FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0343.ptfa, 1202 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767815 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7089+/-0.0049; mu= 12.6355+/- 0.329
 mean_var=117.4571+/-27.293, 0's: 0 Z-trim: 22  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1183

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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mKIAA1514  ( 1994 res)   mbf03631                  (1994)  415   83 4.3e-16
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>>mKIAA0756  ( 1251 res)   mbg20669                       (1251 aa)
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        .. .:...:.::.::::::.:: ::.:.:::.::.:.:::::.: ::: ::::.  :.:
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        ::: :.:.  ::::::.. : :. : ::: ::: :::. :.:.:: : .. :.:::: :
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       : :.:.:.:.:  :.: : :: :::  .::::..:.. . :..::::: :::::::::. 
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       .: . :: : :::. :.:::::.:..:::...                   ..  :: :.
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       :. :.:. : .  :::  : ::::: :.::: : : :. : ::.:.. ..::.:.:.::.
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       .    ...:  .  .:.::...:   :.  .: : .     :: ...    :. :.    
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          :: . ..      :  :   . : :  .:          .:....:::.: : :.: 
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       : : . ::   : ..  .. .  :.: . .. :.:.:.:.:.:. :      ..:  : :
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        :.   ... ..  :.    :.::: :::   :: :: :.   :     .:.  :. .. 
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       :. :....::: : ::.: ....: ..:.:: :   : : .  :: .: ..  ....:  
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        .:: :.  : :: .    .: : . .: :.:.:  . :...:.:::.: :..: :..  
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       ::            :.. ...   .: :.: ..:..:. :..: : :   :.::  . . 
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       .  : ..::.: :: ::.:::: ..:. .  . ..: :.    :    .:   :: .  :
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       .:.:.: ::..: : :: . ::. ::.  :. : :. .:  : : :   ..:::::. . 
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       : .:   ... .:.:. :   :... .  ...:  :: :   :  . ::..:::.. ::.
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mKIAA0 TQSSSKRNRRHIEKKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHT
        .     ....  ::: :  :..:   . .:.  . : :.:.. :. : ::.:.  .  :
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mKIAA0 PEGVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIP
        .  :: : .  : : . ... :.::                                  
mKIAA3 RKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSSTSVIETNKT
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       ::. .:.       :.:.:    .    ::. :.    .:.   :      :::.:::::
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       ::...:     :: : ...:     . .:.: . ..   .:.:.  ...::  .      
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       .::..  . .      ..: ..:::. ::   .::: :::.:: ..: .  .. :.. : 
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       ..: :.:     :. :.: : ..: : :.. :     .: : .   . :    . . ...
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mKIAA0 IIFSNVQESSSAVYQCNASNKYGYLLANAFVNVLAEPPRILTSANTLYQVIANRPALLDC
       ... .: : . . : :.:::  :  ...:.  ..  :  : .  ::   .: ..:  :.:
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       .  :     :.: ::                          :.                 
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            . :: :...   ::..                         ::::    ::  ::
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        :    .. .   :.  ..: : ..     .   : : . :.:: .::. .   .:..: 
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       ::   :.:: :: : :::..   .  . .   ..: : . :..  : :   ::.:... :
mKIAA1 WTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFN
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mKIAA1 KIGRSEPSKELT-ISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQ-NGVIRGYQI
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       ..:... :..   :.:  ...     : ...   :. : . :::.: .: .:  . . . 
mKIAA1 GYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINAT
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mKIAA1 TLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRTTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEM--
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mKIAA1 -QNVTT---TRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIK
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mKIAA0 IVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYIL------QYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRW
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mKIAA1 AVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSP--------EQLFY
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mKIAA1 LPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSLDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNT
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 initn: 294 init1: 186 opt: 430  Z-score: 396.8  bits: 85.7 E(): 5.8e-17
Smith-Waterman score: 579;  33.676% identity (36.695% ungapped) in 389 aa overlap (275-648:197-568)

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mKIAA0 GNAQAAATCEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQDADVTS----GNTVYFTCRA
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       :: : : : :..... :  .     :.    ::.: ...::: : :::.:::. : .. :
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         ::..     : : ... :::  .  ::. :: : :.:.: :.:.: : :  .:. :  
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        ::  .:  .  . ..:: .:.:. : : :::.   . :.::. : : :   .:  . . 
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        :: .. . ..::  : :.:.: : ::  :: :  :  ... ..:::.:  :: .:. : 
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       : : : : .:  :  .:: ..  .  .  . :   .:. :..:.. :  . .    :.: 
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        .....   .  .  .:: .   :.. ::. ...:  .:   .  :.:: :. .  .: :
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mKIAA0 PSEASEQYLTKAAEPDQNPMAVEGLGTEPDNLVITWKPLNGFQSNGPGLQYKVSWRQKDG
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mKIAA0 DIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTF
       .  :  :  :                                                  
mFLJ00 SELTLQWTEGNAGTTPTTGYVIEARPSDEGLWDMFAKDIPRSATSYTVDLDKLRQGVTYE
         1050      1060      1070      1080      1090      1100    

>>mKIAA0806  ( 702 res)   mfj52037                        (702 aa)
 initn: 342 init1: 109 opt: 342  Z-score: 319.4  bits: 70.4 E(): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 365;  29.110% identity (31.481% ungapped) in 292 aa overlap (280-552:149-437)

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mKIAA0 SVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSKERPPTFLTPEGNESHKEE---LRGNVLSLECIA-E
                                     :: :.  ..: :    :::  ..: : :  
mKIAA0 HSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQ-IRTHPESTIALRGVNVTLTCTAVS
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mKIAA0 GLPTPI-IYWIKEDGMLP----ANRTFYRN-------FKKTLQITHVSEADSGNYQCIAK
       .  .:.   : :.. .:      : . ::.       . ..:..  :. .: :.::::. 
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mKIAA0 NALGAVH-HTISVTVKAAPYWIVAPQNLVLSPGENGTLICRANGNPKPRISWLTNG-VPI
       : .:. . .  ..::.  : .. .:..:..  :  . : : :.:.: :.:::  .: . .
mKIAA0 NHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPTPQISWQKDGGTDF
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         : .   . .  : ..: .::.  . ..:.: :.:  : : ::: ..::  :  :    
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       .    :  .. :.:.:   ::: : ..: :      . :  .    :  : :  :  ...
mKIAA0 DKT--VTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDA
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mKIAA0 GTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTRIIKQPEYAVVQRGSKVSFECRVKHDHTLIPTIM
       : :::.  : ::  .....:..                                      
mKIAA0 GKYTCLMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTS
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>>mFLJ00376  ( 931 res)   mbg07794                        (931 aa)
 initn: 215 init1: 121 opt: 342  Z-score: 317.9  bits: 70.5 E(): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 434;  22.768% identity (25.458% ungapped) in 672 aa overlap (335-963:3-646)

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                                     :::...:. : : :.: : : .   :. . 
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mKIAA0 S---VTVK---AAPYWIVAP---QNLVLSPGENGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIA
       :   . :.   :    :. :   :..... :..  : : :.: : ::..:  .:  :  :
mFLJ00 SGDRLRVRRSTAEAARIIYPLEAQTVIVTKGQSLILECVASGIPPPRVTWAKDGSSI--A
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mKIAA0 LDDPSRKIDGDTIIFSNVQESSSAVYQCNASNKYGYLLANAFV-NVLA-EPPRILTSANT
         . .: . .. .: ....: .:..:.: :::  :   : ... :: . :::.. .  . 
mFLJ00 AYNKTRFLLSNLLI-DTTSEEDSGTYRCMASNGVGDPGAAVILYNVQVFEPPEVTVELSQ
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       :  .  .. : : :   :.: :.. :....   .  . .  :   .   . :. .:  :.
mFLJ00 LV-IPWGQSAKLTCEVRGNPPPSVLWLRNAVPLTSSQRLR-LSRRALRVVSVGPEDE-GV
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mKIAA0 YTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTRIIK-----QPEYAVV----QRGSKVSFECRVKHDH
       : :.:.: .: :.  :.:.   :   ..     .:  :.     .: :. .   : .   
mFLJ00 YQCMAENAVGSAHAVVQLRTARPDTTLRPGRDTKPIAATPPMPPSRPSRPDQMLREQPGL
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mKIAA0 TLIPTIMWLKDNGELPNDERFSTDKDHLVVSDVKDDDGGTYTCTANTTLDSASASAVLRV
       .  :: .  . . . :..:. .  .  ...:. . .   .:  .     ...: . .:  
mFLJ00 VKPPTSVQ-STSLKCPGEEQVAPAEAPIILSSPRTSKTDSYELVWRPRHEGSSRTPILYY
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mKIAA0 VDVPNPPFDLELTNQLDKSVQLTWTPGDDNNSPITKF----IIEYEDAMHDAGLWRHQAE
       : : .     ..::. : .  ..  :....   .:..    . : : : .. .   . : 
mFLJ00 V-VKHR----KVTNSSD-DWTISGIPANQHRLTLTRLDPGSLYEVEMAAYNCAGEGQTAM
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mKIAA0 VSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAENSIGRSMPSEASEQY--LTKAAEPDQNPMAVEGLG
       :  :  :..      :  . . . ... : :. : .. ..  :.    ::.  ... .  
mFLJ00 V--TFRTGRRPKPEIVASKEQQIQRDDPGASLQSSSQPDHGRLSPPEAPDRPTISTAS--
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mKIAA0 TEPDNLVITWKPLNGFQSNG--PGLQYKVSWRQKDGDDEW---TSVVVANVSKYIVSGTP
           .. .:: :    ..::  :  ...: ...     .:   ::..  .  .  ..:  
mFLJ00 --ETSVYVTWIP----RGNGGFPIQSFRVEYKKLKKVGDWILATSAIPPSRLSVEITGLE
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         . : ..:.::: .:     :: .: .: :.::.  . :...:  . ...:: :   ..
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mKIAA0 WDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYA
       :  .: ..    ..:. :::  :.:..  . .   : ..  .: .    .  ::: . : 
mFLJ00 WMYIPASNNNTPIHGFYIYYRPTDSDNDSDYK---KDMV--EGDRYWHSISHLQPETSYD
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mKIAA0 LNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPE----GVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGI
       ....  :  ::.  :.    .:      : :. :  : .. :                  
mFLJ00 IKMQCFNEGGESEFSNVMICETKARKFSGQPGRPPPLTLAPPQPPPLETMERPVGTGAMV
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mKIAA0 LTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSVGPGSQIT
                                                                   
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>>mKIAA1355  ( 1189 res)   mpm05201                       (1189 aa)
 initn: 297 init1: 122 opt: 291  Z-score: 269.5  bits: 61.9 E(): 7.2e-10
Smith-Waterman score: 509;  23.374% identity (27.390% ungapped) in 907 aa overlap (159-1002:33-869)

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mKIAA0 -IIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQ------
        .: :.  .:  ::    .. ::    :   . :     ::.  .:..   ..:      
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       . :     .:. .:. .   :   ..       .  . .: ::  :       . .::..
mKIAA1 EDQGWYECRVLFLDQHSPEQDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPPLVL-------EVKELEA
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         ..:.:.:.: : : . :  .   :  ..   .  . :: : .: ....:.: : :...
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mKIAA0 LGAVHHTISVTVKAAPYWIVAPQNLVLSPGENGTLICRANGNPKP-RISWLTNGVPIEIA
        :.. :. .. : . :  .: :.: ... ... .: :::.. :     ::. .:: .   
mKIAA1 EGSITHATQLLVLGPPVIVVPPSNSTVNSSQDVSLACRAEAYPANLTYSWFQDGVNVFHI
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mKIAA0 LDDPSRK---IDGDTIIFSNVQESSSAVYQCNASNKYGYLL---ANAFVNVLAEPPRILT
           ::    .:: .. .. .: .... : :  ::  :.:    :.:...::  : .. .
mKIAA1 SRLQSRVRILVDG-SLWLQATQPDDAGHYTCVPSN--GFLHPPSASAYLTVLY-PAQVTV
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mKIAA0 SANTLYQVIANRPALLDCAFFGSP-MPTIEWFKGTKGSALHEDIY---VLHDNGTLEIPV
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mKIAA1 MPPETPLPTGMR-GVIRCPVRANPPLLFVTWTKD--GQALQLDKFPGWSLGPEGSLIIAL
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mKIAA0 AQKDSTGTYTCVARNKLGMA--KNEVHLEIKDPTRIIKQPEYAVVQR-GSKVSFECRVKH
       ...:. : :.:.  :.:: :  .  ... .: :  .: ::.    :. : .. . : .. 
mKIAA1 GNEDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAFIDQPKEEYFQEVGRELLIPCSARG
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       :    : . : : .  : .. . ... . ::.  .  .  : . :.:....  ...:. .
mKIAA1 DPP--PIVSWAKVGRGLQGQAQVDSN-NSLVLRPLTKEAQGRWECSASNAVARVTTSTNV
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