# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg06476.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0445.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0445, 1598 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893212 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2241+/-0.000213; mu= 5.9932+/- 0.012 mean_var=184.6702+/-35.504, 0's: 40 Z-trim: 173 B-trim: 0 in 0/64 Lambda= 0.094379 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123265692|emb|CAM16756.1| ciliary rootlet coile (1845) 5704 790.8 0 gi|123265693|emb|CAM16757.1| ciliary rootlet coile (2009) 5704 790.8 0 gi|81900535|sp|Q8CJ40.1|CROCC_MOUSE RecName: Full= (2009) 5704 790.8 0 gi|32449692|gb|AAH54054.1| Crocc protein [Mus musc (1845) 5698 790.0 0 gi|55666059|emb|CAH70057.1| ciliary rootlet coiled (1898) 4486 624.9 1.8e-175 gi|74746681|sp|Q5TZA2.1|CROCC_HUMAN RecName: Full= (2017) 4486 625.0 1.9e-175 gi|51536418|tpg|DAA05505.1| TPA: TPA_exp: 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ciliary rootlet coiled ( 715) 2503 354.5 1.8e-94 gi|119615223|gb|EAW94817.1| ciliary rootlet coiled ( 626) 2251 320.1 3.4e-84 gi|32526685|gb|AAP85633.1| medulloblastoma antigen ( 439) 2232 317.4 1.6e-83 gi|198419926|ref|XP_002119303.1| PREDICTED: simila (2051) 2074 296.6 1.4e-76 gi|109487543|ref|XP_001068827.1| PREDICTED: simila (1735) 2011 287.9 4.7e-74 gi|149411477|ref|XP_001513460.1| PREDICTED: simila (1922) 1994 285.6 2.5e-73 gi|148708022|gb|EDL39969.1| mCG133041 [Mus musculu (1728) 1797 258.8 2.8e-65 gi|189234789|ref|XP_966531.2| PREDICTED: similar t (1928) 1733 250.1 1.3e-62 gi|94364089|ref|XP_982250.1| PREDICTED: similar to (1675) 1708 246.6 1.2e-61 gi|149234198|ref|XP_001474905.1| PREDICTED: simila (1710) 1707 246.5 1.4e-61 gi|149037527|gb|EDL91958.1| rCG55575 [Rattus norve (1108) 1698 245.1 2.4e-61 gi|189520245|ref|XP_688293.3| PREDICTED: similar t (1762) 1557 226.1 1.9e-55 gi|212512937|gb|EEB15603.1| Rootletin, putative [P (1900) 1449 211.4 5.5e-51 gi|119615222|gb|EAW94816.1| 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