FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4206.ptfa, 1093 aa vs ./tmplib.26680 library 1767924 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4627+/-0.00684; mu= 2.1256+/- 0.455 mean_var=267.9034+/-63.298, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0784 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1474 ( 1050 res) mfj34038 (1050) 2338 278 4e-75 mKIAA4248 ( 1059 res) mfj00143 (1059) 1347 166 2.1e-41 >>mKIAA1474 ( 1050 res) mfj34038 (1050 aa) initn: 2729 init1: 924 opt: 2338 Z-score: 1441.2 bits: 278.4 E(): 4e-75 Smith-Waterman score: 3649; 58.104% identity (64.256% ungapped) in 1055 aa overlap (88-1093:48-1050) 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 EETEIKEAQSYQNSPVSTATNQDAGYGSPFSEGSDQLAHFKSSSSREEKE--ESQCPDSV :: ::..: :.::: ..:.: : : : mKIAA1 QRRNSARPALATRTHRPLSSPAMKWTASLTSETSDRMADFESSSIKNEEETKEVQVPLED 20 30 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 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.: : ::. :: . ...::... ::..:::.:::::::.:::::: mKIAA1 KIIPAARKKPSLELELPSSPDSTGGTPKATLSDASDALQKNSNPYITPNNRYGHQNGASY 290 300 310 320 330 340 420 430 440 450 460 mKIAA4 TWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPV---- .:.:::::.::::::::::::::::.:::::::::::.:::.:: :::: .. :: mKIAA1 AWHFEARKSQILKCMECGSSHDTLQELTAHMMVTGHFIKVTNSAMKKGKPIMETPVTPTI 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 ---VEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSVASEEKKEPEKEKEKEKAPPAAGD ..::.::.:: :: : :. ..:: ::. . : .:: .:::: : : mKIAA1 TTLLDEKVQSVPLAATTFTS-PS-------NTPA-SVSPKLAVEIKKEVDKEKAVP---D 410 420 430 440 450 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 AERKIKEETEDATEKFEPTALYQYLREEDLDDSPKGGVDILKSLENTVSTAISKAQNGAP . : .:. . ::.. .. :.:: :.::..:::::.::::::::::..::.:::::.: mKIAA1 EKPKEREKPSEEEEKYDISSKYHYLTENDLEESPKGGLDILKSLENTVTSAINKAQNGTP 460 470 480 490 500 510 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 SWGGYPSIHAAYQLPGTVK-PLQSAVQSVQIQPSYASSVKSLSSTEHNALLHSPGSLTPP :::::::::::::::. .: : :. .:. ..: ...: . .: :. ..:. :.: : : mKIAA1 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