FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA4097.ptfa, 1033 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767984 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5073+/-0.00492; mu= 15.2713+/- 0.330
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 Lambda= 0.1224

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 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA0782  ( 1147 res)   mbh00053                       (1147 aa)
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       :.. ..:::. :::  .: :::. .::.:.:.:.:.:: :   .  ::. : .:. ::  
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        .. .: .:::::..  .: ...: : :   :    :. : .:. :      :. :..  
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       .::: : :::       . .: .:::::.. :..:..:: :.    :  . :. :.  .:
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        ::      : .:.  .  . : .:        : :. ..::::::... . ... .: .
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        :.::: :::::..:. .:::..:.:::  :::  :..::.::. ..:.::::..::.::
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mKIAA4 TQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPREHFVEDVTDTLKRFFRELDDP
       ::.::  . .:.: :   .  .::  :..::::::::  .: .:::: .:: :. ..:: 
mKIAA0 TQYGLGCKYIYQKDGDPLHISELLESFKKDARSVKLRAGKHQLEDVTGVLKSFLSDIDDA
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mKIAA4 VTSARLLPRWREAAELSQKNQRLEKYKEVISCLPRVNRRTLATLIGHLYRVQKCASLNQM
       . . .: : :  : . .....:  ::.  :  :: ::: :::.:: ::::::::. .:.:
mKIAA0 LLTKELYPYWVSALDTQDEKERTSKYRAFIRSLPGVNRATLAALIEHLYRVQKCSEINHM
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mKIAA4 CTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYISVFDIDSDQAAQIDLEVSLITTWKD
        ..:::..:.  .::: :.  .:: :...::..:. .:..  ::. :.:.: :.:: :::
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       .:.::::::..::..:.. ::  . ...::.. ::::::..: ...      :.:.:::.
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       .:. :::::::  :.::::.::: .: :: :: :....   . .   .   :..: . :.
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       :. .::: ..: ::.::.:  ..:   :.. :. :::: .. . :.. : :::..::.::
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       :: ::.:.  :: :  : : . . . .: .::. :::. :    . ..:. :     :.:
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        .::.::. . ...   .  .: :   .:  ::                           
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mKIAA4 YEEVGAFPELTKDTTFSSTWEWSAKSDPSLTSQRSFDQPPLSGPSPFVCTMKSLKEGEG 
                                                                   
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>>mKIAA1722  ( 1337 res)   mbg15369                       (1337 aa)
 initn: 252 init1: 169 opt: 287  Z-score: 271.5  bits: 62.2 E(): 5.6e-10
Smith-Waterman score: 287;  30.201% identity (30.405% ungapped) in 149 aa overlap (486-634:1099-1246)

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       .   :  .: .: ... :  ..  :. :. ..: :: :: ::..   .     :: ....
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       ..:.:.  :::.. .:. :....  .:.:: .:..  ..: : ..::.. : :.... : 
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>>mKIAA0167  ( 1029 res)   mfj34112                       (1029 aa)
 initn: 271 init1: 194 opt: 277  Z-score: 263.3  bits: 60.3 E(): 1.6e-09
Smith-Waterman score: 278;  30.952% identity (34.392% ungapped) in 210 aa overlap (29-220:727-933)

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            :.. :.  . . . .  .:  :.:: :  : ::..:::..:: .:.: :: ::. 
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       .:.:.:: ::   :  :.. .. ..::: ::  : .          ::.   :  .:  :
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       :.  ::  :    ..:   ::  :. :  .:.  ::   :.   ..::  :.:   : :.
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>>mKIAA1099  ( 981 res)   mfj15083                        (981 aa)
 initn: 280 init1: 202 opt: 274  Z-score: 260.7  bits: 59.8 E(): 2.2e-09
Smith-Waterman score: 277;  29.310% identity (32.903% ungapped) in 174 aa overlap (29-185:692-863)

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mKIAA4 ---------------EKVWSNPANRHCADCRASRPDWAAVNLGVVICKQCAGQHRALGSG
                      ... .  .: ::.:: .. :.::..:::...: .:.: :: ::. 
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mKIAA4 ISKVQSLKLDTSVWSNEIVQLFIVLGNDRANCFWAGALPPGEGLHPDSAPGPRGEFISRK
       .:.:.:: ::   :  :.....  .::. ::  :  .         ::.   . ..:  :
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       :.  ::  : :  .    .:::.:                                    
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>>mKIAA0041  ( 807 res)   mbg03660                        (807 aa)
 initn: 237 init1: 203 opt: 266  Z-score: 254.1  bits: 58.3 E(): 5.2e-09
Smith-Waterman score: 266;  34.400% identity (36.752% ungapped) in 125 aa overlap (46-164:427-549)

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       . : ::..:::...: .:.: ::.::  .:::.:: :::  :  :...:.  ::::  : 
mKIAA0 ADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDT--WEPELLKLMCELGNDVINR
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>>mKIAA1478  ( 644 res)   mph00522                        (644 aa)
 initn: 207 init1: 138 opt: 254  Z-score: 243.8  bits: 56.0 E(): 1.9e-08
Smith-Waterman score: 254;  29.379% identity (30.058% ungapped) in 177 aa overlap (473-647:364-538)

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mKIAA1 RDCRLVSHPECRDRCPLPCIPPLVGTPVKIGEGMLADFVSQASPMIPAIVVSCVNEIEQR
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       ::   :.:: .:   :... : :    ...: :  .   .. . . :: :.:.: .:. .
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       ::: .:.:..      .   : ..:..                                 
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]