FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0633.ptfa, 1334 aa vs ./tmplib.26680 library 1767683 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7746+/-0.00863; mu= -20.1940+/- 0.570 mean_var=453.7798+/-111.056, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0602 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0977 ( 1209 res) mic04087 (1209) 671 74 2.4e-13 >>mKIAA0977 ( 1209 res) mic04087 (1209 aa) initn: 823 init1: 367 opt: 671 Z-score: 331.9 bits: 73.6 E(): 2.4e-13 Smith-Waterman score: 875; 26.107% identity (30.713% ungapped) in 1287 aa overlap (13-1243:34-1183) 10 20 30 40 mKIAA0 LPLVMDCDDKERKMKARAPPPPGKPAAQNVHS-EQKLPHDAT : :..:: ::.. . .: : :. . :. mKIAA0 ASSAMDRSVPDPLPRSAPRTPAMQPAGSAGKTKGKAPLPPAETKGTDVSSAEDPVESTAV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 LGSQQSLVYMKEALQNSTLDITVVLPSGLEKQSVVSGSHAMMDLLVELCLQNHLNPSHHV . :: . . .. ....::::. . :...: ::. 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.: .. . . mKIAA0 SLEMAKDWE-SEAMG--RKDDQKMLPVGQRHTIENMTETS--MQTEVPATSKSSQQPQPD 760 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 SMEKYLNGPAECTIKR---APSTTITATPEKPQ--QDNGMKAAFTVTTPQQQPASQEYGA : .: .: ..: .:. : : :. :. :.: : : : .. . mKIAA0 LKPKPSSG-TERHLHRTLSSPTGTETNPPKAPRVTTDTG-------TIPFA-PNLEDINN 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 960 mKIAA0 HLEEERSRPRSAVSCSVKVPASNPTDITFLKPQRRTSSQYVASAIAKKMGPPKVHADVVR :: :. :: .: : ..:... ::. :.:.:..::.:: ::. ::. mKIAA0 ILE---SKFRSRASN----PQAKPSSF-FLQMQKRASGHYVTSAAAKS-----VHTA--- 870 880 890 900 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 PHKATTEQCHEEAKLARSPPTRKDDAAPNLH-SEARQHEHGTNQSSVCLPSNPGVQLPA- : : : .:.. :.: .:. : : .. :.. .. .. .: :: mKIAA0 PGPAPKEPTIKEVQ--RDPQL-----SPEQHPSSLSERTHSAPLPNISKADDDIIQKPAE 910 920 930 940 950 960 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 GGHPKVEVNSTYGKSSTQDYPAAVHRNSYFLPGRSSHRDRVSVGQSCGFNEKQTTSNQKA . : : . .. :. : : . . ::...: : : .. mKIAA0 TSPPPVAPKPMTLRAETS--PPPVFPKPMTLPAETSPPPVFP---------KPMTLPAET 970 980 990 1000 1010 1080 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