FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0343.ptfa, 1202 aa vs ./tmplib.26680 library 1767815 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7089+/-0.0049; mu= 12.6355+/- 0.329 mean_var=117.4571+/-27.293, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1183 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0756 ( 1251 res) mbg20669 (1251) 3211 560 6.3e-160 mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 ( 898) 777 145 6.3e-35 mKIAA1132 ( 1723 res) mbg00857 (1723) 568 109 5.4e-24 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 430 86 5.8e-17 mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994) 415 83 4.3e-16 mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340) 395 80 3.5e-15 mKIAA0806 ( 702 res) mfj52037 ( 702) 342 70 1.2e-12 mFLJ00376 ( 931 res) mbg07794 ( 931) 342 70 1.5e-12 mKIAA1355 ( 1189 res) mpm05201 (1189) 291 62 7.2e-10 mKIAA4044 ( 1352 res) mpg00593 (1352) 259 56 3.5e-08 mKIAA1061 ( 696 res) mbp15027 ( 696) 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.:. : : . :.:: : : :.. .:.. mKIAA1 VTLEYRVTGLTALTTYTIEVAAMTSKGQG-QVSASTISSGVPPELPGAPTNLGISNIGPR 780 790 800 810 820 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 IGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAED mKIAA1 SVTLQFRPGYDGKTSISRWVVEAQVGVIGEGEEWLLIYQLGNEPDARSMEVPDLNPFTYY 830 840 850 860 870 880 >>mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340 aa) initn: 693 init1: 194 opt: 395 Z-score: 364.9 bits: 79.7 E(): 3.5e-15 Smith-Waterman score: 548; 26.087% identity (29.056% ungapped) in 460 aa overlap (647-1070:606-1054) 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 KDDDGGTYTCTANTTLDSASASAVLRVVDVPNPPFDLELTNQLD---KSVQLTWTPGDDN : :: .: :. : . .:..: :.::.:. mFLJ00 AYIFRLSAKTRQGWGEPLEATVITTEKRERPAPPREL-LVPQAEVTARSLRLQWVPGSDG 580 590 600 610 620 630 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 NSPITKFIIEYEDAMHDAGLWR-HQAEVSGTQTT-AQLKLSPYVNYSFRVMAENSIGRSM ::: : .. .. .: :. ... .: :. : .: :...:..:. : :.:: : mFLJ00 ASPIRYFTVQVREL--PGGEWQTYSSSISHEATACAVERLRPFTSYKLRLKATNDIGDSD 640 650 660 670 680 690 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 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