FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0307.ptfa, 725 aa vs ./tmplib.26680 library 1768292 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9013+/-0.00628; mu= 3.3323+/- 0.417 mean_var=242.2799+/-56.151, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0824 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4051 ( 721 res) mbh02817 ( 721) 2197 274 2.8e-74 mKIAA0334 ( 857 res) mbf01556 ( 857) 226 40 0.0011 mKIAA0482 ( 1331 res) mfj10183 (1331) 203 38 0.0094 >>mKIAA4051 ( 721 res) mbh02817 (721 aa) initn: 2745 init1: 2158 opt: 2197 Z-score: 1425.9 bits: 274.4 E(): 2.8e-74 Smith-Waterman score: 2774; 61.111% identity (67.485% ungapped) in 720 aa overlap (66-725:10-721) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 PVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGPSKFSRENHSEIERRRRNKMTQY :.... ...:::::::::::::::: : mKIAA4 FINSVFRSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAY 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 ITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLI :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::: mKIAA4 ITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLI 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 LEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTS :::::::::.:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: :: mKIAA4 LEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTS 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKR ::..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: mKIAA4 ENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGTSSVDPVSMNRLSFLRNR 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 FRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSS ::::: ::::: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.::::::::::::: mKIAA4 CRNGLGSVKEGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSS 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 PVCMDMSGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHL : : :::.. ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. : mKIAA4 PNCTDMSNICQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLL 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 RESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWLLIRTSSFTFQNPYSDEIEYVICTNTNVK--- :.::::::::::::::::.:::.:.:::: .:::::::::::::::::.:::::::: mKIAA4 RDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKTREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSS 340 350 360 370 380 390 460 470 mKIAA0 ----------------------------------QLQQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQV : :::..::. : ::::.::. ::: mKIAA4 QEPRPTLSNTIPRSQLGPTANLSLEMGTGQLPSRQQQQQHTELDMVPGRDGLASYNHSQV 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 PVPNLPAGVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASASGSQQIYSQ : . .. : .: .::....:.:.::::: :.. .:.:...: .::... ..::..:: mKIAA4 SVQPVASAGSEHSKPLEKSEGLFAQDRDPRFPEIYPSITADQSKGISSSTVPATQQLFSQ 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 GSPFPAG-HSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNISQISRQLN--QGQV-AWTGS-RP :: :: . . .. : .: . .: :. .: :::.:: ..::::. : ::.. .::.: :: mKIAA4 GSSFPPNPRPAENFRNSGL-TPPVTIVQPSSSAGQILAQISRHSNPAQGSAPTWTSSSRP 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 mKIAA0 PFPGQ-PS----KTQSSAFGIGSSHPYPADPSSYSPLSSPAA-SSPSGNA-YPSLANRTP : .: :. ::.:: ::... . ::.: .: :.: .. ::.: ::.: :: mKIAA4 GFAAQVPTQATAKTRSSQFGVNNFQT----SSSFSAMSLPGAPTASSGTAAYPALPNRGS 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 mKIAA0 GFA-ESGQSGGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQQ----PGQTEVFQDM .: :.::. ::::.: .: :: :::.: :: ..:.::: .: :.: ::::.: mKIAA4 NFPPETGQTTGQFQARTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQTQAQAPSQPEVFQEM 640 650 660 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 LPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE : : :: .. .:: :.: :: ::::::: mKIAA4 LSMLGDQSN---TYNNEEFPDLTMFPPFSE 700 710 720 >>mKIAA0334 ( 857 res) mbf01556 (857 aa) initn: 324 init1: 98 opt: 226 Z-score: 158.8 bits: 40.2 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 430; 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