FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0214.ptfa, 776 aa vs ./tmplib.26680 library 1768241 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2701+/-0.00495; mu= 14.7865+/- 0.332 mean_var=116.4155+/-26.037, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1189 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4032 ( 749 res) mpg00417 ( 749) 3312 579 4.7e-166 >>mKIAA4032 ( 749 res) mpg00417 (749 aa) initn: 3259 init1: 2524 opt: 3312 Z-score: 3073.6 bits: 579.4 E(): 4.7e-166 Smith-Waterman score: 3312; 66.306% identity (66.757% ungapped) in 739 aa overlap (40-775:9-745) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 CEGLLPARNEMSLLFSRCNSIVTVKKDKRHMAEVNASPLKHFVTAKKKINGIFEQLGAYI :::. .::::::: ::: :..:: :: .. mKIAA4 GKALSRCIMAET-VSPLKHFVLAKKAITAIFGQLLEFV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 QESASFLEDTHRNTELDPVTTEEQVLDVKGYLSKVRGISEVLARRHMKVAFFGRTSNGKS :.. :.: :.:: ::: ...:.......:: .:. :.:::.:::::::::::::.::: mKIAA4 TEGSHFVEATYRNPELDRIASEDDLVEIQGYRNKLAVIGEVLSRRHMKVAFFGRTSSGKS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 TVINAMLWDKVLPSGIGHTTNCFLRVGGTDGHEAFLLTEGSEEKKSVKTVNQLAHALHQD .::::::::::::::::::::::: : :::: .:.:.::::.::::::::::::::::.: mKIAA4 SVINAMLWDKVLPSGIGHTTNCFLSVEGTDGDKAYLMTEGSDEKKSVKTVNQLAHALHMD 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 EQLHAGSMVSVMWPNSKCPLLKDDLVLMDSPGIDVTTELDSWIDKFCLDADVFVLVANSE ..:.:: .: :.::..:: ::.:::::.:::: ::::::: ::::::::::::::::::: mKIAA4 KDLKAGCLVHVFWPKAKCALLRDDLVLVDSPGTDVTTELDIWIDKFCLDADVFVLVANSE 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 STLMQTEKQFFHKVSERLSRPNIFILNNRWDASASEPEYMEEVRRQHMERCTSFLVDELG ::::.:::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::.::::::::: :::.:: mKIAA4 STLMNTEKHFFHKVNERLSKPNIFILNNRWDASASEPEYMEDVRRQHMERCLHFLVEELK 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 VVDRAQAGDRIFFVSAKEVLSARVQKAQGMPEGGGALAEGFQVRMFEFQNFERQFEECIS ::. ..: .:::::::::::..: .:::::::::::::::::.:. ::::::. :::::: mKIAA4 VVSPSEARNRIFFVSAKEVLNSRKHKAQGMPEGGGALAEGFQARLQEFQNFEQTFEECIS 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 QSAVKTKFEQHTVRAKQIAEAVRLIMDSLHIAAQEQRVYCLEMREERQDRLRFIDKQLEL ::::::::::::.::::: ..:. :.::...:: :.::: .: ::.. ::: :: .:..: mKIAA4 QSAVKTKFEQHTIRAKQILDTVKNILDSVNVAAAEKRVYSMEEREDQIDRLDFIRNQMNL 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 LAQDYKLRIKQITEEVERQVSTAMAEEIRRLSVLVDEYQMDFHPSPVVLKVYKNELHRHI :. : : .::..:::: .:: ::..:: ::::::::. .:::.: ::::::.::..:: mKIAA4 LTLDVKKKIKEVTEEVANKVSCAMTDEICRLSVLVDEFCSEFHPTPSVLKVYKSELNKHI 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 EEGLGRNLSDRCSTAIASSLQTMQQDMIDGLKPLLPVSMRNQIDMLVPRQCFSLSYDLNC :.:.::::.:::.. . .:. ::..:..::::::....:.. :.: . :.::::::: mKIAA4 EDGMGRNLADRCTNEVNASILQSQQEIIENLKPLLPAGIQNKLHTLIPCKKFDLSYDLNC 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 DKLCADFQEDIEFHFSLGWTMLVNRFLGPKNSRRALLGYSD---QVQRPLPLTPANPSMP :::.:::::: :.:::::. ::.:::: :..:.::: :. :: : : ::. :: : mKIAA4 HKLCSDFQEDIVFRFSLGWSSLVHRFLGSTNAQRVLLGLSEPIFQVPRSLASTPTAPSNP 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 PLPQSSLTQEELMVSMVTGLASLTSRTSMGILVVGGVVWKAVGWRLIALSFGLYGLLYVY :... .:::::....::::::::::::::.:::::.::.:::.::......:: ::.: mKIAA4 AAPDNA-AQEELMITLITGLASLTSRTSMGIIVVGGVIWKTVGWKLISVTLSMYGALYLY 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 ERLTWTTKAKERAFKRQFVEYASEKLQLIISYTGSNCSHQVQQELSGTFAHLCQQVDITR :::::::.:::::::.:::.::.::::.:.:.:..:::::::::.. :::.::::::.:. mKIAA4 ERLTWTTRAKERAFKQQFVNYATEKLQMIVSFTSANCSHQVQQEMATTFARLCQQVDVTQ 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 mKIAA0 DNLEQEIAAMNKKVEALDSLQSRAKLLRNKAGWLDSELNMFTHQYLQPSR .::.::: ..:... :...:. .::::::: :.:::. :..:.:.:: mKIAA4 KHLEEEIARLSKEIDQLEKIQNNSKLLRNKAIQLESELENFSKQFLHPSSGES 700 710 720 730 740 776 residues in 1 query sequences 1768241 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:14:49 2006 done: Mon Mar 27 10:14:50 2006 Scan time: 0.910 Display time: 0.060 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]