# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg06182.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4048.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4048, 1363 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7908537 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2230+/-0.000201; mu= 10.9800+/- 0.011 mean_var=121.7166+/-23.130, 0's: 36 Z-trim: 73 B-trim: 249 in 1/68 Lambda= 0.116252 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|5901745|gb|AAD55393.1|AF175292_1 neuronal IL-16 (1322) 8760 1481.5 0 gi|149057429|gb|EDM08752.1| interleukin 16 (mapped (1323) 8166 1381.8 0 gi|47077568|dbj|BAD18668.1| unnamed protein produc (1331) 6963 1180.1 0 gi|114658507|ref|XP_001157454.1| PREDICTED: interl (1332) 6957 1179.1 0 gi|223460532|gb|AAI36661.1| IL16 protein [Homo sap (1331) 6953 1178.4 0 gi|148833504|ref|NP_757366.2| interleukin 16 isofo (1332) 6951 1178.1 0 gi|36953836|gb|AAQ86961.1| neural interleukin 16 p 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534.1 1.1e-148 gi|193785937|dbj|BAG54724.1| unnamed protein produ ( 658) 3113 534.1 1.2e-148 gi|52783035|sp|O62675.1|IL16_MACMU RecName: Full=I ( 630) 3112 533.9 1.3e-148 gi|52783036|sp|O62676.1|IL16_MACFA RecName: Full=I ( 630) 3106 532.9 2.6e-148 gi|73951277|ref|XP_860817.1| PREDICTED: similar to (1283) 3094 531.2 1.7e-147 gi|52783037|sp|O62677.1|IL16_SAISC RecName: Full=I ( 627) 3072 527.2 1.3e-146 gi|52783038|sp|O62678.1|IL16_AOTTR RecName: Full=I ( 632) 3064 525.9 3.4e-146 gi|122144437|sp|Q0V8R5.1|IL16_BOVIN RecName: Full= ( 627) 2944 505.7 3.9e-140 gi|116283877|gb|AAH50362.1| IL16 protein [Homo sap ( 576) 2816 484.2 1.1e-133 gi|119619505|gb|EAW99099.1| interleukin 16 (lympho ( 501) 2709 466.2 2.4e-128 gi|204307502|gb|ACI00236.1| interleukin 16 [Homo s ( 560) 2633 453.5 1.8e-124 gi|25955530|gb|AAH40272.1| IL16 protein [Homo sapi ( 454) 2581 444.7 6.6e-122 gi|34447114|dbj|BAC84973.1| interleukin-16 precurs ( 568) 2428 419.1 4.1e-114 gi|45726856|dbj|BAD12838.1| interleukin 16 [Sus 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