FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0535.ptfa, 1049 aa vs ./tmplib.26680 library 1767968 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5730+/-0.00516; mu= 3.2613+/- 0.343 mean_var=142.1233+/-33.108, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1076 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1106 ( 1211 res) mbg00011 (1211) 2236 359 1.9e-99 mKIAA0835 ( 1129 res) mfj01048 (1129) 1929 312 4e-85 mKIAA0681 ( 826 res) mzz00001 ( 826) 192 42 0.00044 >>mKIAA1106 ( 1211 res) mbg00011 (1211 aa) initn: 1344 init1: 724 opt: 2236 Z-score: 1877.8 bits: 359.3 E(): 1.9e-99 Smith-Waterman score: 2663; 42.951% identity (51.779% ungapped) in 1220 aa overlap (4-1049:26-1211) 10 20 30 mKIAA0 LLEKMDAEVEDKTLHTLSKGTEVPMDSLIPEL------ :::.. :.: .: :::..::.. : :: mKIAA1 RELALGLHPAHGVTLPPSSGEKASYKMDVDSEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 mKIAA0 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:..:..:.: . . .: :: : . : : :::... ::..: mKIAA1 MNSRCFQ-LSEGDCWDLPVDYTKMKPRRVDEDEPKEITPEDLDPFQEALEERRYPGEVTI 830 840 850 860 870 880 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 PSPKPKL-HTRDLKKELITCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSVSGCPLADKTLKSLMAANSQ :::::: . .. ::.::: .::::::::...:..:..:: mKIAA1 PSPKPKYPQCKESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQ 890 900 910 920 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 ELKCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSLSGCPRARKGGIKMTPTKEEKEDSE-LRCPVIGCDG ::::::::::::::.::::::::::::::::.:.::... .::.:::.: .:::: :::: mKIAA1 ELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDG 930 940 950 960 970 980 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 QGHISGKYTSHRTASGCPLAAKRQKENPLNGAPLSWKLNKQELPHCPLPGCNGLGHVNNV ::::.:::.:::.::::::::::::.. :::. .::: : : :: :::.: :::.. mKIAA1 QGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGS 990 1000 1010 1020 1030 1040 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 FVTHRSLSGCPLNAQAIKKVKVS-EELMTIKLKATGGIDGDEEIRHLDEEIKELNESNLK :.::::::::: ..:.::.:.: :...::: .:..::..::::..:::::::::::: . mKIAA1 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