FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0735.ptfa, 588 aa vs ./tmplib.26680 library 1768429 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.3930+/-0.00367; mu= 20.8592+/- 0.246 mean_var=64.8808+/-14.616, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 56 in 1/35 Lambda= 0.1592 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0736 ( 747 res) mbh04144 ( 747) 2813 656 3.6e-189 mKIAA1054 ( 752 res) mfj42114 ( 752) 2631 614 1.4e-176 >>mKIAA0736 ( 747 res) mbh04144 (747 aa) initn: 2817 init1: 2162 opt: 2813 Z-score: 3488.5 bits: 655.8 E(): 3.6e-189 Smith-Waterman score: 2813; 67.402% identity (67.632% ungapped) in 589 aa overlap (1-587:158-746) 10 20 30 mKIAA0 ETIIDECGHGRFQWTLFFVLGLALMADGVE :::. :::::::::::.::::::::::::: mKIAA0 RGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKDREELAQQYETILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVE 130 140 150 160 170 180 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 IFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGLIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKKVLSMSLAIN .:::.:.:::::::::::.:.:::::::::::::.:::. :::::.:::.. : .::..: mKIAA0 VFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVN 190 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 ASFASLSSFVQGYGAFLFCRLISGIGIGGSLPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMT . :: .::::::::.::::::.::.:::::.::::.::::::..:::::::::: .::: mKIAA0 SVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMI 250 260 270 280 290 300 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 GGIYASAMAWSIIPHYGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPATVSMVALKFMPESPRFLL ::.::.::::.:::::::.:.::. :.::::::::.:::.:.. .. :: .::::::.: mKIAA0 GGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFL 310 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 EMGKHDEAWMILKQVHDTNMRAKGTPEKVFTVSHIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLV : ::::::::.::::::::::::: ::.::.:.:::: .: ::.:::::.:::::::: : mKIAA0 ENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGV 370 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 RFMTIFKQVWDNALYCVMGPYRMNTLILAVVWFTMALSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKS : ... ::: : : : :: ::.. :::::..::::::::::::::..: .: . mKIAA0 RALSLGGQVWGNFLSCFSPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYAA 430 440 450 460 470 480 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 KMKVFFGEHVHGATINFTMENQIHQHGKLVNDKFIKMYFKHVLFEDTFFDKCYFEDVTST . ::: ::.:. .:.:::.:::::. :. ::::: . .: : :::..:..::::::::. mKIAA0 RTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSS 490 500 510 520 530 540 400 410 420 430 440 mKIAA0 DTYFKNCTIESTTFYNTDLYKHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDFEEDND--FLIYLVSF .:.:.:::. .:.::::::...::.: :..:::::..:::: .: .. ...:.::: mKIAA0 NTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLVNSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSF 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 LGSLSVLPGNIISALLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTS ::.:.::::::.::::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::. ::: :.: mKIAA0 LGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVLSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVS 610 620 630 640 650 660 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 IAAWNALDVITVELYPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAAS ::.::::::.::::::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:. mKIAA0 IASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAA 670 680 690 700 710 720 570 580 mKIAA0 LVGGGLIALRLPETREQVLM :. :. .::.::::: :::. mKIAA0 LALGSSLALKLPETRGQVLQ 730 740 >>mKIAA1054 ( 752 res) mfj42114 (752 aa) initn: 2919 init1: 1952 opt: 2631 Z-score: 3262.6 bits: 614.0 E(): 1.4e-176 Smith-Waterman score: 2631; 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