FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0699.ptfa, 869 aa vs ./tmplib.26680 library 1768148 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8285+/-0.00622; mu= 3.7937+/- 0.408 mean_var=324.0685+/-77.889, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0712 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4125 ( 870 res) mfj35169 ( 870) 1340 152 2.4e-37 >>mKIAA4125 ( 870 res) mfj35169 (870 aa) initn: 3103 init1: 1138 opt: 1340 Z-score: 762.8 bits: 152.3 E(): 2.4e-37 Smith-Waterman score: 3167; 64.044% identity (67.217% ungapped) in 826 aa overlap (41-842:58-868) 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 SRPRRAATMSAPSEEEEYARLVMEAQPEWLRAEVKRLSHELAETTREKIQAAEYGLAVLE ..:..::..::.:::.::::::::::.::: mKIAA4 ICFSFSLLLCVYLRHPAMAAEEALKTVDQYKTEIERLTKELTETTHEKIQAAEYGLVVLE 30 40 50 60 70 80 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 EKHQLKLQFEELEVDYEAIRSEMEQLKEAFGQAHTNHKKVAADGESREESLIQESASKEQ :: :: :..:::..:.....:.:::.:::::. . :.::: :::.:::.:.::::::: mKIAA4 EKLTLKQQYDELEAEYDGLKQELEQLREAFGQSFSIHRKVAEDGETREETLLQESASKEA 90 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 YYVRKVLELQTELKQLRNVLTNTQSENERLTSVAQELKEINQNVEIQRGRLRDDIKEYKF ::. :.::.:.:::: : :.::.:.:::::..:.::::: :. ::.:: :..:.:.:::: mKIAA4 YYLNKILEMQNELKQSRAVVTNVQAENERLSAVVQELKENNEMVELQRIRMKDEIREYKF 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 REARLLQDYSELEEENISLQKQVSVLRQNQVEFEGLKHEIKRLEEETEYLNSQLEDAIRL :::::::::.:::::::.::: ::.:.:::::.:::::::::.:::: ::::::::::: mKIAA4 REARLLQDYTELEEENITLQKLVSTLKQNQVEYEGLKHEIKRFEEETVLLNSQLEDAIRL 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 KEISERQLEEALETLKTEREQKNNLRKELSHYMSINDSFYTSHLQVSLDGLKFSDDTVTA :::.:.::::::::::.:::::::::::::.:....:: :...:.:::::..: . mKIAA4 KEIAEHQLEEALETLKNEREQKNNLRKELSQYINLSDS----HISISVDGLKFAEDG--S 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 mKIAA0 EPNNDAEALVNGFEHSGLVKSSLDNKTSTPRK-DGLAPPSPSLVSDLLSELHISEIQKLK ::::: . .:: :. : : . : .: : :: ..: : ::::.:::.:::::::: mKIAA4 EPNNDDK--MNGHIHGPLGKLNGDYRTPTTRKGESLHP-----VSDLFSELNISEIQKLK 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 QQLVQMEREKVGLLATLQDTQKQLEQARGTLSEQHEKVNRLTENLSALRRLQAGKERQTS :::.:.::::. :::.::..: :::...:.:.::::.:.::::...:.: :: .:: .. mKIAA4 QQLIQVEREKAILLANLQESQTQLEHTKGALTEQHERVHRLTEHVNAMRGLQNSKEIKAE 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 LDNEKDRDSHEDGDYYEVDINGPEILACKYHVAVAEAGELREQLKALRSTHEAREAQHAE :: :: :.: :.. ::::::: ::: :::.:::.:. .:. ..:::. .. ...: mKIAA4 LDCEKGRNSAEEAHDYEVDINGLEILECKYRVAVTEVIDLKAEIKALKEKYNKSVENYTE 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 EKGRYEAEGQALTEKISLLEKASHQDRELLAHLEKELKKVSDVAGETQGSLNVAQDELVT :: .::.. : :... :::.:... : .::.::::.:.. .:.:....::.::::::: mKIAA4 EKTKYESKIQMYDEQVTNLEKTSKESGEKMAHMEKELQKMTGIANENHNTLNTAQDELVT 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 mKIAA0 FSEELANLYHHVCMCNNETPNRVMLDYYREGQ----GK-AGRTSPEG--------RGRRS ::::::.::::::.:::::::::::::::... :. : .:.: :: : mKIAA4 FSEELAQLYHHVCLCNNETPNRVMLDYYRQSRVTRSGSLKGPDDPRGLLSPRLSRRGVSS 560 570 580 590 600 610 600 610 620 630 640 mKIAA0 PVLL-----PKGLLATEVGRADGGTGDNSPSPSSSLP--SPL---SDPRREPMNIYNLIA :: : . ::... . : . :: . : ::. :: :.:::::::: : mKIAA4 PVESRTSSEPVSKENTETSKEPSPTKTPTISPVITAPPSSPVLDTSDIRKEPMNIYNLNA 620 630 640 650 660 670 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 IIRDQIKHLQAAVDRTTELSRQRIASQELGPAVDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQITT :::::::::: ::::. .::::: :..::.: .:::::::::::::::::::::::::.: mKIAA4 IIRDQIKHLQKAVDRSLQLSRQRAAARELAPMIDKDKEALMEEILKLKSLLSTKREQIAT 680 690 700 710 720 730 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 LRTVLKANKQTAEVALANLKSKYENEKAMVTETMMKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT ::.:::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 LRAVLKANKQTAEVALANLKNKYENEKAMVTETMTKLRNELKALKEDAATFSSLRAMFAT 740 750 760 770 780 790 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 RCDEYITQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNSLLRMAIQQKLALTQRLELLELDHEQTRRGRSK :::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: ::.::::.::...: mKIAA4 RCDEYVTQLDEMQRQLAAAEDEKKTLNTLLRMAIQQKLALTQRLEDLEFDHEQSRRSKGK 800 810 820 830 840 850 830 840 850 860 mKIAA0 AASKAKPASPSVSHTCACASERAEGAGLANQVFCSEKHSIYCD . :.: .::. .: : mKIAA4 LG-KSKIGSPKSGH-CPQ 860 870 869 residues in 1 query sequences 1768148 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:26:35 2006 done: Mon Mar 27 10:26:36 2006 Scan time: 0.980 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]