FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0440.ptfa, 1510 aa vs ./tmplib.26680 library 1767507 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7820+/-0.00655; mu= 6.0292+/- 0.438 mean_var=222.6727+/-51.186, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0859 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185) 2798 361 8.4e-100 mKIAA4074 ( 1099 res) mfj12253 (1099) 1589 211 1.1e-54 mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 ( 726) 682 98 5.8e-21 mKIAA0545 ( 886 res) mpm03375 ( 886) 648 94 1.2e-19 mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 ( 467) 235 43 0.00021 mKIAA1039 ( 336 res) mbg02540 ( 336) 220 41 0.00061 >>mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185 aa) initn: 3559 init1: 2071 opt: 2798 Z-score: 1884.1 bits: 361.0 E(): 8.4e-100 Smith-Waterman score: 3745; 52.181% identity (58.875% ungapped) in 1284 aa overlap (269-1508:1-1182) 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 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.. ..:. ::. .:: . :....:.:.. :: ::.:.:::::::. : mKIAA1 QHVLSKDDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNVSP----------RRSLYRTLSDESVCS 910 920 930 940 950 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA0 SQR-EHFFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLR-RPSYTLGMKSLHGEFSASDS ..: : .::.:.:.::::::.:::.: : ..:: : .:. ..: ::..:: ::. mKIAA1 NRRGSSFASSRSSILEQALPNDILFSTT-PPYHSTLPPRTHPAPSMG--SLRNEFWFSDG 960 970 980 990 1000 1010 1360 1370 1380 1390 mKIAA0 SLTDIQETRRQPIPDPGLMPLPDAASDLDWSNLVDAAKAYEV------------------ ::.: .. :::::::::.:. ::::.:::::.:.: mKIAA1 SLSD-----KSKCADPGLMPLPDTAAGLDWSHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHASYLD 1020 1030 1040 1050 1060 1400 1410 1420 1430 1440 1450 mKIAA0 QR-ASFFAASDENH-RPLSAASNSDQLEEQALVQ--MKSYSSKDPSPTLASKVDQLEGML :: ::: . .: .: . : .: . . . . . : . . ..:: ::..::.::: .: mKIAA1 QRVASFCTLTDLQHGQELEGAPELSLCVDPTSGKEFMDTPGEQSPS-TLTGKVNQLELIL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1460 1470 1480 1490 1500 1510 mKIAA0 KMLREDLKKEKEDKAQLQAEVEHLREDNLRLQEESQNASDKLKKFTEWVFNTIDMS ..:. ::.:::.::: :::::.:::.::.:::::::.:. .:.::::: 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: : .:: :: mKIAA4 T--SDSGPE----LRASILPRTLSLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTILE 950 960 970 980 990 1000 950 960 970 980 990 1000 mKIAA0 HLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSD mKIAA4 SLSREGQPISESGDPKEALKCDSEPEPGSLSEKVSHLESMLWKLQEDLQREKADRAALEE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 >>mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 (726 aa) initn: 819 init1: 423 opt: 682 Z-score: 468.6 bits: 98.4 E(): 5.8e-21 Smith-Waterman score: 746; 39.157% identity (41.534% ungapped) in 332 aa overlap (217-547:150-463) 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 GVAVLEVPKESLMLHLDRVKRYTVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSI : ::: : :::.::.. : :: .. :. mKIAA0 EGTNHEISSLPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDTALGHLVFSL 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 RREKPEDMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLP-LKEVLEHV . . :.. . :...:: . . .:.:: : .: . .. . : mKIAA0 KYDVIGDQE------HLRLLLRT------KCRTHHDVIPI----SCLTEFPNVVQMAKLV 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 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