FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1070.ptfa, 846 aa vs ./tmplib.26680 library 1768171 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3193+/- 0.005; mu= 15.0992+/- 0.337 mean_var=112.2129+/-25.597, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1211 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1366 ( 884 res) mpm06033 ( 884) 2150 387 5.3e-108 mKIAA1480 ( 876 res) mbg07853 ( 876) 2091 377 6.7e-105 >>mKIAA1366 ( 884 res) mpm06033 (884 aa) initn: 3556 init1: 1905 opt: 2150 Z-score: 2031.3 bits: 387.0 E(): 5.3e-108 Smith-Waterman score: 3574; 62.702% identity (67.203% ungapped) in 866 aa overlap (12-846:46-884) 10 20 30 mKIAA1 CGTMALPRCMWPNYVWRAMMACVV-----HRGSGAPLTLCL : .: . :.: .::.:.: mKIAA1 LLPPGARGASLPLPPFSLSEGGVRGGRGGPPISMW-LLALCLVGLAGAQRGGGGPGGGAP 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 LGCLLQTFHVLSQKLDDVDPLVTTNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGEH : : . ... :.:.: .:..::...::::::::::.::::::::.:: : . mKIAA1 GGPGLGLGSLGEERF----PVVNTAYGRVRGVRRELNNEILGPVVQFLGVPYATPPLGAR 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 RFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDC :::::: :. : .:::: . :.::::. : :: .:::::::.::.....:::.::::: mKIAA1 RFQPPEAPASWPGVRNATTLPPACPQNL-HGALPAIMLPVWFTDNLEAAATYVQNQSEDC 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 LYLNIYVPTEDGPLTKKHTDDLGDNDGAEDEDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYD ::::.::::::::::::. :. : : :::::: ::::...:::::::::::..: mKIAA1 LYLNLYVPTEDGPLTKKR-DEATLNP--PDTDIRDSG-KKPVMLFLHGGSYMEGTGNMFD 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 GSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPL :::::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::: :::::: ::::. ::::: mKIAA1 GSVLAAYGNVIVATLNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWLSENIAHFGGDPE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 RITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYA :::.::::::.:::::: :::.::: :::.::::::::.:::.:..:: ::. mKIAA1 RITIFGSGAGASCVNLLILSHHSEG---------LFQKAIAQSGTAISSWSVNYQPLKYT 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RILATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDVQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILM :.::.::::. :..: ::::..: .:::::::::::::::::::.::::.::::.::: mKIAA1 RLLAAKVGCDREDSTEAVECLRRKSSRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPEILM 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 EQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGVSASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLR .::::::::...::::::::::::. ..:.:::::: :::.::::::::::::::::::: mKIAA1 QQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVEDSAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKDVLR 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQ ::::::::::::: : : :::::::::::::::::::::: ::... ::.:::.:::::: mKIAA1 ETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLALFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYHHCQ 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 TDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPN .. : :::::::::.:::.:.::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA1 AEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMVGATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPN 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 QPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHL ::::::::::::::::::::.:.....:.. ::::::::::...:::::: .:::::::: mKIAA1 QPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKFNSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELVPHL 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 mKIAA1 HNLNDISQYTSTTTKVPSTDITLRP---------TRKNSTPVTSAFPTAKQDDPKQQPSP :::. .. .:::..: : ::. :.: : . : . . mKIAA1 HNLH--TELFTTTTRLPPYATRWPPRTPGPGTSGTRRPPPPATLP-PESDIDLGPRAYDR 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 FSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTH : :.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.. :: :: . . . mKIAA1 FPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNILAFAALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVPG 720 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 mKIAA1 A------------PEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDD . ::::..:::.:. . : :. :: :::::::::.::.::: mKIAA1 GGPLLPTAGRELPPEEELVSLQLKRGG----GVGADPAEA-LRPACPPDYTLALRRAPDD 780 790 800 810 820 800 810 820 830 840 mKIAA1 IPLMTPNTITMIPNTI-PGIQP----LHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV .::..:...:..:. . : : :: :. : .. : . :: :::::: mKIAA1 VPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSLHPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHSTTRV 830 840 850 860 870 880 >>mKIAA1480 ( 876 res) mbg07853 (876 aa) initn: 3777 init1: 2029 opt: 2091 Z-score: 1975.7 bits: 376.6 E(): 6.7e-105 Smith-Waterman score: 3845; 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