FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0302.ptfa, 1972 aa vs ./tmplib.26680 library 1767045 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3669+/-0.00705; mu= 4.1067+/- 0.466 mean_var=293.1457+/-70.224, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0749 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290) 3528 396 2.5e-110 mKIAA4219 ( 918 res) mbg04678 ( 918) 2160 248 6.4e-66 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 280 45 0.00012 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 249 42 0.0011 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 237 41 0.0035 mKIAA0465 ( 1485 res) mbg10008 (1485) 233 40 0.0042 mKIAA1011 ( 1666 res) mbg00096 (1666) 231 40 0.0053 >>mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290 aa) initn: 3528 init1: 3528 opt: 3528 Z-score: 2073.2 bits: 396.5 E(): 2.5e-110 Smith-Waterman score: 3528; 59.908% identity (59.908% ungapped) in 868 aa 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:..:. :. .:.::::::: :.: mKIAA4 ESQSIRVKAQS------LPLPSLAGPDASV------GK-KEKEKRFSFFPKKK 880 890 900 910 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 147 init1: 54 opt: 280 Z-score: 176.0 bits: 45.5 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 430; 22.620% identity (26.083% ungapped) in 1145 aa overlap (416-1492:217-1277) 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 TLDALREQAAALPPALSHTPEVQGRVPTLEQHYEELQTRAGERARALEAALAFYTMLSEA .: .:: .. .: ... : :: . :.: mFLJ00 LQRNCAAYLRLRNWQWWRLFTKVKPLLNSIRHEDELLAKEAELTKVREKHLAAENRLTE- 190 200 210 220 230 240 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 GACGLWVEEKEQWLNGLALPERLEDLEVVQQRFETLEPEMNALAARVTA----VNDIAEQ .: .. : . :.:. : .: . : : : . : ::.:: ...: .. mFLJ00 ------METMQSQL----MAEKLQLQEQLQAETE-LCAEAEELRARLTAKKQELEEICHD 250 260 270 280 290 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 LLKASPPGKDRIIGTQEQLNQRWQQFRSLADGKKAALTSALSIQNYHLECTETQAWMREK : ..: : . .. :... : . . .. ..: :: . :.: : mFLJ00 LEARVEEEEERCQYLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQ---LEKVTTEA----K 300 310 320 330 340 570 580 590 600 610 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