FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1114.ptfa, 1736 aa vs ./tmplib.26680 library 1767281 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5156+/-0.00781; mu= -0.6619+/- 0.517 mean_var=324.7181+/-77.687, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 142 in 1/35 Lambda= 0.0712 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00163 ( 798 res) mph01789 ( 798) 1312 150 1.9e-36 mFLJ00211 ( 305 res) mbg20018 ( 305) 675 84 5.1e-17 mKIAA1587 ( 934 res) mfj49064 ( 934) 631 80 2.3e-15 mKIAA0023 ( 2112 res) mbg02458 (2112) 355 52 1.3e-06 mKIAA0618 ( 971 res) mfj10160 ( 971) 307 47 2.4e-05 mKIAA4231 ( 1467 res) mfj06028 (1467) 302 47 4.5e-05 mKIAA1881 ( 1017 res) mtg02633 (1017) 286 45 0.00011 mFLJ00201 ( 640 res) mpm06260 ( 640) 269 43 0.00028 mKIAA1870 ( 857 res) mtj02754 ( 857) 254 42 0.00098 >>mFLJ00163 ( 798 res) mph01789 (798 aa) initn: 1354 init1: 1303 opt: 1312 Z-score: 746.9 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.... . .... : . :... ::. : .:. .: :::: mKIAA0 FGVTTAASTASSTMTSTSQSVLFGGAPSSAPALASIFQFGKPLAPAASAAG---TSFSQP 620 630 640 650 660 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 LNSSASFGGAINTSAGFGSTLNSSASFGSALST-SASFGGVLNGSAGFGGALNTNATFGG : ::.. ... . .::::::..:.: .. : . .:..... . :. ....: mKIAA0 LASSTQTAASNSGFSGFGSTLTTSTSAPATTSQPTLTFSNTVTPT--FNIPFSSSAK--- 670 680 690 700 710 720 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 VLNGSAGFGGAMNTNATFGGALN-SNAGFGGAISTSTNFGGALNNSAGFGGAMNTSASFG . . :: :.. :::.. . .. ... ....: .:: :. :. .: . :.:: mKIAA0 --PALPTYPGA-NSQPTFGATDGATKPALAPSFGSSFTFG---NSVASAPSAAPAPATFG 730 740 750 760 770 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA1 GALNNSAGFGGAISTNATFGGALNNSAGFGGAISTNATFGGALNNSAGFGGAISTSASFG .: . .::: .. .:::. ... .::.. :. .::.: ...:::.: .:.:. mKIAA0 SA--AQPAFGGLKAAASTFGAPASTQPAFGSTTSV-FSFGSA--TTSGFGAA-ATAATTT 780 790 800 810 820 830 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA1 GTLNNSASFGGAINTSASFGGVLNNSAGFGGAINTSANFGGALTNSAGFG-GAISTSASF : :...: :. ::. . ::: :: .: :.::: .: ..: mKIAA0 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