FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0890.ptfa, 1057 aa vs ./tmplib.26680 library 1767960 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2397+/-0.00491; mu= 10.9394+/- 0.326 mean_var=119.4502+/-28.584, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1173 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 677 126 1.2e-29 mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417) 633 119 4.9e-27 mKIAA0134 ( 1167 res) mbh02208 (1167) 503 97 1.8e-20 mKIAA0577 ( 1048 res) mbg07362a (1048) 494 95 4.8e-20 mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224) 426 84 1.6e-16 mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 419 83 3.6e-16 mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 ( 937) 183 43 0.00031 >>mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 (425 aa) initn: 643 init1: 398 opt: 677 Z-score: 624.9 bits: 126.0 E(): 1.2e-29 Smith-Waterman score: 682; 35.561% identity (39.349% ungapped) in 374 aa overlap (318-663:46-411) 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 KNLMQFHTVGTKTKLATLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAAL--ACKKLKSLGLVDR .::. :. ... .: : :. .. ..: mKIAA1 DGGPRGSGQGSSGGGGGSRGSGGGGGGRGGRGRHPAHLKGREIGLWYAKKQTQKNKEAER 20 30 40 50 60 70 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 NNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPILRKIEAFLSHY-PVDSSW---ISPEL ... ..: . : : : .: . :: .: . : : .. .: : mKIAA1 QERAVVH-------MDERREEQIVQLLNSVQAKTDKDSEAQISWFAPEDHGYGTEVSSEK 80 90 100 110 120 410 420 430 440 mKIAA0 RLQSDDILPLGKDSGPLSDP-----ITGKPYMP------LSEAE-EVRLSQSLLE-LWRR ...:. : .... :.. :: : :. :.: : .. :.: ::: : :. mKIAA1 KINSEKKLD-NQEKKLLNQEKKTFRITDKSYIDRDTEYLLQENEPNLSLDQHLLEDLQRK 130 140 150 160 170 180 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 R-GPIWQEAP----QLPVDPHRDTILSAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTE . : . : .:: . ... :..: :.::::.:::::::.. :..:. :. . mKIAA1 KTDPRYIEMQRFRKKLPSYGMQKELVNLINNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIER 190 200 210 220 230 240 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 GRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRR--NVGFQVRLESKPPARGGALLFCT :.:. : .. ::::::::.:::.::. : . : ..:.:.::.:. : . :..:.:: mKIAA1 GKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVATERAESCGNGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCT 250 260 270 280 290 300 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 VGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDN .::.:. :::. : .:::...::.:::....: :. ..: : .. :...::::: . mKIAA1 TGIILQWLQSDSRLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVIKDLLHFRSDLKVILMSATLNA 310 320 330 340 350 360 630 640 650 660 670 mKIAA0 ERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLG--KHQYPHRHWHHESEDECALDLDL :.::.:::.::.:..::: .:: :. ::::. :. : :: mKIAA1 EKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDIIEKIRYVPDQKEHRSQFKRGFMQGHVNR 370 380 390 400 410 420 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 VTDLVLHIDARGEPGGCFLPPVHSNIPMMDQKAIFQQPPLGVRKIVLATNIAETSITVND >>mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417 aa) initn: 1118 init1: 357 opt: 633 Z-score: 577.7 bits: 119.0 E(): 4.9e-27 Smith-Waterman score: 875; 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