FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1110.ptfa, 911 aa vs ./tmplib.26680 library 1768106 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0656+/-0.00849; mu= -23.2064+/- 0.560 mean_var=468.9607+/-113.811, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0592 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0763 ( 530 res) mbp04234 ( 530) 1334 129 1.9e-30 mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 ( 646) 1122 111 6.4e-25 mKIAA4240 ( 416 res) mia02001 ( 416) 531 60 7.2e-10 mKIAA4241 ( 453 res) mfj17221 ( 453) 528 60 9.2e-10 mFLJ00017 ( 408 res) msh09230 ( 408) 487 56 9.6e-09 mKIAA0248 ( 1803 res) mbg12530 (1803) 434 52 7e-07 mKIAA2011 ( 771 res) mfj31262 ( 771) 318 42 0.00035 >>mKIAA0763 ( 530 res) mbp04234 (530 aa) initn: 1789 init1: 1279 opt: 1334 Z-score: 638.9 bits: 128.7 E(): 1.9e-30 Smith-Waterman score: 1804; 57.198% identity (59.635% ungapped) in 514 aa overlap (300-801:24-528) 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 RAQSAQEPAVAQAVVEEAVATEAEEEEEGAKQAGKGAEAEGGDNSEQLSSSSASTKSAKS .:. . .. ::: ....:.: :. . . mKIAA0 EPELRPRPPRPLESHLAINGSANRQSKSESDYSDGDN-DSINSTSNSNDTINC 10 20 30 40 50 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 SSEASAAASKEALQAVILSLPRYHCENPASCRSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLFNINPDKG :::.: :...:. :: :: :. : ::..:.:..::: ::::::::: .:.:: mKIAA0 SSESS---SRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKG 60 70 80 90 100 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 IQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEMDFSNM ::.:: :::.::::.::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::: : mKIAA0 IQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSAM 110 120 130 140 150 160 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 ELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAFAIILL ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::.::.::::::::::::::: mKIAA0 ELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILL 170 180 190 200 210 220 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 NTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNEDHVTYV ::::::::.::.::: ::::..:::::::: ::::: ..::::::...:::.:::::. : mKIAA0 NTDMYSPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPRETLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQV 230 240 250 260 270 280 570 580 590 600 610 mKIAA1 TKVEKSIVGMKT----------VLSMPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFN :::: ::: : :::.::::::: :::.: : :: :: . ::::.:::: mKIAA0 QKVEKLIVGKKPIGSLHHGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFQVPDPNKPQKLGLHQREIFLFN 290 300 310 320 330 340 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 DLLVILKLCPKKKSSFTYTFCKAVGLLGMRFHLFENEYYSHGITLATPLSGSEKKQVLHF ::::. :. :::.: ::.: .. .: ::. ::::.:: .:: :.. . :.. : ...: mKIAA0 DLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINF 350 360 370 380 390 400 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 CALGSDEMQKFVEDLKESIAEVTELEQIRIEWELEKQQGTKTLSVRSAGAQGDPQSKQ-G : . .. .::..::.::.::: :.:. ::: :::::.:. :: . .: . .:. : mKIAA0 NAPNPQDRKKFTDDLRESVAEVQEMEKHRIESELEKQKGV----VRPSMSQCSSLKKESG 410 420 430 440 450 460 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 SPTAKREAMAGEKAA-ESSGEVSIHNRLQTSQHSPKLGVERGAPAPSPPTSPPPLPPDPQ . : .: . :. :. . .. . :. ... : : . .: . . :. : :: mKIAA0 NGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFQP-PQ 470 480 490 500 510 520 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 PSPLREQPPPLPLPPPTPPGTLVQCQQIVKVIVLDKPCLARMEPLLSQALSCYASSSSDS : : mKIAA0 PPVLCS 530 >>mKIAA0522 ( 646 res) mbp09103 (646 aa) initn: 1261 init1: 1079 opt: 1122 Z-score: 539.8 bits: 110.6 E(): 6.4e-25 Smith-Waterman score: 1155; 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