FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0219.ptfa, 1744 aa vs ./tmplib.26680 library 1767273 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8184+/-0.00423; mu= 12.0398+/- 0.283 mean_var=97.2262+/-22.113, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1301 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0829 ( 1332 res) mpm05057 (1332) 150 40 0.0045 >>mKIAA0829 ( 1332 res) mpm05057 (1332 aa) initn: 271 init1: 83 opt: 150 Z-score: 147.5 bits: 40.0 E(): 0.0045 Smith-Waterman score: 237; 21.104% identity (23.982% ungapped) in 1033 aa overlap (612-1584:151-1119) 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 ESWRTKAGSVELLGAMAYCAPKQLSSCLPNIVPKLTEVLTDSHVKVQKAGQQALRQIGSV .: . ..: :.. .::. . . : . : mKIAA0 DKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILRLLEDKNGEVQNLAVKCLGPLVSK 130 140 150 160 170 180 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 IRNPEILAIAPVLLDALTDPSRKTQKCLQTLLDTKFVHFIDAPSLALIMPIVQRAFQDRS 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