FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1232.ptfa, 950 aa vs ./tmplib.26680 library 1768067 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5544+/-0.00698; mu= 0.1815+/- 0.461 mean_var=255.7053+/-62.070, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0802 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 1052 135 2.2e-32 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 258 44 0.00021 mKIAA0583 ( 582 res) mbh04636 ( 582) 238 41 0.0005 mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252) 243 42 0.00057 mKIAA1095 ( 1052 res) mfj25249 (1052) 222 40 0.0027 mKIAA4223 ( 1076 res) mbg07317 (1076) 206 38 0.0099 >>mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 (562 aa) initn: 1832 init1: 1051 opt: 1052 Z-score: 673.9 bits: 135.3 E(): 2.2e-32 Smith-Waterman score: 1821; 69.608% identity (75.532% ungapped) in 408 aa overlap (234-639:165-542) 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 PVPGKSTPKLNGSGPGWWPECTCTNRDWYEQASPAPLLVNPEALEPSLSVNGSDGMFKYE .:.: :.::: ..:: :::.:. ..:: mKIAA4 GPELVHVSEKNLSEIENVHGFVSHSHISPIKANPPPVLVNTDSLETPTYVNGTDADYEYE 140 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 EIVLERGNSGLGFSIAGGIDNPHVPDDPGIFITKIIPGGAAAMDGRLGVNDCVLRVNEVD ::.::::::::::::::: ::::. :: .::::::: :::::.:::: ::::.:::::.: mKIAA4 EITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDSSIFITKIITGGAAAQDGRLRVNDCILRVNEAD 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 VSEVVHSRAVEALKEAGPVVRLVVRRRQPPPETIMEVNLLKGPKGLGFSIAGGIGNQHIP : .:.::.::::::::: .::: :.::.: : :::..:.:::::::::::::.:::::: mKIAA4 VRDVTHSKAVEALKEAGSIVRLYVKRRKPASEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIP 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 GDNSIYITKIIEGGAAQKDGRLQIGDRLLAVNNTNLQDVRHEEAVASLKNTSDMVYLKVA ::::::.:::::::::.:::.:::::.:::::.. :..: :::::..::::::.:::::: mKIAA4 GDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNSVCLEEVTHEEAVTALKNTSDFVYLKVA 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 KPGSIHLNDMYAPPDYASTFTALADNHISHNSSLGYLGAVESKVTYPAPPQVP--PTRYS :: .: . .:::.: .: :: :.: :.::: mKIAA4 KP---------------TTSSQSVDNHVSPSSCLG---------------QTPTSPARYS 380 390 400 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 PIPRHMLAEEDFTREPRKIILHKGSTGLGFNIVGGEDGEGIFVSFILAGGPADLSGELRR :: . .:.....::::::..::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::. mKIAA4 PISKAVLGDDEITREPRKVVLHRGSTGLGFNIVGGEDGEGIFISFILAGGPADLSGELRK 410 420 430 440 450 460 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 GDRILSVNGVNLRNATHEQAAAALKRAGQSVTIVAQYRPEEYSRFESKIHDLREQMMNSS ::::.:::.:.:: :.::::::::: :::.::::::::::::::::.::::::::::::: mKIAA4 GDRIISVNSVDLRAASHEQAAAALKNAGQAVTIVAQYRPEEYSRFEAKIHDLREQMMNSS 470 480 490 500 510 520 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 MSSGSGSLRTSEKRSLYVRALFDYDRTRDSCLPSQGLSFSYGDILHVINASDDEWWQARL .::::::::::.:::::: mKIAA4 VSSGSGSLRTSQKRSLYVSLEPSLIMTRLRTAGFPVKD 530 540 550 560 >>mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694 aa) initn: 542 init1: 183 opt: 258 Z-score: 171.5 bits: 43.9 E(): 0.00021 Smith-Waterman score: 520; 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