FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0651.ptfa, 985 aa vs ./tmplib.26680 library 1768032 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1848+/-0.00528; mu= 12.7481+/- 0.351 mean_var=168.0744+/-38.798, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0989 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1998 ( 1366 res) mbg16805 (1366) 1592 240 1.4e-63 mKIAA0521 ( 740 res) mbg02422 ( 740) 826 131 7.9e-31 mFLJ00369 ( 939 res) msh02173 ( 939) 526 88 7.1e-18 mKIAA0382 ( 1553 res) mbg03948 (1553) 516 87 2.6e-17 mKIAA0380 ( 653 res) mfj03079 ( 653) 256 49 2.3e-06 mKIAA1256 ( 1539 res) mbg11030 (1539) 211 43 0.00033 mKIAA2016 ( 1731 res) mbg07142 (1731) 204 42 0.00071 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 193 40 0.0014 mKIAA0915 ( 438 res) mid15017 ( 438) 173 37 0.0066 >>mKIAA1998 ( 1366 res) mbg16805 (1366 aa) initn: 906 init1: 403 opt: 1592 Z-score: 1233.7 bits: 240.2 E(): 1.4e-63 Smith-Waterman score: 1592; 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