FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0587.ptfa, 1067 aa vs ./tmplib.26680 library 1767950 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9918+/-0.00495; mu= 17.0799+/- 0.331 mean_var=110.0707+/-25.494, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1222 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4100 ( 1145 res) mfj53354 (1145) 3204 577 5.7e-165 >>mKIAA4100 ( 1145 res) mfj53354 (1145 aa) initn: 3129 init1: 1644 opt: 3204 Z-score: 3054.1 bits: 576.9 E(): 5.7e-165 Smith-Waterman score: 4123; 56.657% identity (58.027% ungapped) in 1059 aa overlap (33-1066:13-1071) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 GQAGGPEGGGEPGSSAPGGGGGGGGRTMSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYN :. . : ::::::::::::: :.: :.:: mKIAA4 LSGWSSLSVAIMSLTSAYQLKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 IKKACGDPKAKPSYLIDKNLESAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALY :::.:.: :.:: .:..:..:: .:.: .::: ...::..:.:. ...::.::.. :. : mKIAA4 IKKTCSDSKSKPPFLLEKSMESCLKYINKKFPNIDVRNSTQHLGPVHREKAEIIRFLTNY 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 YFTFVDVMEFKDHVCDLLNTIDVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLTVTYTTLMILLSRIEER : .:::::::.::: .::::::.:: :::..:::.:..:::: ::::....::::::.: mKIAA4 YQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDACQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVILLLSRIEDR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 KAIIGLYNYAHEMTHGASDREYPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMV . .::.:: :::: :: :: . :::::...:..::::. ::: ::.:..: ::.::... mKIAA4 RILIGMYNCAHEMLHGHSDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKAVSGALLSLHFL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 mKIAA0 YPRRNLSADQWRNAQLLSLISAPSTMLN----------------------FGFILCHGML . ::: .:.:::.::::::::.: .:.: .::.:::: : mKIAA4 FVRRNQGAEQWRSAQLLSLISSPPAMINPANSDTMACEYLSVEVMERWIIIGFLLCHGCL 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 NTEATALNLWKLALQSSSCLSLFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVS :... .:::: :..: ..:.:..:...::..:::: ...::.::. ::.: :: :.. mKIAA4 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