# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg04270.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0343.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
mKIAA0343, 1202 aa
vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library
2727779818 residues in 7921681 sequences
statistics sampled from 60000 to 7910193 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4132+/-0.000189; mu= 13.5553+/- 0.011
mean_var=78.8274+/-15.484, 0's: 39 Z-trim: 101 B-trim: 2852 in 1/65
Lambda= 0.144456
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(7921681)
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gi|38372441|sp|Q810U4.2|NRCAM_MOUSE RecName: Full= (1256) 4224 890.8 0
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gi|149051181|gb|EDM03354.1| rCG62174, isoform CRA_ ( 880) 4088 862.3 0
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gi|38372401|sp|P97686.2|NRCAM_RAT RecName: Full=Ne (1214) 4077 860.1 0
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gi|73981709|ref|XP_856799.1| PREDICTED: similar to (1197) 3967 837.2 0
gi|73981711|ref|XP_856837.1| PREDICTED: similar to (1205) 3967 837.2 0
gi|73981719|ref|XP_848767.1| PREDICTED: similar to (1214) 3945 832.6 0
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gi|215274127|sp|Q92823.3|NRCAM_HUMAN RecName: Full (1304) 3922 827.9 0
gi|6651380|gb|AAF22282.1|AF172277_1 NgCAM-related (1308) 3922 827.9 0
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gi|2511666|emb|CAA04507.1| NrCAM protein [Homo sap (1299) 3888 820.8 0
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gi|109018713|ref|XP_001097065.1| PREDICTED: simila (1242) 3662 773.7 0
gi|1621283|gb|AAC50765.1| hBRAVO/Nr-CAM precursor (1299) 3631 767.2 0
gi|189536334|ref|XP_001923328.1| PREDICTED: sc:d02 (1173) 3623 765.5 0
gi|109731501|gb|AAI14571.1| NRCAM protein [Homo sa (1180) 3566 753.6 1.5e-214
gi|56122350|gb|AAV74326.1| neuronal cell adhesion (1180) 3566 753.6 1.5e-214
gi|119603836|gb|EAW83430.1| neuronal cell adhesion (1084) 3561 752.6 2.9e-214
gi|168278575|dbj|BAG11167.1| neuronal cell adhesio (1180) 3560 752.4 3.6e-214
gi|56122260|gb|AAV74281.1| neuronal cell adhesion (1180) 3547 749.7 2.4e-213
>>gi|73981715|ref|XP_533088.2| PREDICTED: similar to neu (1183 aa)
initn: 6507 init1: 6507 opt: 7490 Z-score: 8427.7 bits: 1571.4 E(): 0
Smith-Waterman score: 7490; 92.749% identity (97.892% similar) in 1186 aa overlap (17-1202:1-1183)
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mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
::::::::::.:::::.:::::::::::::.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
gi|739 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGSGTLTINIMS
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::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:.:::::.::::::
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.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::.::::::::::::::::::::::.:::..:::::::::::: :::::::::::::
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::::::::::::::::::: :: :::::::::::::: .:::::::::::::::::::.:
gi|739 ECIAEGLPTPIIYWIKEDGTLPINRTFYRNFKKTLQIIQVSEADSGNYQCIAKNALGAIH
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:::.::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::: :::::
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:::::::::::::: :::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.:
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::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
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::.::::::::.:: :::::::::::::::: :::::.::::::::::: ::::::::::
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: ::..:::::::.::.:.:::::::.::::::..:::::: ::::::::::::::.:::
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:::::.::::::::::: :::::::::::.::::.::.:::: :::::::::::::::::
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::: :..:::.:::::::::::::::: :: ::::::.:::::::::::::::.::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
gi|739 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAVVMGHS
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::::::::::::::.::::::::::::::: ::.:::::::::::::.:.::::::::::
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::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::: :: :.::::::::::::::
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::::::::::::::::.:::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 VNPTLDSLTLEWDPPSRPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
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::::::::::::..: ::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::
gi|739 STRYKFYFYAQTAAGSGSQITEEAVTTVDE---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
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mKIAA0 FV
::
gi|739 FV
>>gi|81158224|ref|NP_005001.3| neuronal cell adhesion mo (1183 aa)
initn: 6506 init1: 6506 opt: 7489 Z-score: 8426.6 bits: 1571.2 E(): 0
Smith-Waterman score: 7489; 93.086% identity (97.555% similar) in 1186 aa overlap (17-1202:1-1183)
10 20 30 40 50 60
mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
::::::::::.:::: ::::::::::::::.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
gi|811 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::::::::::
gi|811 EGKAETYEGVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPP
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::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|811 IGLPPPIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
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:::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.:::::::::::
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:::::::::::::: ::::::: ::: :.::.::::: ::::::::::::::::::::.:
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::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
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:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::
gi|811 KIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANR
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::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
gi|811 PALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
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:::::::::::::::: :.:::::::::::: :::::.::::::: :..::::: :::.
gi|811 LGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPS
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::::..:::::::.::.:::.:::::.:::::::.:::::: ::::::::::::::.:::
gi|811 DERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVDVPNPPFDLELTDQLD
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:::::.::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::::
gi|811 KSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFR
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::: ::::.:.::::::::::::.:::.:: ::::::.:::::::::::::::.::::::
gi|811 VMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::
gi|811 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHS
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mKIAA0 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEVHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
::::::::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::
gi|811 GEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
mKIAA0 KKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPEGVPSAPSSLKI
::::::::.:::::::::.:.:::.::::::::::::::: :: :.::::::::::::::
gi|811 KKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKI
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
mKIAA0 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|811 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
mKIAA0 STRYKFYFYAQTSVGPGSQITEEAITTVDEGKKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
:::::::::::::.: ::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::
gi|811 STRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDE---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
mKIAA0 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|811 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
mKIAA0 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|811 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
mKIAA0 FV
::
gi|811 FV
>>gi|31874098|emb|CAD97960.1| hypothetical protein [Homo (1183 aa)
initn: 6496 init1: 6496 opt: 7479 Z-score: 8415.3 bits: 1569.1 E(): 0
Smith-Waterman score: 7479; 93.002% identity (97.470% similar) in 1186 aa overlap (17-1202:1-1183)
10 20 30 40 50 60
mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
::::::::::.:::: ::::::::::::::.:::::::::::::
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10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
gi|318 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::::::::::
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::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|318 IGLPPPIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
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:::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.:::::::::::
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:::::::::::::: ::::::: ::: :.::.::::: ::::::::::::::::::::.:
gi|318 ECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIH
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
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::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
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:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::
gi|318 KIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANR
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mKIAA0 PALLDCAFFGSPMPTIEWFKGTKGSALHEDIYVLHDNGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
gi|318 PALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
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550 560 570 580 590 600
mKIAA0 LGMAKNEVHLEIKDPTRIIKQPEYAVVQRGSKVSFECRVKHDHTLIPTIMWLKDNGELPN
:::::::::::::::: :.:::::::::::: :::::.::::::: :..::::: :::.
gi|318 LGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPS
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mKIAA0 DERFSTDKDHLVVSDVKDDDGGTYTCTANTTLDSASASAVLRVVDVPNPPFDLELTNQLD
::::..:::::::.::.:::.:::::.:::::::.:::::: ::::::::::::::.:::
gi|318 DERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVDVPNPPFDLELTDQLD
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:::::.::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::::
gi|318 KSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFR
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::: ::::.:.::::::::::::.:::.:: ::::::.:::::::::::::::.::::::
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mKIAA0 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAAVMGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::
gi|318 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHS
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mKIAA0 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEVHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
::::::::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::
gi|318 GEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
mKIAA0 KKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPEGVPSAPSSLKI
::::::::.:::::::::.: :::.::::::::::::::: :: :.::::::::::::::
gi|318 KKILTFQGSKTHGMLPGLEPLSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKI
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
mKIAA0 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::::::::
gi|318 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPTNKTRWTLKNLNF
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
mKIAA0 STRYKFYFYAQTSVGPGSQITEEAITTVDEGKKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
:::::::::::::.: ::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::
gi|318 STRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDE---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
mKIAA0 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|318 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
mKIAA0 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|318 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
mKIAA0 FV
::
gi|318 FV
>>gi|51095143|gb|EAL24386.1| neuronal cell adhesion mole (1183 aa)
initn: 6495 init1: 6495 opt: 7478 Z-score: 8414.2 bits: 1568.9 E(): 0
Smith-Waterman score: 7478; 93.002% identity (97.470% similar) in 1186 aa overlap (17-1202:1-1183)
10 20 30 40 50 60
mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
::::::::::.:::: ::::::::::::::.:::::::::::::
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10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
gi|510 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMS
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mKIAA0 EGKAETYEGVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKERLEPIVLQNGQSLVLPCRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::::::::::
gi|510 EGKAETYEGVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
mKIAA0 IGLPPAIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|510 IGLPPPIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
mKIAA0 KQPISLKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSKERPPTFLTPEGNESHKEELRGNVLSL
:::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.:::::::::::
gi|510 KQPISVKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
mKIAA0 ECIAEGLPTPIIYWIKEDGMLPANRTFYRNFKKTLQITHVSEADSGNYQCIAKNALGAVH
:::::::::::::: ::::::: ::: :.::.::::: ::::::::::::::::::::.:
gi|510 ECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIH
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::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
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:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::
gi|510 KIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANR
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::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
gi|510 PALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
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mKIAA0 LGMAKNEVHLEIKDPTRIIKQPEYAVVQRGSKVSFECRVKHDHTLIPTIMWLKDNGELPN
:::::::::::::: : :.:::::::::::: :::::.::::::: :..::::: :::.
gi|510 LGMAKNEVHLEIKDATWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPS
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::::..:::::::.::.:::.:::::.:::::::.:::::: ::::::::::::::.:::
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:::::.::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::::
gi|510 KSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFR
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::: ::::.:.::::::::::::.:::.:: ::::::.:::::::::::::::.::::::
gi|510 VMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGL
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mKIAA0 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAAVMGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::
gi|510 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHS
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mKIAA0 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEVHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
::::::::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::
gi|510 GEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
mKIAA0 KKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPEGVPSAPSSLKI
::::::::.:::::::::.:.:::.::::::::::::::: :: :.::::::::::::::
gi|510 KKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKI
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
mKIAA0 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|510 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
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mKIAA0 STRYKFYFYAQTSVGPGSQITEEAITTVDEGKKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
:::::::::::::.: ::::::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::
gi|510 STRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDE---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
mKIAA0 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|510 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
mKIAA0 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|510 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
mKIAA0 FV
::
gi|510 FV
>>gi|76615098|ref|XP_881363.1| PREDICTED: neuronal cell (1183 aa)
initn: 6454 init1: 6454 opt: 7437 Z-score: 8368.0 bits: 1560.4 E(): 0
Smith-Waterman score: 7437; 92.074% identity (97.639% similar) in 1186 aa overlap (17-1202:1-1183)
10 20 30 40 50 60
mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
::::::::::.:::: .::.::::::::::.:::::::::::::
gi|766 MQLKIMPKKKRLSAGRAPLMLFLCQMISALEVPLDLVQPPTITQ
10 20 30 40
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mKIAA0 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGSGTLVINIMS
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::
gi|766 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPSPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGSGTLTINIMS
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::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::.::::.:.::::::::::::
gi|766 EGKAETYEGVYQCTARNERGAAISNNIVIRPSRSPLWTKEKLEPIILRNGQSLVLPCRPP
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mKIAA0 IGLPPAIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|766 IGLPPPIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
mKIAA0 KQPISLKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSKERPPTFLTPEGNESHKEELRGNVLSL
:::::.:::::::::::::::::::::::::: ..::::::::.:: :.:::::::::::
gi|766 KQPISVKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSHRQRPPTFLTPDGNTSRKEELRGNVLSL
230 240 250 260 270 280
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mKIAA0 ECIAEGLPTPIIYWIKEDGMLPANRTFYRNFKKTLQITHVSEADSGNYQCIAKNALGAVH
::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::..:.:::::::::::::::::.:
gi|766 ECIAEGLPTPIIYWIKEDGTLPINRTFYRNFKKTLQIVQVTEADSGNYQCIAKNALGAIH
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::::::::::::::.::::::::: :.::::::::::::::::::.:::::::: :::::
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::::::::::::.::::::::.:::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::
gi|766 PALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALREDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
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::::::.:::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::.:::::.:::::
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mKIAA0 DERFSTDKDHLVVSDVKDDDGGTYTCTANTTLDSASASAVLRVVDVPNPPFDLELTNQLD
: ::..:::.:::.::.:::::::::.::::::..:::::: ::::::::::::::.:::
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.::::.:::::::::::::::::::::::. :::.::.:: :::::::::::::::::::
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:::::..:::.::::::::::::::::.:: ::::::.:::::::::::::::.::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
gi|766 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDAGFAPEPAAVMGHS
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::::::::::::::.::::::::::::::: ::.:::::::::::::.::: :::::::
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::::::::.:::::::::.:.:::.::::::::::::::: :. :.::::::::::::::
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::::::::::::.:::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::: ::::::
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::::::::::::..: : :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::
gi|766 FV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
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::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::.:::: ..: .: :....:::.:::::::::::: :.:::::::::::
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:::::::::::::: ::::::: ::: :.::.::::: ::::::::::::::::::::.:
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::::: ::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
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:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::::::: :::::::::::
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::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::: :::::::::::::: :::::.::::.:: :..::::: :::.
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::::..::::::..::.:.:.:::::.:::::::.:::::: ::::::::::::::.:::
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:::::.::::::::::::::::::::.::. :::.::.::::::::::::::::::::::
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::: ::::.:.::::::::::::.:::.:: ::::::.:::::::::::::::.::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
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::::::::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::
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::::::::.:::::::::.:.:::.::::::::::::::: :: :.::::::::::::::
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:::::::::::: :::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::.: ::::::::.::.:: :::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
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mKIAA0 FV
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gi|109 FV
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::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: :.. .:::::::::::
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.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::.:: :.:::::::.:::::.::::::: :::: .::::: ::::::: :::::
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:::::::::: : : :::: :: :::::.::::::.: ::::::::.:.: :.:.:: :.
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::::::::::::::.::.::::::::.::::::::::::: :::: ::::::.: :::::
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:::::::.::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::: .. ::::..:
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::.:::::::::.::::::::::::.:.:. ::.:::::::::::::::. :::::.:::
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::::::.::::.:::::::::::: .::::..::::: :::: ::: :. :::: :::::
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: ::: :.::::. ...:.: .::::.:::.:: .::::.::::: ::::::::::. :.
gi|126 DGRFSIDNDHLVIMNISDEDDATYTCVANTSLDIVSASAMLRVVDRPNPPFDLELTSFLE
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.::::.: ::..::::::.::::::::.:. :.:.::..: : ::::.:::::::.::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::. ..:::
gi|126 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLVKVQALNNVGFAPEPGIIIGHS
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mKIAA0 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEVHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
:::::::::.::::.:::::::::::.::::::.::::.::::::::...::::::::.:
gi|126 GEDLPMVAPSNVRVNVVNSTLAEVHWEPVPPKSIRGHLKGYRIYYWKVKNSSKRNRRHVE
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mKIAA0 KKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPEGVPSAPSSLKI
::::::.:.:::::::::.:.:::.:::::::::::::::.:. :.::::::.:: :::
gi|126 KKILTFNGNKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASVDQVFNTPEGVPGAPLFLKI
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::::::::::::::::::::::: : :..:::::::::::::::::::: : :.::..
gi|126 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTAYTLKFQPINSTHELGPLVDLKIPANMTSLILRNLSY
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mKIAA0 STRYKFYFYAQTSVGPGSQITEEAITTVDEGKKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
::::::::::::..: :: :::::.::::: :::::::::::::::::::::::::::
gi|126 STRYKFYFYAQTAAGTGSPITEEAVTTVDE---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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mKIAA0 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
mKIAA0 FV
::
gi|126 FV
>>gi|49117906|gb|AAH72835.1| MGC80200 protein [Xenopus l (1177 aa)
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Smith-Waterman score: 5947; 72.481% identity (89.585% similar) in 1181 aa overlap (22-1202:1-1177)
10 20 30 40 50 60
mKIAA0 EKKRKFRAWVSAGVQLMQLKIMPKKKHLSAGGVPLILFLCQMISALDVPLDLVQPPTITQ
: .:: . :.:::::.:.::.:::::.::::::.
gi|491 MQEKKSTFPKRASLVLFLCQVITALEVPLDLLQPPTITH
10 20 30
70 80 90 100 110 120
mKIAA0 QSPKDYIIDPRENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGSGTLVINIMS
::::.::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::: :.
gi|491 QSPKNYIVDPRESIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPYVTMKPNSGTLVINTMN
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130 140 150 160 170 180
mKIAA0 EGKAETYEGVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKERLEPIVLQNGQSLVLPCRPP
.....::: :::::::.::.:.:::::.: :::::::::..::::::.: ::::: ::
gi|491 GARVDAYEGEYQCTARNDRGSALSNNIVIRQSRSPLWTKEKIEPIVLQQGVPLVLPCNPP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
mKIAA0 IGLPPAIIFWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQ
:::: ::::::::::.:::..::::::::::::::: :::::. :::::::: ::::.:
gi|491 KGLPPPIIFWMDNSFQKLPQNKRVSQGLNGDLYFSNVQPEDTRDFYICYARFNLTQTIHQ
160 170 180 190 200 210
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mKIAA0 KQPISLKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSKERPPTFLTPEGNESHKEELRGNVLSL
::::::::...: ::.::::::::::::: . . :: :..: :. . :.: : :.:: :
gi|491 KQPISLKVLTMDGLNETIAANLSDTEFYGDSPAGERRPSMLFPNMTASNKTVLLGEVLLL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
mKIAA0 ECIAEGLPTPIIYWIKEDGMLPANRTFYRNFKKTLQITHVSEADSGNYQCIAKNALGAVH
:::::::::: :.: ::.. :::.:.::.::.:::.: :.:::.:.:.::..: ::..:
gi|491 ECIAEGLPTPEIHWRKESADLPAGRVFYENFNKTLRIIDVTEADAGKYKCIGRNILGTTH
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mKIAA0 HTISVTVKAAPYWIVAPQNLVLSPGENGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIALDDPSR
: :.:.::..:::: : :.::::::.:.:::::.::: : :.:: ::: ::.: : ::
gi|491 HIITVNVKSSPYWISPPTNIVLSPGEDGSLICRASGNPTPSITWLINGVSIELAPTDASR
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mKIAA0 KIDGDTIIFSNVQESSSAVYQCNASNKYGYLLANAFVNVLAEPPRILTSANTLYQVIANR
..::::::::.::....::::::.::::::::::::::::::::::.. . .:.::::
gi|491 RVDGDTIIFSKVQDGATAVYQCNVSNKYGYLLANAFVNVLAEPPRIMVLKH-VYKVIANN
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::: : ::::: : :.::::..:: :: . ::.:::::::::::::::.:.::::: :
gi|491 VALLHCPFFGSPKPEIKWFKGVHGSILHGNGYVFHDNGTLEIPVAQKDSSGNYTCVATNT
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.: .:. . :.::::: ::::::: :.:: ... :::::::: :: :...::::..:: :
gi|491 FGSVKDMIGLQIKDPTMIIKQPEYRVIQRYGSAHFECRVKHDPTLKPVVLWLKDDSELLN
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mKIAA0 DERFSTDKDHLVVSDVKDDDGGTYTCTANTTLDSASASAVLRVVDVPNPPFDLELTNQLD
::::. : ::....: . : :::::.::: ::..:::::: ::: :: :::::::.. .
gi|491 DERFKMTKGHLTIKNVTEKDEGTYTCVANTDLDTVSASAVLTVVDRPNHPFDLELTDHHE
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.::::.:.::::::::::.:.::::::::: :.:. ::.:::::::: :.:::.::::::
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:.: : :: : :::.::::.:: ::::.:: ...:.:::::::::.:.:..::.::::::
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mKIAA0 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAAVMGHS
:::::::::: ::::::..::::::::::::::: :: ::::::::.:.::.:....:.:
gi|491 QYKVSWRQKDFDDEWTSIIVANVSKYIVSGTPTFEPYEIKVQALNDIGYAPDPSVIIGYS
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mKIAA0 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEVHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIE
::::::.::.::.: :.:.:::.:.:. .: :.::::::::.::::.....:::.::.:
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mKIAA0 KKILTFQGTKTHGMLPGLQPYSHYALNVRVVNGKGEGPASTDRGFHTPEGVPSAPSSLKI
:..:.:.:.:::::::::.:.. : .:::: ::::::: :::. :.::::::::: .: :
gi|491 KHMLSFHGNKTHGMLPGLEPFKSYIVNVRVFNGKGEGPPSTDKYFETPEGVPSAPLKLDI
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mKIAA0 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYILQYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
:. :.::::: : ::.::::.::.: : .: ::.::::.: :.. ::.:.: .:.:::
gi|491 VERTIDSLTLMWKPPAHPNGVLTQYTLIFQSINATHELSPPVEITIPTNETSLVLRNLNQ
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mKIAA0 STRYKFYFYAQTSVGPGSQITEEAITTVDEGKKAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
:::::::.::.:.:::: :::.::::..:. :::::::::::::::::::::::::::
gi|491 STRYKFYLYANTAVGPGIQITQEAITALDQ---AMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLIL
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.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|491 VLLIICFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
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gi|491 FV
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::: :..:::.:::::::::::::::: :: ::::::.:::::::::::::::.::::::
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gi|739 ILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNS
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mKIAA0 FV
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gi|739 FV
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.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 KQPISLKVISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSKERPPTFLTPEGNESHKEELRGNVLSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 PALLDCAFFGSPMPTIEWFKGTKGSALHEDIYVLHDNGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNK
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:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::
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gi|149 KSVQLTWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHEAGLWRHQAEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFR
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gi|149 VMAENSIGRSVPSEASEQYLTKAAEPDQNPTAVEGLGTEPDNLVITWKPLNGFQSNGPGL
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
mKIAA0 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAAVMGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDVGFAPEPAAVMGHS
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gi|149 GEDLPMVAPGNVRVSVVNSTLAEAHWDPVPPKSVRGHLQGYRIYYWKAQSSSKRNRRHIE
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::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::
gi|149 KKILTFQGSKTHGMLPGLQPYSHYVLNVRVVNGKGEGPASADRGFHTPEGVPSAPSSLKI
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