FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1176.ptfa, 1164 aa vs ./tmplib.26680 library 1767853 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5534+/- 0.005; mu= 21.4659+/- 0.335 mean_var=127.0598+/-29.918, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1138 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00098 ( 1091 res) mpg00643 (1091) 4906 818 0 >>mFLJ00098 ( 1091 res) mpg00643 (1091 aa) initn: 5066 init1: 3125 opt: 4906 Z-score: 4355.0 bits: 817.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 5318; 72.414% identity (76.731% ungapped) in 1102 aa overlap (66-1164:49-1091) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 EAAQPSRARRRAATMLNNLTDCEDGDGGANPGDGNPKESSPFINSTDTEKGREYDGRNMA ::::::.:.:::::....:. ..:.::: mFLJ00 EARADGAGDEAAERTEEPESPESVDQTSPTPGDGNPRENSPFINNVEVERESYFEGKNMA 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 LFEEEMDTSPMVSSLLSGLANYTNLPQGSREHEEAENNEGGKKKPVQAPRMGTFMGVYLP :::::::..:::::::. ::::::: :: :::: :.. ... :.:::::::.::::: mFLJ00 LFEEEMDSNPMVSSLLNKLANYTNLSQGVVEHEEDEDS---RRREVKAPRMGTFIGVYLP 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 CLQNIFGVILFLRLTWVVGIAGIMESFCMVFICCSCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYY :::::.::::::::::.:: ::.:::: .: .::.::::::::::::::::::::::::: mFLJ00 CLQNILGVILFLRLTWIVGAAGVMESFLIVAMCCTCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYY 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 MISRSLGPEFGGAVGLCFYLGTTFAGAMYILGTIEILLAYLFPAMAIFKAEDASGEAAAM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:. :. :::.:: :.:::::. mFLJ00 MISRSLGPEFGGAVGLCFYLGTTFAGAMYILGTIEIFLTYISPSAAIFQAETADGEAAAL 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 LNNMRVYGTCVLTCMATVVFVGVKYVNKFALVFLGCVILSILAIYAGVIKSAFDPPNFPI ::::::::.:.:. ::.:::::::::::.:::::.::.::::::::::::.:: ::..:. mFLJ00 LNNMRVYGSCALALMAVVVFVGVKYVNKLALVFLACVVLSILAIYAGVIKTAFAPPDIPV 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 CLLGNRTLSRHGFDVCAKLAWEGNETVTTRLWGLFCSSRLLNATCDEYFTRNNVTEIQGI ::::::::. ..::.:::. .: :::: :: :::.. :.:::::::..::::::::: mFLJ00 CLLGNRTLANRNFDTCAKMQVVSNGTVTTALWRLFCNGSSLGATCDEYFAQNNVTEIQGI 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 PGAASGLIKENLWSSYLTKGVIVERRGMPSVGLAD-GTPVDMDHPYVFSDMTSYFTLLVG ::.:::.. .::::.: ::..::..:. :: ... . : . :::..:. .:::.::: mFLJ00 PGVASGVFLDNLWSTYSDKGAFVEKKGVSSVPVSEESRPGGL--PYVLTDIMTYFTMLVG 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 IYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPTGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVVLRDK :::::::::::::::::::.::::::::::::::.::: .:.: .::::::::::::::: mFLJ00 IYFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDK 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 FGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPFLQVF ::::..::::.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::: mFLJ00 FGEALQGNLVIGMLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIIPFLQVF 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 GHGKANGEPTWALLLTACICEIGILIASLDEVAPILSMFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTP ::::::::::::::::: ::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: mFLJ00 GHGKANGEPTWALLLTALICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTP 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 NWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALVAMLIAGLIYKYIEYRGAEKEWGDGI ::::::..:::::::::::::::::::::::::: :::::: :::::::::::::::::: mFLJ00 NWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALFAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGI 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 RGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLVRVDQDQNVVHPQLLSLTSQLKAGKGLT :::::.::::::::.:.:::::::::::.::.. .:..: : ::.:::.::::::::::: mFLJ00 RGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDSEQCVKHPRLLSFTSQLKAGKGLT 680 690 700 710 720 730 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 IVGSVLEGTFLDNHPQAQRAEESIRRLMEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVSHLIQSGGLGG :::::::::.::.: .::::::.:: :: :::.:::::.:.:::::::.::::::.:::: mFLJ00 IVGSVLEGTYLDKHVEAQRAEENIRSLMSAEKTKGFCQLVVSSNLRDGASHLIQSAGLGG 740 750 760 770 780 790 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 LQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFIELVRETTAGHLALLVTKNVSMFPGNPERFSEGS ..:::::..::. :.. .. .:.::.. ::.:::.: ::::.::...:: : ::::.:. mFLJ00 MKHNTVLMAWPEAWKEADNPFSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNIDLFPQNQERFSDGN 800 810 820 830 840 850 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 IDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRHHKVWRKCKMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLTTFLYHLRIT :::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::.::::::::::: :::::::. mFLJ00 IDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRIS 860 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 AEVEVVEMHESDISAYTYEKTLVMEQRSQILKQMHLTKNEREREIQSITDESRGSIRRKN :::::::: :.::::.::::::.::::::.::::.:.::::::: mFLJ00 AEVEVVEMVENDISAFTYEKTLMMEQRSQMLKQMQLSKNERERE---------------- 920 930 940 950 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 PANPRLRLNVPEETACDNEEKPEEEVQLIHDQSAPSCPSSSPSPGEEPEGERETDPEVHL .:::::... : ... : : .:.. mFLJ00 -------------------------AQLIHDRNTASHTTATARTQAPP-----TPDKVQM 960 970 980 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA1 TWTKDKSVAEK--NKGPSPVSSEGIKDFFSMKPEWENLNQSNVRRMHTAVRLNEVIVNKS ::::.: .::: :: .: :.::.::.::. :::::::::::.:: :..::: mFLJ00 TWTKEKLIAEKHRNKDTGP---SGFKDLFSLKPD-----QSNVRRMHTAVKLNGVVLNKS 990 1000 1010 1020 1030 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA1 RDAKLVLLNMPGPPRNRNGDENYMEFLEVLTEQLDRVMLVRGGGREVITIYS .::.::::::::::..:.:::::::::::::: :.::.:::::::::::::: mFLJ00 QDAQLVLLNMPGPPKSRQGDENYMEFLEVLTEGLNRVLLVRGGGREVITIYS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1164 residues in 1 query sequences 1767853 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:37:48 2006 done: Mon Mar 27 10:37:49 2006 Scan time: 1.070 Display time: 0.120 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]