FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0304.ptfa, 1744 aa vs ./tmplib.26680 library 1767273 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6357+/-0.00709; mu= -3.6329+/- 0.461 mean_var=517.4950+/-127.530, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0564 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4050 ( 762 res) mbg07005 ( 762) 1254 118 1e-26 mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520) 618 66 5.9e-11 mKIAA0339 ( 822 res) mph02448 ( 822) 537 59 3.9e-09 mKIAA1076 ( 855 res) mbh01320 ( 855) 536 59 4.3e-09 mKIAA4065 ( 779 res) mpj03374 ( 779) 312 41 0.0012 mKIAA0388 ( 758 res) mbh00510 ( 758) 307 41 0.0016 mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848) 298 40 0.0046 mKIAA1420 ( 907 res) mfj05028 ( 907) 289 39 0.0049 >>mKIAA4050 ( 762 res) mbg07005 (762 aa) initn: 1696 init1: 729 opt: 1254 Z-score: 571.8 bits: 117.7 E(): 1e-26 Smith-Waterman score: 2616; 51.801% identity (57.538% ungapped) in 722 aa overlap (233-886:1-718) 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 PGPFASFPNGWTGKQKSPDGVHRVRVDFKEDCDLENVWLMGGLSVLTSVPGGPPMVCLLC ::. :::: ::::..::::: : .::.:: mKIAA4 DCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLC 10 20 30 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 ASKGLHELVFCQVCCDPFHPFCLEEAERPSPQHRDTWCCRRCKFCHVCGRKGRGSKHLLE ::.: :.:.:::::.::: ::::: ::: .. ..::::::::::::::. ...:.::: mKIAA4 ASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLE 40 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 CERCRHAYHPACLGPSYPTRATRRRRHWICSACVRCKSCGAT-PGKNWDVEWSGDYSLCP :..::..::: ::::.:::. :.... :::. ::::::::.: :::.::..:: :.::: mKIAA4 CNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWDAQWSHDFSLCH 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 mKIAA0 RCTELYEKGNYCPICTRCYEDNDYESKMMQCAQCDHWVHAKCEGLS---DEDYEILSGLP :..:. :::.::.: .::.:.:::::::::..::.:::.:::.:: :: :::::.:: mKIAA4 DCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCESLSGTEDEMYEILSNLP 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 DSVLYTCGPCAGATQPRWREALSGALQGGLRQVLQGLLSSKVAGPLLLCTQC-------- .:: ::: :. .:: :: ::..:.::: .::.:.... :: : mKIAA4 ESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQASLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNP 220 230 240 250 260 270 500 510 520 530 mKIAA0 -------------GQD-------GKQLHPGPCDLQAVGKRFEEGLYKSVHSFMEDVVAIL : : .:: . : ::..: ::...: : :: : .:.: :. mKIAA4 ETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDEQQPLDLEGVKKRMDQGSYVSVLEFSDDIVKII 280 290 300 310 320 330 540 550 560 570 580 mKIAA0 MRH-SEEGETPE-RRAGSQMKGLLLKLLESAFCWFDAHDPKYWRRSTRLPN-GVLPNAVL . . .: :: ..:.:..:..... .: .: ::... ..:. . : :.:::::: mKIAA4 QAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSNNSGMLPNAVL 340 350 360 370 380 390 590 600 610 620 mKIAA0 PPSLDHVYAQWRQQESETPESGQPP----------------ADPSAAFQSKDPAAFSH-- :::::: ::::...: :. .. ::: : . .. : .: mKIAA4 PPSLDHNYAQWQERE-ESSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDR 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 mKIAA0 -------------LDDPRQCALCLKYGDADSKEAGRLLYIGQNEWTHVNCAIWSAEVFEE .:: ::::::: ::: ....::::::::::::::::::.:::::::. mKIAA4 SREDSPELNPPPGIDDNRQCALCLMYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFED 450 460 470 480 490 500 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 NDGSLKNVHAAVARGRQMRCELCLKPGATVGCCLSSCLSNFHFMCARASYCIFQDDKKVF .:::::::: :: ::.:.:::.: ::::::::::.:: ::.::::.::. :.: :::::. mKIAA4 DDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVY 510 520 530 540 550 560 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 CQKHTDLLDGKEIVTPDGFDVLRRVYVDFEGINFKRKFLTGLEPDVINVLIGSIRINSLG ::.: ::. : :.: .::.:.:::.::::::...::::.::::. :...:::. :. :: mKIAA4 CQRHRDLIKG-EVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLG 570 580 590 600 610 620 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 TLSDLSDCEGRLFPIGYQCSRLYWSTVDARRRCWYRCRILEYRPWGPREEPVYLEAAE-- :.:::::: .::::::::::.::::.:::.:: : :.:.: :: : :: ..: mKIAA4 ILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIMECRP--PVVEPDINSTVEHD 630 640 650 660 670 680 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 ENQTIVHSPTPSSEPPNHDDLPDTDSLIPGDPVHHSPIQNLDPPLRTDSSNGPPPTPRSF .:.::.:::. . .:. . : : .: mKIAA4 DNRTIAHSPSSFIDASCKDSQSTAAILSPPSPDRPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSSP 690 700 710 720 730 740 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 SGARIKVPNYSPSRRPLGGVSFGPLPSPGSPSSLTHHIPTVGDSDFPAPPRRSRRPSPLA mKIAA4 LSNPGQSNKHHAATLI 750 760 >>mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520 aa) initn: 1075 init1: 492 opt: 618 Z-score: 289.0 bits: 66.4 E(): 5.9e-11 Smith-Waterman score: 618; 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