FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1306.ptfa, 1347 aa vs ./tmplib.26680 library 1767670 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.0567+/-0.0115; mu= -33.6789+/- 0.762 mean_var=828.2339+/-201.179, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0446 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1139 ( 1224 res) mpg00286 (1224) 1748 129 6.5e-30 mKIAA0229 ( 1198 res) mpf00455 (1198) 622 56 4e-08 mKIAA0957 ( 713 res) mfj01140 ( 713) 354 39 0.0042 >>mKIAA1139 ( 1224 res) mpg00286 (1224 aa) initn: 2175 init1: 1591 opt: 1748 Z-score: 629.4 bits: 128.7 E(): 6.5e-30 Smith-Waterman score: 2437; 40.125% identity (52.694% ungapped) in 1438 aa overlap (2-1347:38-1224) 10 20 30 mKIAA1 EDVGTAQRLLQRPRPGKAKLLGSTKKINVNF :: .:.:. . . .:.:::::::..:.:. mKIAA1 CFFLDLEVPEPDPVIRMGREQDLILAVKNGDVTCVQKLVAKVKAAKTKLLGSTKRLNINY 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 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