FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1025.ptfa, 1658 aa vs ./tmplib.26680 library 1767359 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8042+/-0.00655; mu= -3.9069+/- 0.432 mean_var=312.5176+/-75.241, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0726 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0593 ( 731 res) mbj01161 ( 731) 2022 226 2e-59 >>mKIAA0593 ( 731 res) mbj01161 (731 aa) initn: 2751 init1: 1506 opt: 2022 Z-score: 1159.4 bits: 226.3 E(): 2e-59 Smith-Waterman score: 2757; 56.671% identity (59.710% ungapped) in 727 aa overlap (810-1509:12-728) 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 LQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQHVQGPLTWQQFHKMAGRGTYGSEESPEPLPIPTLLVGY .:::: :. : ..::::::::::.:.:: mKIAA0 GTDESAVVPEIHQFHKSLGQPFYETDESPEPLPIPTFLLGY 10 20 30 40 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 DKEFLTISPFSLPFWERLLLEPYGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRDLSAVYEMCR : .::..:::.::.::.:.:::::..::.::.:.::::::::.::..:::::.:.:: :: mKIAA0 DYDFLVLSPFALPYWEKLMLEPYGSQRDIAYVVLCPENEALLNGARSFFRDLTAIYESCR 50 60 70 80 90 100 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 LGQHKPICKVLRDGIMRVGKTVAQKLTEELVSEWFNQPWSSEESDNHSRLKLYAQVCRHH ::::.:: ..: ::::.:: :...::.:..:.:::.: .. ... :.:::::::::. mKIAA0 LGQHRPISRLLTDGIMKVGATASKKLSEKFVTEWFSQA-ADGNNEAFSKLKLYAQVCRYD 110 120 130 140 150 160 960 970 980 990 1000 mKIAA1 LAPYLATLQLDSGLLMPPKHQSPPAE----AQGQATPGNAG----SLPSNSGS------G :.::::. :::.:: :. .:: . : ... :::. .: : ..: : mKIAA0 LGPYLASQPLDSSLLSQPNLVAPPNQSLVTAPQMTNTGNANAPSATLASAASSTMTMTSG 170 180 190 200 210 220 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 APPAGSAFNPTSSSSANPTTSSSSASSGPPGSSAASAPGITQMNTTSSSGFGGGVGG-QN .: . :. . .:. ... ..:::: ::: ... : : . .:::........ .. :. mKIAA0 VPISTSVATANSTLTTTSSSSSSSLSSGVSSNKLPSFPPFGSMNTSGTGSMSAQASTVQS 230 240 250 260 270 280 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA1 PSAGGSSTDRTPGNVACGDTEPGQSCTQSSQDGQDSVTERERIGIPTEPDSADSHA--YP . ::.... . : : .. :: : ..:. .:...::::. .:::: :: mKIAA0 GQLGGQQSSSLQAAGISG--ESASLPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTD---GDSHAITYP 290 300 310 320 330 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA1 PAVVIYMVDPFTY-TAEEDSSSGNFWLLSLMRCYTEMLDHLPEHMRSSFILQIVPCQYML ::.:.:..::::: . .:...:.: : :.:.::. ::.. :: :..:. .:::::::.: mKIAA0 PAIVVYIIDPFTYENKDESTNSSNVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKSTVSVQIVPCQYLL 340 350 360 370 380 390 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA1 QTMK-DEHVFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSP : .: :.. .: :.:::.::::. ::::::::. ..:.::::::. ..: .::.:.:: mKIAA0 QPVKHDDRQIYSQHLKSLAFSVFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALKSPDRPEC 400 410 420 430 440 450 1250 1260 1270 1280 1290 1300 mKIAA1 IQLYSPPFILAPIKDKQTEPGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLE :.::.:::::::.:::::: :::::::.::::::::::::::::::.:::::::.::::: mKIAA0 IRLYTPPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLE 460 470 480 490 500 510 1310 1320 1330 1340 1350 1360 mKIAA1 TCVVNIALPSRSRKSKVSARKVGLQKLWEWCLGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDW ::..:: .:.:.:..: :::. :::::::::::.:::.:::::::::::::.:::::::: mKIAA0 TCIINIDVPNRARRKKGSARRFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDW 520 530 540 550 560 570 1370 1380 1390 1400 1410 1420 mKIAA1 SILLGECSLQTISKQLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVF : ::.. .::..::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:. :::: mKIAA0 SCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSVF 580 590 600 610 620 630 1430 1440 1450 1460 1470 mKIAA1 GRSTALNMQSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNED---GFSPNND-----D ::::.::::. :::::::.:::::::::::...::: :.: .:. .:.:::: mKIAA0 GRSTTLNMQTPQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTENLDLAFNPNNDGADGMG 640 650 660 670 680 690 1480 1490 1500 1510 1520 1530 mKIAA1 MFVDLPFPDDMDNDIGILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLSR .: : ::.: :: . : .::..::: :::: mKIAA0 IFDLLDTGDDLDPDI----INILPASPTASPVHSPGSHYP 700 710 720 730 1540 1550 1560 1570 1580 1590 mKIAA1 EAPEELKQQPLALGYFVSTAKAENLPQWFWSSCPQARNQCPLFLKASLHHHISVAQTDEL 1658 residues in 1 query sequences 1767359 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:34:18 2006 done: Mon Mar 27 10:34:19 2006 Scan time: 1.300 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]