# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg06389.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0629.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0629, 1023 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920842 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5278+/-0.000185; mu= 11.8553+/- 0.010 mean_var=79.8137+/-15.758, 0's: 33 Z-trim: 34 B-trim: 485 in 2/65 Lambda= 0.143561 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|149265812|ref|XP_001002157.2| PREDICTED: simila (1895) 6646 1387.1 0 gi|148703835|gb|EDL35782.1| mCG1909 [Mus musculus] (1965) 6646 1387.1 0 gi|149050015|gb|EDM02339.1| similar to A-kinase an (1892) 5702 1191.6 0 gi|13431290|sp|Q62924.1|AKA11_RAT RecName: Full=A- (1129) 5064 1059.3 0 gi|109120661|ref|XP_001091086.1| PREDICTED: A-kina (1925) 4380 917.8 0 gi|149730340|ref|XP_001492688.1| PREDICTED: simila (1906) 4352 912.0 0 gi|194671953|ref|XP_612396.4| PREDICTED: similar t (1905) 4008 840.7 0 gi|114651411|ref|XP_001151787.1| PREDICTED: A-kina (1873) 3804 798.5 0 gi|114651409|ref|XP_001151723.1| PREDICTED: A-kina (1901) 3804 798.5 0 gi|13431310|sp|Q9UKA4.1|AKA11_HUMAN RecName: Full= (1901) 3778 793.1 0 gi|73989321|ref|XP_851781.1| PREDICTED: similar to (1940) 3709 778.8 0 gi|114651415|ref|XP_001151668.1| PREDICTED: A-kina (1469) 3489 733.2 2.3e-208 gi|119629082|gb|EAX08677.1| A kinase (PRKA) anchor (1469) 3480 731.3 8.5e-208 gi|26328603|dbj|BAC28040.1| unnamed protein produc ( 521) 1808 384.7 6.6e-104 gi|126337715|ref|XP_001369145.1| PREDICTED: simila (1923) 1477 316.5 8.1e-83 gi|166796866|gb|AAI59158.1| LOC100145197 protein [ (1834) 1325 285.0 2.3e-73 gi|7023878|dbj|BAA92117.1| unnamed protein product ( 307) 1155 249.3 2.2e-63 gi|149412352|ref|XP_001507739.1| PREDICTED: simila (1999) 1014 220.7 6.1e-54 gi|118084844|ref|XP_417031.2| PREDICTED: similar t (1956) 747 165.3 2.7e-37 gi|189523903|ref|XP_686916.3| PREDICTED: similar t (1785) 618 138.6 2.7e-29 gi|47217128|emb|CAG02629.1| unnamed protein produc ( 652) 331 78.9 9.6e-12 gi|125821301|ref|XP_001339537.1| PREDICTED: simila ( 583) 227 57.3 2.7e-05 >>gi|149265812|ref|XP_001002157.2| PREDICTED: similar to (1895 aa) initn: 6646 init1: 6646 opt: 6646 Z-score: 7429.2 bits: 1387.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6646; 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