FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1302.ptfa, 1198 aa vs ./tmplib.26680 library 1767819 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.3053+/-0.00395; mu= 25.8591+/- 0.265 mean_var=76.2093+/-17.767, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 29 in 2/34 Lambda= 0.1469 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1455 ( 1828 res) mbg00055 (1828) 5677 1214 0 mKIAA1127 ( 253 res) mbg00243 ( 253) 920 205 1.6e-53 >>mKIAA1455 ( 1828 res) mbg00055 (1828 aa) initn: 4654 init1: 3740 opt: 5677 Z-score: 6495.0 bits: 1214.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5677; 67.723% identity (68.121% ungapped) in 1199 aa overlap (1-1198:636-1828) 10 20 30 mKIAA1 TQNMYELSSPIDQELYLFDTSGKHLYTQSL ..:.::..:: :::::.:: .: : :: :: mKIAA1 LAASPDGTLYIADLGNIRIRAVSKNKPLLNSMNFYEVASPTDQELYIFDINGTHQYTVSL 610 620 630 640 650 660 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 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