FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0454.ptfa, 1136 aa vs ./tmplib.26680 library 1767881 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6602+/-0.00785; mu= 1.1308+/- 0.519 mean_var=336.2043+/-80.400, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0699 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 303 46 8.3e-05 mKIAA1398 ( 804 res) mph00305 ( 804) 259 41 0.001 mKIAA0402 ( 1911 res) mib09022 (1911) 257 41 0.002 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 252 40 0.0023 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 251 40 0.0027 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 244 40 0.0046 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 233 38 0.0082 >>mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048 aa) initn: 118 init1: 85 opt: 303 Z-score: 178.6 bits: 45.8 E(): 8.3e-05 Smith-Waterman score: 309; 21.448% identity (23.916% ungapped) in 746 aa overlap (411-1127:1254-1951) 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 DDLCDEYLPIGFQPVPKGLPTQQKPDLHETPTTQPPVSESHLAELQDKIQQTEATNKILQ : : .:: .. . ...::: :. mKIAA0 DLAIRCVQKNIKKNKGVKDWPWWKLFTTVRPLIQVQLSEEQIRNKDEEIQQ-------LR 1230 1240 1250 1260 1270 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 EKLNDLSCELKSAQESSQKQDTTIQSLKEMLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLH ::. . : . . ::.. .: :. : : .... : :..... : .:: mKIAA0 SKLEKVEKERNELRLSSDRLETRISELTSELTDERNTGESASQLLDAE--TAERLRT--- 1280 1290 1300 1310 1320 1330 510 520 530 540 550 mKIAA0 QSQLGQLHSSEGIAPAQQQVALLDLQSALFCSQLEIQ-RLQRLVRQKERQLADGKRCVQL .... .:... :..: .... : . ::. ... : .: .: :. mKIAA0 EKEMKELQTQYDALKKQMEVMEMEVMEARLIRAAEINGEVDDDDAGGEWRLKY-ERAVRE 1340 1350 1360 1370 1380 1390 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 VEAAAQEREHQKEAAWKHNQELRKALQHLQGELHSKSQQ-LHVLEAEKYNEIRTQGQNIQ :. . .. ... : . .:. :. :.. :.:.. :.. ..:. : . : .. .: mKIAA0 VDFTKKRLQQELEDKMEVEQQSRRQLERRLGDLQADSDESQRALQQLKKKCQRLTAE-LQ 1400 1410 1420 1430 1440 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 HLSHSLSHKEQLIQELQELLQYRDNADKTLDTNEVFLEKL-RQRIQ-DRAVALERVIDEK . : .. .::.. : : ... . .:. ::: :...: .. . : .... : mKIAA0 DTKLHLEGQQVRNHELEKK-QRRFDSELSQAHEETQREKLQREKLQREKDMLLAEAFSLK 1450 1460 1470 1480 1490 1500 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 FSALEEKDKELRQLRLAVRDRDHDLERLRCVLSANEATMQSMESLLRARGLEV----EQL . .:::: .. . : . . .:. . : .::.. .... :: .: :.: mKIAA0 -QQMEEKDLDIAGFTQKVVSLEAELQDISSQESKDEASLAKVKKQLRDLEAKVKDQEEEL 1510 1520 1530 1540 1550 1560 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 TATCQNLQWLKEELETKFGHWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKLGPGQSE ..: : :. . .. . :.: . : . ...:..:::. . :: . . mKIAA0 DEQAGSIQML-EQAKLRL---EMEMERMRQTHSKEMESRDEEVEEARQSCQKKLKQMEVQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 VAEELC--QRLQRKERMLQDLLSDRNKQAVEHEMEIQGLLQSMGTREQERQAAAEKMVQA . :: :. :..: :.. :: . :. ....: . :.. : . : :. :.. mKIAA0 LEEEYEDKQKALREKRELESKLSTLSDQVNQRDFESEKRLRKDLKRTKALLADAQIMLD- 1630 1640 1650 1660 1670 1680 860 870 880 890 900 mKIAA0 FMERNS----ELQALRQYLGGKELMTSSQTFISNQPAGVTSIGPHHGEQTDQGSMQMPSR .. :. :. :.. : .:. .. .. . : . . : : :. . . mKIAA0 HLKNNAPSKREIAQLKNQLEESEFTCAAA--VKARKAMEVEMEDLH-LQIDDIAKAKTAL 1690 1700 1710 1720 1730 910 920 930 940 950 mKIAA0 DDSTSLTAREEASIPRSTLGDSDTVAGLEK--------------ELSNAKEELELMAKKE ... : ::. : :.. . : : .... . ..: :.. mKIAA0 EEQLSRLQREKNEIQNRLEEDQEDMNELMKKHKAAVAQASRDMAQMNDLQAQIEESNKEK 1740 1750 1760 1770 1780 1790 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 RESQMELSALQSMMAMQEEELQVQAADLESLTRNVQIKEDLIKDLQMQL-VDPEDIPAME .: : .:.:::: : : :. . .: ..: .: :..:. .: . .. .: mKIAA0 QELQEKLQALQS----QVEFLEQSMVDKSLVSR----QEAKIRELETRLEFEKTQVKRLE 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 RLTQEVLLLREKVASVEPQGQEVSGNKRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLV :.... ::.. : . :......:.. .. .::.. :. .. .: :. mKIAA0 NLASRLKETMEKLT--EERDQRAAAENREK---------EQNKRLQRQLRDTKEEMSELA 1860 1870 1880 1890 1900 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 KFHAQPENSERDGTLQVELEGAQVLRTRLEEVLGRSLERLSRLESLAAIGGGELESVQAR . .: : :.. :...::. .. :. : ...:.. :. ::: :.:: mKIAA0 RKEA--EASRKKHELEMDLESLEAANQSLQADLKLAFKRIGDLQ--AAIED-EMESDENE 1910 1920 1930 1940 1950 mKIAA0 HKHAF mKIAA0 DLINSEGDSDVDSELEDRVDGVKSWLSKNKGPSKAPSDDGSLKSSSPTSHWKPLAPDPSD 1960 1970 1980 1990 2000 2010 >>mKIAA1398 ( 804 res) mph00305 (804 aa) initn: 167 init1: 82 opt: 259 Z-score: 159.0 bits: 40.8 E(): 0.001 Smith-Waterman score: 282; 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