FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00128.ptfa, 1517 aa vs ./tmplib.26680 library 1767500 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0269+/-0.00727; mu= 1.5880+/- 0.483 mean_var=259.4558+/-62.208, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 143 in 1/35 Lambda= 0.0796 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00068 ( 1002 res) mbg21780 (1002) 886 116 4.6e-26 >>mFLJ00068 ( 1002 res) mbg21780 (1002 aa) initn: 868 init1: 298 opt: 886 Z-score: 560.3 bits: 115.8 E(): 4.6e-26 Smith-Waterman score: 1277; 32.339% identity (37.209% ungapped) in 1039 aa overlap (515-1493:1-963) 490 500 510 520 530 540 mFLJ00 LKPADEKEPARPEDYEPPEEEIRESEKEELTPQCTAGSTGPEWFPSEPSTQPLETVQDVK .:. . : : :: :.:: . :: . mFLJ00 SPSLWTVSLG-EWPDSDPSH---FSSQDPS 10 20 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 GDSLPEETPPVSVLDDPVVAWDLMASGFFVLTGGVDQTGRALLTITPPPPCLPEESSPSQ :.:.:. :.. : .::.:.:::. .: : : :::.: . : . .: 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