FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0358.ptfa, 1581 aa vs ./tmplib.26680 library 1767436 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8317+/-0.0062; mu= 5.1587+/- 0.411 mean_var=186.7098+/-44.395, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0939 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217) 272 50 3e-06 mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884) 266 50 7.2e-06 mKIAA1766 ( 618 res) mfj69272 ( 618) 244 46 2.5e-05 mKIAA0870 ( 1280 res) mth00251 (1280) 241 46 5.7e-05 mKIAA1277 ( 1074 res) mph01932 (1074) 229 44 0.00015 >>mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217 aa) initn: 210 init1: 170 opt: 272 Z-score: 204.6 bits: 50.3 E(): 3e-06 Smith-Waterman score: 273; 24.427% identity (28.402% ungapped) in 393 aa overlap (250-620:170-529) 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 GVQRDTMWRIFTGSLLVEEKSSALLQDLREIEAWIYRLLRS-PVPVSGQK-RVDIEVLPQ .:..:: .: :.: :.. . . : mKIAA1 ITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPLESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPI 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 ELQQALTFALPDPSRFTLVDFPLHLPLELLGVDACLQVLTCILLEHKVVLQSRDYNALSM :. : :: : :::.. .:::::. .:..:: ::: ...: :. :. : mKIAA1 ICQRPSTNELP------LFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMT 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 SVMAFVAMIYPLEYMFPVIPLLPTCMASAEQLLLAPTPYIIGVPASFFLYKLDFKMPDDV . ...:...:.... .:.:: :: ..: ::.::..:. .. . . ...:... mKIAA1 VAETITALMFPFQWQHVYVPILP---ASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEA 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 mKIAA0 WL--VDLDSNRVIAPTNAEVLPILPEPESLELKKHLKQALASMSLNTQPILNLE------ : ::.:.. . : : :: .:. .::. ..... : :.... : ::. mKIAA1 NLCFVDVDNHFIELP---EDLPQFPN--KLEFVQEVSEIL--MAFGVPPEGNLHCSESAS 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 KFHEGQEIPLLLGRPSNDLQSTPSTEFNPLIYGNDVDSVDVATR---VAM----VRFFNS :... . :. . .... ..: .. : .. . ... .. :.. :: : mKIAA1 KLKRIRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPS 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 ANVLQGFQMHTRTLRLFPRPVVAFQAGSFLASRPRQTPFAE-KLARTQAVEYFGEWILNP .: : . ::.. . .: .:.: : ::. .. : . :. : mKIAA1 SNKDFKVQCDEEELRIYQ---LNIQIREVFANRFTQM-FADYEVFVIQPSQDKESWFTN- 430 440 450 460 470 570 580 590 600 610 mKIAA0 SNYAFQRIHNNTFDPA-LIGDKPKWYAHQLQPIHYRVYDGNSQLAEAL---SVPPERDSD : . ..:: : ...:.:. : :. : . .:. .. .. . :.: mKIAA1 ------REQMQNFDKASFLSDQPEPYL----PFLSRFLE--TQMFASFIDNKIMCHDDDD 480 490 500 510 520 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 SDPTEDSGSDSQDYDDSSSSYSSLGDFVSEMMKCDINGDTPNVDPLTHAALGDASEVEID .::. mKIAA1 KDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLL 530 540 550 560 570 580 >>mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884 aa) initn: 443 init1: 141 opt: 266 Z-score: 197.7 bits: 49.7 E(): 7.2e-06 Smith-Waterman score: 370; 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