FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0938.ptfa, 1381 aa vs ./tmplib.26680 library 1767636 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2161+/-0.0078; mu= -8.4266+/- 0.516 mean_var=314.5515+/-75.944, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.0723 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1151 ( 1906 res) mbf00011 (1906) 1864 209 5e-54 >>mKIAA1151 ( 1906 res) mbf00011 (1906 aa) initn: 2662 init1: 1125 opt: 1864 Z-score: 1062.2 bits: 209.5 E(): 5e-54 Smith-Waterman score: 3377; 43.601% identity (49.442% ungapped) in 1422 aa overlap (1-1381:612-1906) 10 20 mKIAA0 KASLSVSQTGSWRRGMSAQGG--TPATARQ : .:... :: ..: . . .: : mKIAA1 SGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDASKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPIT--- 590 600 610 620 630 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 KTSTSALKTPGKTDDAKASEKGKTPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKPPSGIGRSTASS .:. ::::. :: . .::..::: .:...:::: ::::.. ...:::::::.: ..:. mKIAA1 HTAQSALKVAGKPE-GKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSG 640 650 660 670 680 690 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 SFGYKKPSGVGASTMITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDV ::::::: . ... . ..:. ::::.:: ::..: : ::::::: :.. . mKIAA1 SFGYKKPPPATGTATVMQTGS-----SATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSVEPG 700 710 720 730 740 750 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 VLHVSSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSID-SNVSSKSAGATTSKLREPT : ......::::::::.:::. .. :::: : .:::: : .:.:..: : :.:.::. mKIAA1 FLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGRGGPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPS 760 770 780 790 800 810 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 KIGSGRSSPVTVNQTDKEKEKV---AVS-DSESVSLS--GSPKSSPTSASACGTQGLRQP :..::::.:. :::::.::::. ::. ::...::. :::.:.: . :. . : mKIAA1 KVASGRSTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKN------QASHPP 820 830 840 850 860 270 280 290 300 310 mKIAA0 GSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASAPNTEGAKSSSVVLSPSTS---LARQGSLESPSS ..: .. .: ::. : : : . ..:.:. : ::.: .. .:..::: mKIAA1 ATKLAELPPTPLRAT--AKSFVKPPSLANLDKVNSNSLDL-PSSSDTHASKVPDLHAPSS 870 880 890 900 910 920 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 GTGSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANLSSS .::. :: :: .: ::: . ...:... . .: :. mKIAA1 STGG------------PL---PSCFTP-----------SPAPILNINSASFSQGLELMSG 930 940 950 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 SAGSKDTPSYQSMTSLHTSSESIDLPLSHHGSLSGL-------TTGTHEVQSLLMRTGSV . :.: : ....:: : ::...:.: ... . :. ..: : .:: mKIAA1 FSVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMSLPSAFPSSAPIPTPPTAPSEEDTEELPWSGSP 960 970 980 990 1000 1010 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 RSTLSESMQLDRNTLPKKGLRYTPSSRQANQEEGKEWLRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSA :. .: : :::::::::::: .: ::: :: .::..::: .. .:. : :: : mKIAA1 RAGQLDSSQRDRNTLPKKGLRYQLQS----QEETKERRHSHTAGGLPESDDQAELPSPPA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 MSSSATGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPAPSMMRSSSIPAQDSSFDLYDDAQLCGSATSLEE .: : ..: ...:.: mKIAA1 LSMSLSAKGQLTNIV--------------------------------------------- 1080 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 RPRAVSHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAEEKAHSEQIHKLRRELVASQEKVA ::: :::.::.:: ::.:::. .::::.:::::: .:::::: mKIAA1 ------------------HGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVA 1090 1100 1110 1120 1130 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 TLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQKESELIELRETIEMLKAQNSAAQA ::::::::::.::::::.:: :::.::. :. :::.:..::..:::::..:: .:: ::: mKIAA1 TLTSQLSANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 AIQGALNGPDHPPKDLRIRRQHSSESVSSINSATSHSSIGSGNDADSKKKKKKNWLRSSF .::::::. . ::.:::.::.::.:.::.:: ::::::::..:::.::::::.:::::: mKIAA1 VIQGALNASEATPKELRIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSSKDADAKKKKKKSWLRSSF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 740 750 760 770 780 mKIAA0 KQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELT--DSSLPASPKLPHNAGESGSSSMKPSQSASAICECT ..::. ::. : ::.:::::.. ::: :.:::: :.. :..: :.: : :.:. : : mKIAA1 NKAFSIKKGPKSASSYSDIEEIATPDSSAPSSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVGTEVT 1260 1270 1280 1290 1300 1310 790 800 810 820 830 mKIAA0 EA-------------------EAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREA :. : . . .:.::: :::.::::::::::.:::.:::.::. mKIAA1 ETPAHSVPHTRLFQANEEEEPEKKEVSELRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRET 1320 1330 1340 1350 1360 1370 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 MNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPARPPSDSSSTASSSSSRQSLGLSLNNLNITES :. :: :...:::::::::. : .. . :.. .... :: :.::::.:.. .. : mKIAA1 MHNMQLEVDLLKAENDRLKVAPGPSS--GCTPGQVPGSSALSSPRRSLGLALSH-PFSPS 1380 1390 1400 1410 1420 900 910 920 930 940 mKIAA0 VT-SDILLDDTGDATGHKDGRSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVL .: .:. : .. : :. .....: . . : :.: ...: ::::. : .: mKIAA1 LTDTDLSPMDGISTCGSKEEVTLRVVVRMPPQHIIKGDLKQQEFFLGCSKVSGKVDWKML 1430 1440 1450 1460 1470 1480 950 960 970 980 990 1000 mKIAA0 DGVIRRLFKEYVFRIDTSSSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNII : .. ..::.:. ..: .:.::::.. : .: .. . : . : ::. :: : ::: mKIAA1 DEAVFQVFKDYISKMDPASTLGLSTESIHGYSLSHVKRVLDAEPPEMPPCRR--GVNNI- 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 TVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYV .: :::..:. .::.::.::::::. :.:..::..:.:..::::::::::::.:.::::. mKIAA1 SVALKGLKEKCVDSLVFETLIPKPMMQHYISLLLKHRRLVLSGPSGTGKTYLTNRLAEYL 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 ITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGS . .:::. :. ..:::. ..: :.:: ::.:::.: . ... ..:.::.::.: ..:: mKIAA1 VERSGREVTDGIVSTFNMHQQSCKDLQLYLSNLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLSEAGS 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 LSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLR .:.. :: :.:::.:::::::: :: :. .:: :: .:: . .:..::.. :: :::: mKIAA1 ISELVNGALTCKYHKCPYIIGTTNQPVKMTPNHGLHLSFRMLTFSNNVEPANVFLVRYLR 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA0 RKLIEMEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGS :::.: . . : ...:....::.:: :.::..::: ::.:: ::: .:: ::. .: mKIAA1 RKLVESDSDVNANKEELLRVLDWVPKLWYHLHTFLEKHSTSDFLIGPCFFLSCPIGIEDF 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1250 1260 1270 1280 1290 1300 mKIAA0 RVWFMDLWNYSLVPYVLEAVREGLQMYGKRAPWEDPSKWVLDTYPWSSASLPQEGPALLQ :.::.:::: :..::. :....:....:..: :::: .:: :: :: ::. :. : . mKIAA1 RTWFIDLWNNSIIPYLQEGAKDGIKVHGQKAAWEDPVEWVRDTLPWPSAQ--QDQSKLYH 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1310 1320 1330 1340 1350 1360 mKIAA0 LRPEDVGYEACTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYPSTQSCDGDSVSHR : : .:: .. .: : : : .. ..:::: ::.:::::::: .: : : mKIAA1 LPPPSVGPHSTASPPEDRTVKDSTPNSLDSDPLMAMLLKLQEAANY--IESPD------R 1850 1860 1870 1880 1890 1370 1380 mKIAA0 EDILDTSIESTL : ::: ....:: mKIAA1 ETILDPNLQATL 1900 1381 residues in 1 query sequences 1767636 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:32:21 2006 done: Mon Mar 27 10:32:22 2006 Scan time: 1.230 Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]