FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1111.ptfa, 1005 aa vs ./tmplib.26680 library 1768012 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2258+/-0.00749; mu= 4.0009+/- 0.496 mean_var=286.3033+/-68.844, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0758 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0662 ( 1038 res) mth02305 (1038) 1677 198 7.8e-51 mKIAA3014 ( 1304 res) mbg08774 (1304) 644 85 9.1e-17 >>mKIAA0662 ( 1038 res) mth02305 (1038 aa) initn: 2837 init1: 1673 opt: 1677 Z-score: 1005.0 bits: 197.5 E(): 7.8e-51 Smith-Waterman score: 2823; 46.881% identity (52.598% ungapped) in 1058 aa overlap (42-1005:2-1038) 20 30 40 50 60 mKIAA1 FHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDNHKG--KPLKTGSSMF : .::.: : . ::...::..: mKIAA0 KSTLKKKRTWHKHGPGPTPDVKPVQNGSQLF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 IRELRGRTFDSSDEVILKPTGSQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDV 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