FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0708.ptfa, 2228 aa vs ./tmplib.26680 library 1766789 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4087+/-0.00659; mu= 9.6434+/- 0.439 mean_var=204.8012+/-49.402, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 29 in 1/35 Lambda= 0.0896 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0076 ( 1508 res) mfj09377 (1508) 3133 419 4.3e-117 mKIAA4199 ( 510 res) mfj24036 ( 510) 564 87 2e-17 mKIAA0161 ( 350 res) mfj06138 ( 350) 311 54 1.1e-07 mKIAA1386 ( 1087 res) mbg07509 (1087) 276 50 5.4e-06 >>mKIAA0076 ( 1508 res) mfj09377 (1508 aa) initn: 4554 init1: 2180 opt: 3133 Z-score: 2194.6 bits: 419.3 E(): 4.3e-117 Smith-Waterman score: 4103; 44.438% identity (58.579% ungapped) in 1744 aa overlap (9-1684:106-1496) 10 20 30 mKIAA0 PCLTKEKSRAQQELEFSMAVGNLISELVRSMGWARNLS :.. :::::::.:.::::::..: : : mKIAA0 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