FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0277.ptfa, 584 aa vs ./tmplib.26680 library 1768433 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2792+/-0.00419; mu= 11.5186+/- 0.281 mean_var=85.7149+/-19.334, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1385 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4040 ( 1035 res) mic20095 (1035) 1565 323 6.7e-89 mKIAA0313 ( 1138 res) mbg03233 (1138) 575 125 2.6e-29 mKIAA4052 ( 1046 res) mbg11557 (1046) 567 124 7.5e-29 mKIAA0351 ( 537 res) mbg14564 ( 537) 282 67 6.4e-12 mKIAA0846 ( 693 res) mfj18276 ( 693) 248 60 8.6e-10 mKIAA1308 ( 924 res) mbh02485 ( 924) 198 50 1.1e-06 >>mKIAA4040 ( 1035 res) mic20095 (1035 aa) initn: 1482 init1: 977 opt: 1565 Z-score: 1688.4 bits: 323.2 E(): 6.7e-89 Smith-Waterman score: 1565; 46.080% identity (46.887% ungapped) in 523 aa overlap (66-583:515-1033) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 DVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLAE .: ...:.:.::::::::::.:. ..: mKIAA4 EANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRAANQGNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEP 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 VQHKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQG-EEENSDVPCR-KRKVLHL .. :...:.::.. . ::: . .:: ::. :: :. :: :.: : ::.:..: mKIAA4 SLNEATDSVLNDFVMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQERMDYALNNKRRVIRL 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 VSQWISLYKDWLHEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKILGVYRRHTVDE : :: ..: : :.::. . ::. .: .: ::. . ....: :..::. .. . : mKIAA4 VLQWAAMYGDLLQEDDVAMAFLEEFYVSVSDDARMMAAFKEQLPELEKIV---KQISEDA 610 620 630 640 650 660 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 YSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVAETEEIFCHVYITEHSYISVKAKVSSTAQEILK .::::.:.:..::. .. :.: . ..:.. .:: .:.: .... :.....:... mKIAA4 KAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCIDHTYTTIRVPVAASVKEVIS 670 680 690 700 710 720 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 VVAEKLQRAEEDLALVAITFSGEKHEFQPNDLAISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPLAE .::.:: .: : .: .. .::: .. ::... .: .::... .. :.:.:: : mKIAA4 AVADKLGSGE-GLIIVKMNSGGEKVVLKSNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPE 730 740 750 760 770 780 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 NEESQQRSMRILG-MNTWDLALELMSFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGNGENTVNLSLL .: .. . :.. ::: .. ..:: ::: .:: :::: ::.:.. ..:.::.:. mKIAA4 QEGPTTGTVGTFELMSSKDLAYQMTTYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLF 790 800 810 820 830 840 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQQNLNSFFAIVMGLNTASVS :.: ::.:.::.::. :::::.:::::.::::::::::: .::::::::::::....:: mKIAA4 LRRFNEIQFWVVTEVCLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVS 850 860 870 880 890 900 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 RLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHE ::. ::::.:.::::...:.::: ::: ::.::: . :..:: :::::::.::.:: :: mKIAA4 RLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTAAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE 910 920 930 940 950 960 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 GNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFGSDVSP--KEQQELKSYVNHLYVIDSQ :::::.::::::::..:::.:.::.:. :.. :. :.. :..:...::: .: :::.: mKIAA4 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ 970 980 990 1000 1010 1020 580 mKIAA0 QALFELSHRLEPRA ..: ..::::::: mKIAA4 RTLSQMSHRLEPRRP 1030 >>mKIAA0313 ( 1138 res) mbg03233 (1138 aa) initn: 493 init1: 329 opt: 575 Z-score: 618.5 bits: 125.4 E(): 2.6e-29 Smith-Waterman score: 575; 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