FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4162.ptfa, 990 aa vs ./tmplib.26680 library 1768027 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2034+/-0.00552; mu= 13.3001+/- 0.370 mean_var=153.4495+/-35.290, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1035 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0964 ( 986 res) mbg00056 ( 986) 1160 186 2.8e-47 mKIAA0008 ( 773 res) mph01047 ( 773) 264 52 4.7e-07 >>mKIAA0964 ( 986 res) mbg00056 (986 aa) initn: 2436 init1: 748 opt: 1160 Z-score: 941.2 bits: 185.6 E(): 2.8e-47 Smith-Waterman score: 2638; 45.796% identity (49.203% ungapped) in 1011 aa overlap (9-990:17-986) 10 20 30 40 50 mKIAA4 PWDCFQSAMKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADH ::::. :: .: . . . . : :..::::::.. : . mKIAA0 PQCPSRAKAPAPRARIMKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGPDRNPYLLSPTEAF-ARE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 PYYTQRNSFQAECVGPFSD--PLASSTFPRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTN . .:.. .. . :... : :::::: ::.:. :. .:: . .. ::: ::::.: mKIAA0 ARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPAN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 LLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLF-TKSHSLEGPSKG ::::::.:::. :::. :::. : .. :..:::::::::::::.:: ::. :.:: . : mKIAA0 LLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSMEG-TAG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 SVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERR--SESKARSNASNASPTSPSWWSSDDNLDGDMC .: ::..: . :.:.::::: .: : :: :: : .::::::::::. mKIAA0 KV-GGNGSKKGGLEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSR-SNIS----GWWSSDDNLDGEGG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 mKIAA4 LYHT-P-SGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNND---------IKCSTC ... : ::.::.:: .:. .:::.:::::: . .:...... .:: mKIAA0 AFRSGPASGLMTLGRQQERTQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNTTTELTAPPPPPAPPATC 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 ANLPVTLDAPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQ .: : :. .:...:: :::.:.:.:: ::.:...:....::..:.: . .::::: mKIAA0 PSLGVGTDTNYVKRGSWS-TLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPG 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 mKIAA4 --DEWSG--YTPRGKDDE----IPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDT-SPKPSPKVAARR ::: .:: :. :::::::::::::::::::: .: :::::::.:::: mKIAA0 GGGEWSTTLLSPRDMDSTAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGGSPKPSPKTAARR 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 ESYPKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPK .:: .::: :: : .. . : .. .... : . : . : :::. .. .. . mKIAA0 QSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLDSVDMLLPSKCPSW-EDDYNPISDSLNDSSCIS--Q 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 FRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLPGCFRMRSHS .. . .. .:: : ... :.:..:::. :: :: ..::::::::. :: :::: mKIAA0 VFGQASLIPQLFGHDQQVREADLSDQYEAACESACSEAESTTAEALDLPLPSYFRSRSHS 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 YVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKP :.:::. ::::... :::.: ::: .: .. . .. :::...:::::::::::::.:: mKIAA0 YLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKP 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 FISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGP :::.:.:::::::::.:.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... . :: mKIAA0 FISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGITP--GP 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 ASQHMGSNAAAVTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKF . . . ::. . : ..:.... . : . :::::.. . .. : :.. .. mKIAA0 EAPEPPPKHAALKSEQGTLT-SSESHSEAIPKRKLSSIGIQLSPSSPNRSSAPSHSMSSR 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 QSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDA ... .... ..: . . .: . ::. ::. . .: :..:. mKIAA0 RDTDSDTQDA--------NDSSCKSSERSLPDCTSHPNSI-SIDAGPRQAPKIAQIKRNL 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 mKIAA4 STSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGH : . :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::. mKIAA0 SYG-----------------DNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGY 760 770 780 790 810 820 830 840 850 860 mKIAA4 WFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCE ::::::::: .:.:::: :..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: ::: mKIAA0 WFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCE 800 810 820 830 840 850 870 880 890 900 910 920 mKIAA4 ENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRA .::::.:.::::.::::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.. mKIAA0 QNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKP 860 870 880 890 900 910 930 940 950 960 970 980 mKIAA4 PPPVPKKPAKGPAPLIRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYI ::::::::::. : . :... ... :::::::::.:::::::::::::::::.:::::. mKIAA0 PPPVPKKPAKSKAAVSRDKASDAGDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYV 920 930 940 950 960 970 990 mKIAA4 PEAQTRL ::::::: mKIAA0 PEAQTRL 980 >>mKIAA0008 ( 773 res) mph01047 (773 aa) initn: 202 init1: 202 opt: 264 Z-score: 219.1 bits: 51.7 E(): 4.7e-07 Smith-Waterman score: 273; 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