FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0910.ptfa, 1584 aa vs ./tmplib.26680 library 1767433 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.1387+/-0.0118; mu= -34.7945+/- 0.779 mean_var=816.3223+/-199.167, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0449 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0348 ( 1299 res) mpm09073 (1299) 3307 231 1.6e-60 mKIAA0851 ( 611 res) mbh00089 ( 611) 635 57 1.1e-08 mKIAA0966 ( 1169 res) mpm04106 (1169) 570 53 3.3e-07 >>mKIAA0348 ( 1299 res) mpm09073 (1299 aa) initn: 2735 init1: 1488 opt: 3307 Z-score: 1179.1 bits: 230.7 E(): 1.6e-60 Smith-Waterman score: 3504; 44.874% identity (48.828% ungapped) in 1346 aa overlap (145-1453:1-1274) 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 SLRVDASDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGVSLDLSLNAHRSMQEHTTDNRFFW-NQS :..:. :. : . . . : : :: mKIAA0 SSLSVRSSFPASFTGSSSRAPVRTQWMNQL 10 20 30 180 190 200 210 220 230 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