FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0813.ptfa, 1557 aa vs ./tmplib.26680 library 1767460 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1836+/-0.00519; mu= 11.1837+/- 0.345 mean_var=135.2438+/-33.072, 0's: 0 Z-trim: 46 B-trim: 101 in 1/35 Lambda= 0.1103 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 7298 1174 0 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 435 82 8.7e-16 mKIAA0279 ( 1484 res) meh01738 (1484) 404 77 2.7e-14 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 384 74 1.6e-13 mKIAA4226 ( 2225 res) mpf00382 (2225) 377 73 7e-13 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 353 69 4.9e-12 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 337 66 2.5e-11 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 331 65 4.2e-11 mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 322 64 1.3e-10 mFLJ00070 ( 1167 res) mbg01449 (1167) 325 65 1.4e-10 mKIAA0814 ( 116 res) mpk00279 ( 116) 296 59 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TCSCPSGFEGPTCGVDTDDCVKHACVNGGVCVDGVGNYTCQCPLQYTGRACEQLVDFCSP :.: .:::: .: :. ::: . : :...::::..:::: :: .:::. ::. .:::. mKIAA4 WCTCADGFEGENCEVNIDDCEDNDCENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGELCEEKLDFCAQ 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 DMNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMLGYTGDNCSENQDDCKDHKCQNGAQCVDEVNSYACLC :.:::::...:. :: : .:.: :: :..:. . :::.:.::.:::.:.: ::.:.:.: mKIAA4 DLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYIGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCVC 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA0 VEGYSGQLCEI-PPA--PRSS-CEGTECQNGANCVDQGSRPVCQCLPGFGGPECEKLLSV ::::: .::. :: ::.: :.. .:::::.:. . ..:.::::::. : .::::.:: mKIAA4 PEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIIRINEPICQCLPGYLGEKCEKLVSV 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA0 NFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPG :::....:::. . . :..:::::..: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: : mKIAA4 NFVNKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1260 1270 1280 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QADGVLLQAVTRGRSTITLQLRAGHVVLSVEGTGLQASSLRLEPGRANDGDWHHAQLALG 450 460 470 480 490 500 >>mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 (760 aa) initn: 472 init1: 199 opt: 384 Z-score: 335.3 bits: 73.8 E(): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 471; 24.724% identity (29.511% ungapped) in 635 aa overlap (44-587:67-689) 20 30 40 50 60 mKIAA0 RPSGTRTGHGEGTMALTPQRGSSSGLSRPELWLLL------WAAAWRLGATACPALCTCT ::.:: .::. : . .:.:. mKIAA1 NELELCLWRAGWLLLLCDEIWDELLALKMLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCN 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 ---GTT-VDCHGTGLQAIPK-NIPRNT-ERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMEN : :::. :. .. . . : . .: :.::..::. :.::.. . :.. .: mKIAA1 EIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENN 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 QIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQLQVLPELLFQNNQALSRLDLSENFLQAVPRKAFRG . . ::: .. ..::..: :... . . : . . : :. . :.:. . ::. mKIAA1 GLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQD 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 ATDLKNLQLDKNRISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSS-FNHMPKLRTFRLHS . :. : :. : :: . ..:. . . : : .: . :.: ....: . . :.. mKIAA1 LNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYV-PITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLED 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 mKIAA0 NHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQ--CSGPASLRGLNVAEVQKGE------------ : : : : :..::.. : .:. . : .:. :.: .. :. . . mKIAA1 NPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSL 280 290 300 310 320 330 290 300 mKIAA0 ------------------FSCSGQGEAA--GA-----------------PACTLSSGS-- :. .:: : : :: :. ...:: mKIAA1 PAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQDEHATPGAVPNGGTKIPGNWQLKIKPTPPIATGSAR 340 350 360 370 380 390 310 320 330 340 350 mKIAA0 ---------CPAMCSCS----SGI-VDCRGKGLTAIPANLPE--TMTEIRLELNGIKSIP ::. :::. ::. ..: ....... :. .. :. :. : :.:: mKIAA1 NKPPVHGLPCPGGCSCDHIPGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIR 400 410 420 430 440 450 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 PGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQL . : :..: .::.::.::.: ..:..: .: : . .: . : : :.:: .:. mKIAA1 KSHFVDYKNLILLDLGNNNIANIENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEY 460 470 480 490 500 510 420 430 440 450 460 mKIAA0 LLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFI--- : .. : :. : : .:. . .: .: : .: ..:: .:... ... : : .: :. mKIAA1 LNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGV-SLSKLSLHNNYFMYLP 520 530 540 550 560 570 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 CDCNLKWLADF----LRTNPIETTGARCA-SPRRLANKRIG-QIKSKKFRCSAKEQYFIP : :... :. :: : . :. : . .:.: .. . ..: . ..: mKIAA1 VAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECS---CTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFF-- 580 590 600 610 620 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 GTEDYHLNSECTSDVACPHKCRCEASVVECSSLKLSKIPERIPQSTTELRLNNNEISILE .:. : : .. ::. . .. : . . . : .:.. : . ::.: mKIAA1 -RKDFMLLS---NEEICPQLYARISPTLTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLDTSRVSISVL- 630 640 650 660 670 680 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 ATGLFKKLSHLKKINLSNNKVSEIEDGTFEGAASVSELHLTANQLESIRSGMFRGLDGLR . ::. mKIAA1 VPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNA 690 700 710 720 730 740 >>mKIAA4226 ( 2225 res) mpf00382 (2225 aa) initn: 173 init1: 127 opt: 377 Z-score: 323.6 bits: 73.2 E(): 7e-13 Smith-Waterman score: 500; 26.553% identity (32.759% ungapped) in 644 aa overlap (944-1526:1474-2056) 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 PGIARCAGPPEMEGKLLLTTPAKKFECQGPPSLA-VQAKCDPCLSSP--CQNQGTCHNDP ::: .. . :: :: :.: : : : mKIAA4 GEGWGDPCELCPKDDEVAFQDLCPYGHGTVPSLHDTREDVNECLESPGICSN-GQCINTD 1450 1460 1470 1480 1490 1500 980 990 1000 1010 1020 mKIAA0 LEVYRCTCPSGYK----GRHCEVSLDGCS-SNPCGNGGTCHAQEGEDAGFTCSCPSGFE- .:: :: ::. : .: :. : :: .:::::: :: : .: :.: ::: mKIAA4 GS-FRCECPMGYNLDYTGVRC-VDTDECSIGNPCGNG-TCTNVIG---SFECTCNEGFEP 1510 1520 1530 1540 1550 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 GP--TCGVDTDDCVKHACVNGGVCVDGVGNYTCQCPLQYTGRA----CEQLVDFCSPDMN :: .: : ..:... . . :.. :.: : ::. :. : :..: : :. .. mKIAA4 GPMMNCE-DINECAQNPLLCAFRCMNTFGSYECTCPVGYALREDQKMCKDL-DECAEGLH 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 PCQHEAQ-CVGTPDGPRCECMLGYT----GDNC-SENQDDCKDHKCQNGAQCVDEVNSYA :. ... : . : : :.. :..: .::. : :.:: .::. ..:: mKIAA4 DCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMARRPDGEGCVDENECRTKPGICENG-RCVNIIGSYR 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA0 CLCVEGYSGQLCEIPPAPRSSCEGTECQNGAN--CVDQGSRPVCQCLPGFGGPECEKLLS : : ::. .:: :::: .. . : . . .:: . : mKIAA4 CECNEGF-----------QSSSSGTECLDNRQGLCFAEVLQTMCQMASS----------S 1680 1690 1700 1710 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA0 VNFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDP :.: . . ..: . : : :. : .:. . : mKIAA4 RNLVTK-SECCCDGGRGWGH-----QCELCPLPGTAQYKKICPHGPGYATDGR---DIDE 1720 1730 1740 1750 1760 1260 1270 1280 1290 1300 mKIAA0 GSYPSSAIYSAETIND-GQFHTVELVTFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGK-----HYTLNS . : ... .: :.:. : . . .:.: . . .:. .. .. .. mKIAA4 CKVMPSLCTNGQCVNTMGSFRCFCKVGY----TTDISGTACVDLDECSQSPKPCNFICKN 1770 1780 1790 1800 1810 1310 1320 1330 1340 1350 1360 mKIAA0 EAPLYVGGMPVD-VNSAAFRLWQILN--GTSFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPG : . : : . . . :. :. :.: .. : : :: . :: . mKIAA4 TEGSYQCSCPRGYVLQEDGKTCKDLDECQTKQHNC--QFLCVNTLGGFT-CKCPPGFTQH 1820 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DALSALSHLQLYHNPFHCSCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRL-- 210 220 230 240 250 260 750 760 770 780 790 mKIAA0 PDFRCEEGQEEVGCLPRPQCPQE--CACLDTVVRCSNKHLQALPKGIPKNVTELYLDGNQ : . : . ... : :. : : : ...: .. : :. .: . :. mKIAA1 PALPCAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCVA---EGHPT--PRLQWQLQIPGGT 270 280 290 300 310 320 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 FTLVPGQLSTFKYLQLVDLSNNKISSLSNSSFTNMSQLTTLILSYNALQCIPPLAFQGLR .::: :: mKIAA1 VVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGS 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 642 init1: 226 opt: 337 Z-score: 295.8 bits: 66.2 E(): 2.5e-11 Smith-Waterman score: 369; 26.442% identity (33.233% ungapped) in 416 aa overlap (148-553:45-385) 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 LMENQIGAVERGAFDDMKELERLRLNRNQLQVLPELLFQNNQALSRLDLSENFLQAVPRK :. : . .:: .:.. .. :. :: mKIAA1 GPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQ-FSKVICVRKNLREVPDG 20 30 40 50 60 70 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 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