# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg04856.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1327.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1327, 1415 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7909358 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1761+/-0.000198; mu= 9.8408+/- 0.011 mean_var=119.6374+/-22.725, 0's: 31 Z-trim: 76 B-trim: 105 in 1/65 Lambda= 0.117258 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148705632|gb|EDL37579.1| mCG145575 [Mus musculu (1561) 8939 1524.7 0 gi|124487265|ref|NP_001074891.1| hypothetical prot (3032) 8939 1525.0 0 gi|2384711|gb|AAB69856.1| antigen containing epito (1567) 8921 1521.7 0 gi|149047300|gb|EDL99969.1| rCG36172 [Rattus norve ( 788) 3948 680.2 1.6e-192 gi|73951831|ref|XP_536235.2| PREDICTED: similar to (3017) 3513 607.1 5.9e-170 gi|74190120|dbj|BAE37191.1| unnamed protein produc ( 412) 2731 474.0 9.3e-131 gi|109073769|ref|XP_001098928.1| 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