::::::::::: :.: mKIAA4 EVSSRSHAIFVITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNAAGGPATQPTA 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 mKIAA0 -------------AQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRLLQD ..::: :::.:::::::::::::.::. ..::::::::::::::::: mKIAA4 GGGSGSGSASGSASSGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQD 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 SLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQEEIA ::::::::.:::..::::.. .:.:.:::.:::::::::::::::::::.:::::::::: mKIAA4 SLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIA 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 mKIAA0 RLKAQLEKRSI-GRRKRREK-RREGGGSGGGGEEE----EEEGEEGEEDGDDK------- ::::::::... :.: ::.. ::. . :. .: : : : :.:.... mKIAA4 RLKAQLEKKGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPAGYPEGSVIEAWVAEEEDDNNNNHHPPQPI 430 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 mKIAA0 ---------DDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAE ..: ..:.:.:: :: :: .:.:::.:::..::.:::: .::::::..:.: mKIAA4 LEAALEKNMENYLQDQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATE 490 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 MLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETL .:.:: ::::::::.::.::.::::::::.:: ::::::::::::::.::.: :::::. mKIAA4 LLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMLLRDEETM 550 560 570 580 590 600 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 ELKETYTSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELK ::. ::.::::::..::::::::..:::::::::.: .::.:. ::.::..::: ::::: mKIAA4 ELRGTYSSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHEEYIRVRQDLEEAQNEQTRELK 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 mKIAA0 LKHLIIENFIPLEEKNKIMNRSFFDDEEDHWKLHPITR--LENQQMMKRPVSAVGYKRPL ::.:::::::: ::::::::: :.: ::..:...:.. ..:.:: :::.::::::::. mKIAA4 LKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWRFQPLVPAGVNNSQMKKRPTSAVGYKRPI 670 680 690 700 710 720 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 SQHARMSMMIRPEPRYRAENIMLLELDMPSRTTRDYE---GPAISPKVQAA-----LDAA ::.::..: . .:::::::::.::::. . ..: .:.: ::. mKIAA4 SQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPAIFEMEFSHDQEQDPRVLHMERLMRLDSF 730 740 750 760 770 780 710 720 730 740 750 mKIAA0 LQDEDEIQVDASSFESTASRKPKARPKSGRKSGSSSSSSGNPASQFYPQSRGLVPK :. . .: : . ..:. : . .: .: .::. mKIAA4 LERPSTTKVRKSR---SWCQSPQRMPPPSTAHASMTSVPLHPATVVDHD 790 800 810 820 830 >>mKIAA4086 ( 1158 res) mbg06649 (1158 aa) initn: 482 init1: 416 opt: 943 Z-score: 509.9 bits: 105.7 E(): 3e-23 Smith-Waterman score: 1003; 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