FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1225.ptfa, 1401 aa vs ./tmplib.26680 library 1767616 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4389+/-0.00612; mu= 6.3315+/- 0.406 mean_var=192.1024+/-47.675, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 90 in 1/35 Lambda= 0.0925 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497) 2255 315 8e-86 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 1290 186 5.3e-47 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 1241 179 2.4e-45 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 479 77 9.9e-15 mKIAA0231 ( 815 res) mbp00073 ( 815) 371 63 2.7e-10 mKIAA1016 ( 777 res) mpg00620 ( 777) 320 56 2.9e-08 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 298 53 2.3e-07 mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 ( 491) 286 51 5e-07 mKIAA0606 ( 1318 res) mbg00108 (1318) 289 52 7.5e-07 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 245 46 2.9e-05 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 210 41 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:::::.::.:::::::.:: :::.:..:.::::::::.:::.:.::::.:...:::.::: mKIAA1 NFGRLVKLRILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFSELPEVLDQIQNLRELWMD 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 GNRLTFIPGFIGSLRQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENPQDFLLSSNSLQQLPETIGSL .: : .:: ::.:..:.:::.::: :: :. :: :: .:.::::: :::::..:: : mKIAA1 NNALQVLPGSIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 KNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLRSIEELDCSFNEIEALPSSIGQLTNMRTFAADHNYLQ :..::::.:.::: .::..::.: .::.::: ::.:.:: .:: : ..::.:.:.:.: mKIAA1 KKLTTLKVDDNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPPTIGYLHSLRTLAVDENFLP 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 QLPPEIGNWKNITVLFLHCNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTA .:: :::. ::.::. :. :::: ::::.:.::.:.:.:::::::::::::::::..:.: mKIAA1 ELPREIGSCKNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQRLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAA 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 mKIAA1 MWLSDNQSKPLIPLQKETDTETQKMVLTNYMFPQQPR-TEDVMFISDNESFNPALWEEQR .:::::::: ::::: :. ::.. 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670 680 690 680 690 700 710 720 mKIAA1 ---SNQNNSNCSSPSRMS-DSVSLNTDSSQDTSL----CSPVKQTPVDSNSKVRQED--- : .. :. :: .::. :.. .. .. .:: .: :.:.. . :.. mKIAA1 SDYSPSQASSASSNTRMKVGSLQATAKDAVHNSLWGNRIAPPFPQPLDAKPLLSQREAVP 700 710 720 730 740 750 730 740 750 mKIAA1 --------------ENFNSLLQNGVNLNNS---PEEKFKIN-------DKKDFKLPEYD- . : . .: . .:. :: : ..: ..: . mKIAA1 PGNIPQRPDRLPMSDAFPDNWTDGSHYDNTGFVSEEAAGENANNNPLLSSKARSVPAHGR 760 770 780 790 800 810 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 --LNIEEQLVLIEKDID-SKATSDDSRQLDHINMNINKLVTNNIFQPEVMERSKMQDIVL : .:..: . ... : .. : : : . :. .. ::.. mKIAA1 RPLIRQERIVGVPLELEQSTHRHTPETEVPPSNPWQNWTRTPSPFEDRTAFPSKLET--- 820 830 840 850 860 870 820 830 840 850 860 mKIAA1 GTGFLSIHPKNEAEHIENGAKFPNLESINKVNGLCEDTAP--SPGRVEPQ----KASSSA : : :. . .:... .. :. : . : .: .: : : : : ::.. mKIAA1 -TPTTSPLPERK-DHMKEPTETPGPFSPG-VPWEYHDPTPNRSLGNVFSQIHCRPDSSKG 880 890 900 910 920 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 DVGISKSTEDLSP-QRSGPTGAVVKSHSITNMETGGLKIYDI------LGDDGPQPPSAA ..:::::: ::: ... .. ::.:: ....: :.:.: :.: mKIAA1 VIAISKSTERLSPLMKDIKSNKFKKSQSIDEIDVGTYKVYNIPLENYASGSDHLGSHERP 930 940 950 960 970 980 930 940 950 960 970 mKIAA1 VKIASAVDG-KNIVRSKSATLLYDQPLQVFTAASSSSELLSGTKAVFKFDSNHNPEEPDI :. . : ... ::.:. .: :. :. .. . .. : :: :..::.. ::. mKIAA1 DKFLGPEHGMSSMSRSQSVPMLDDEMLMYGSSKGPPQQKASMTKKVYQFDQSFNPQG--- 990 1000 1010 1020 1030 1040 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 IRAATVSGPQSTPHLYGPPQYNVQYSGSATVKDTLWHPKQNPQIDPVS--FPPQRLPRSE :. :.. . : .. . :: .. .:: : :. :. : .. .: mKIAA1 --AVEVKAEKRIPPPFAHNSEYVQQPSKNIAKD-LVSPRAYRGYPPMEQMFSFSQPSVNE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 SAE-NHSYAKHSANMNFSNHNNVRANTGYHLQQRLAPARHGEMWAISPNDRLVPAVTRTT .: : ..:... .: . . :.. . : : .: . :.:: :. : mKIAA1 DAMVNAQFASQGPRAGFLRRADSLASSTEMAMFR----RVSEPHELPPGDRYGRATYRGG 1110 1120 1130 1140 1150 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 IQRQSSVSSTASVNLGDPTRRTEGDYLSYRELHSM-GRTPVMSGSQR-PLSARAYSID-- .. :::.: : : : : .. ::.:.... : :. . .:: :::::.:: . mKIAA1 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ANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDA ::...: :::::.: : :.::.:: ::.: :.. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. mKIAA0 ANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDV 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 FLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSG :. ::.. : :..: :::::: :: :: ... :..::.::::.:.. .:..: : . mKIAA0 SLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPN 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 LREFWMDGNRLTFIPGFIGSLRQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENPQDFLLSSNSLQQL :::.:.: :.:. .: .:.::.:. ::::.: .: . .. :.:::.: ::.: mKIAA0 LRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPVELGGLALLTDLLLSQNLLQRL 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 PETIGSLKNVTTLKIDENQLMYLPDSIGGLRSIEELDCSFNEIEALPSSIGQLTNMRTFA :: ::.::... ::.:.:.: . ..:: ... :: . : . ::: :.:.::.. .. mKIAA0 PEGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENLLTALPHSLGKLTKLTNLN 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 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