FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1267.ptfa, 1036 aa vs ./tmplib.26680 library 1767981 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2602+/-0.00618; mu= 7.4411+/- 0.412 mean_var=177.4759+/-41.457, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0963 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4189 ( 953 res) mfj00047 ( 953) 655 104 1.2e-22 >>mKIAA4189 ( 953 res) mfj00047 (953 aa) initn: 938 init1: 255 opt: 655 Z-score: 498.7 bits: 103.8 E(): 1.2e-22 Smith-Waterman score: 849; 29.796% identity (36.292% ungapped) in 933 aa overlap (137-1015:104-923) 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 VLKSHPLLSQSYELRAELLGRQPVLEFSLENLRTMNTSGQTALPQAPVNGLAKKLTK-SS : . . :. . : .. :: . .:.: mKIAA4 HFASPQASKHFQTVLLMSSNSTLNKYNENYNQKKVMESNCSKLKNVLCNGSSIQLSKICP 80 90 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 THSDHDNSSSLNGGKRSLTSSSLQGGEVGGPDSGNLKGGMTNCTLPHRSLDIQHTTLYSN .::... .. . ::. .. .. : ...:. : : : .:. :.. mKIAA4 SHSENE---FIKKELSDTTSQCMKDIQI------VLDSNLTKDTNVDR-LHLQNCKWYQK 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 NSTANKSSVNSMDQPALQGSSR-LSPSTDSSSNLTNVKLEVKKSPLSSILFSALDSDTRI :. .: . ... . :: ... ..:: . .: : :: . . ..:. mKIAA4 NALLDKFTDTKIKKGLLQCTQKKIGPSHS----------DVPTS--SSAAEKEEEVNARL 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 TALLRRQADIEIRARRLQKRLQVVQAKQVERHLQHQLGGFLETTLSKLPNLE---SLRSR . .: . .::: ::.::.. ::.: .: .:. .. : . .. .. : mKIAA4 LHCVSKQKILLSQARRTQKHLQMLLAKHVVKHYGQQMKFSMKHQLPTMKIFHEPTTVLSN 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 SQLMLTR-KAEAALRKAASESATSEGLSNFLKSDSISEELERFTASGIANLRCSEQAFDS : : :. : :. . :::. . .: . :. . :..::. :. . : :...:: mKIAA4 SLLEHTEIKPEVNI--LASENKFWDDTNNGF-SQCTAAEIQRFALSATGLLSHVEEGLDS 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 DVTDSSSGGESDIEEEELTRADPEQCHVPLKRRSEWRWAADRAAIVSRWNWLQAHVSDLE :.::::: : : : : . : .. .::.: .::: . :::.::::..:.:: mKIAA4 DATDSSSDDEVD---EYTIRKN-----VAVNSSTEWKWLVDRAQVGSRWTWLQAQISELE 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 mKIAA1 YRIRQQTDIYKQIRANKGLIVLGEAPFP--------DHTTDLLSLSSEVKT---DHGRDK :.:.: :::..::::.::...: : .: . ... .::.. :.. ..... mKIAA4 YKIQQLTDIHRQIRASKGIVILEECQLPKDILKKQIQFSNQAVSLNTSVNSQVPQRSEEP 410 420 430 440 450 460 510 520 530 540 mKIAA1 LIE-----SVSQPS------ENHGILVSNITESL-------------STKSCGAPRPVNG : : : :.:. :... ...: .:: :.:::. .:: mKIAA4 LPEHDFEMSPSSPTLLLRNIEKQSAQLTEIINSLIAPLNLSPTSSPLSSKSCSHKCLANG 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 VVNSLQPVLADQVPGDSSDAEEQLH----KKQRLNLVSSSDGT-CVAARTRPVLTCKKRR . : . : :.. ..:: .: : .:.: : : : . .::::::. . .::. mKIAA4 ISRSASENL-DELSSSSSWLLNQKHSKKRRKDRTRLKSPSLAIMSTAARTRPLQSFHKRK 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 mKIAA1 LVRPSSIVPLSKKVHRNVRSGCDVNPSCALCGSGSVNTMPP-EIHYEAPLL-ERLSQLDS : : : : . ... : : .:: . : .. :: :..:.::: mKIAA4 LYRLS---PTFYWTPETLPSKEAFLSSTQTPYTGSPFSWDNWEQSSRSHLLREQVSKLDS 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 CVHPVLAFPDDVPTSLHFQSMLKSQWQNKPFDKIKPTKKFSL-KHRATMPCSLSDPVRKD ::::..:...: :::....: : : : ... . : .: : . mKIAA4 SFHPVLSLPSEIPLHLHFETLFK-----------KTDMKGELAENQFVGDCLISPPPAGE 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 RHKLVNSFLTTAMLKHHTDMSSPSYLTATHHPPHSPLVRQLSTSSDTSTPTSSGSQVAAS : . : :. . .. .: .:: : . ...: :..:.:. . mKIAA4 RTR----FEEFAFQR--SEPGSHCNFTA---------VSNANVTSRTQNPSSQ------N 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 TSQPVRRRRGESSFDINNIVIPMSVAATTRVEKLQYKEILTPSWREVDVQSLKGSPDEEN ::. :: :.:::.::.:::::::..: ...::::::::::: ::.: .: : ::.: mKIAA4 TSR--RRLRSESSYDIDNIVIPMSLVAPAKLEKLQYKEILTPRWRKVVLQPL----DEHN 730 740 750 760 770 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 ---EEIEDLSDAAFAALHAKCEEMERARW-LWTTSVPPQRRGSRSY-RSSDGRTTPQLGS :::::::: .:. : : :: :.::: :: : .::..:.: .. .:. mKIAA4 LNKEEIEDLSDDVFSLRHRKYEEREQARWSLWEQS-KWHRRNNRAYSKNVEGQDL----- 780 790 800 810 820 830 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 ANPSTPQPASPDVSSSHSLSEFSHGQSPRSPISPELHSAPLTPVARDSLRHLASEDTRCS : . :: ::.. .:. . :: . . :.::: . .: mKIAA4 ------------VLKEHS-SELGSAQQGTAESPFELAAESHSLCAQDSL---SLND---- 840 850 860 870 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 TPELGLDEQSVQPWERRTFPLAYSPQAECEEQLDAQDTAARCTRRTSGSKTGREAEVAPT : ...:.. ::::.::: : : . .: .:.:..:. . :: . mKIAA4 ----GQEDKSLR-WERRAFPLKDEDTAALLCQDERKD-------QTGGASTAFHDEVFCS 880 890 900 910 920 1020 1030 mKIAA1 SPPVVPLKSRHLAATVTAQRPAHR . : mKIAA4 TTPESGHPPKMQLDGMEEYKSFGIGVTNVKRNR 930 940 950 1036 residues in 1 query sequences 1767981 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:39:39 2006 done: Mon Mar 27 10:39:40 2006 Scan time: 1.070 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]