FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1028.ptfa, 546 aa vs ./tmplib.26680 library 1768471 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8848+/-0.00813; mu= -1.2131+/- 0.540 mean_var=348.3325+/-85.367, 0's: 0 Z-trim: 32 B-trim: 125 in 1/35 Lambda= 0.0687 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452) 482 62 3.9e-10 mKIAA0904 ( 1051 res) mpg00351 (1051) 468 60 8.5e-10 mKIAA0834 ( 453 res) mpg00938 ( 453) 390 52 1.1e-07 mKIAA0623 ( 1056 res) mbg01004 (1056) 269 41 0.00074 mKIAA1995 ( 1005 res) meh01075 (1005) 267 40 0.00082 mKIAA0137 ( 570 res) mia05011 ( 570) 258 39 0.0011 mKIAA4107 ( 1176 res) mfj68342 (1176) 260 40 0.0015 mKIAA1278 ( 1271 res) mfj16286 (1271) 248 39 0.0035 mKIAA0936 ( 503 res) mic27001 ( 503) 238 37 0.0039 mKIAA4207 ( 780 res) mph00550 ( 780) 237 37 0.0055 mKIAA0722 ( 1004 res) mbg09316 (1004) 233 37 0.0085 >>mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452 aa) initn: 478 init1: 210 opt: 482 Z-score: 274.2 bits: 61.9 E(): 3.9e-10 Smith-Waterman score: 646; 30.263% identity (34.673% ungapped) in 456 aa overlap (59-494:700-1117) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 LSGGGPRVPVSLWGKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDG .: : :. : .:.::::.::::: :: mKIAA1 KTAAQLHSKRRPKICGPRYGEIKEKDIDWGKRCVDKFDIIGI-IGEGTYGQVYKARDKDT 670 680 690 700 710 720 90 100 110 120 130 mKIAA1 KDEKEYALKQI----EGTGISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSD----RK--- . :::.. : :. ..: ::: .::.: : ..: .... .. : .: mKIAA1 GEM--VALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKG 730 740 750 760 770 780 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 -VWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRD .:.:.: .::: ... . ... .. .::.. :...:. : : . :::: mKIAA1 AFYLVFEYMDHDLMGLLE--------SGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRD 790 800 810 820 830 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 LKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPL-KPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARH .: .:::. . ::..:.::.:.:::..: .: .. :.:.::: :::::: .. mKIAA1 IKCSNILLNN----RGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNK---VITLWYRPPELLLGEER 840 850 860 870 880 890 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 YTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDI :: :::.:. :::..::.:..:::. :: ::. : . : : : :. mKIAA1 YTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELA---------QLELISRICGSPCPAVWPDV 900 910 920 930 940 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 RKMPEYPTL--QKDFRRTTYANSSLIKYMEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQ :.: . :. .:..:: : :. : . .. :.. .:..::.:: :.:: mKIAA1 IKLPYFNTMKPKKQYRR---------KLREEFVFIP-AAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQ 950 960 970 980 990 380 390 400 410 420 mKIAA1 ALQDPYFQE-DP--LPTLDV--FAGCQIPYPKREFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPA ::: .... .: .: ::. . :. . :.. . . : . . . . mKIAA1 ALQCEFLRDVEPSKMPPLDLPLWQDCHELWSKKRR-RQKQMGMTDDLSTIKAPRKDLSLG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 APAQQTAAPPQAPPPQQSSAQTNGTAGGATAGGGGAGAGLQHSQDPGLNQVPPNKKPRIG ..: .: . :: : ..:.:.... . . . :.. : : . .:.. mKIAA1 LDDSRTNTPQGVLPPAQLKSQSNSNVAPGEKQTDPSTPQQESSKSLGGVQPSQTIQPKVE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 PSGANSGGPVMPSDYQHSSSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSQQSTQYHSSHQTHRY ..:... mKIAA1 TDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDAMLEERENGSGHEAPLQLRPPLEPSTPGSGQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 >>mKIAA0904 ( 1051 res) mpg00351 (1051 aa) initn: 582 init1: 201 opt: 468 Z-score: 268.3 bits: 60.4 E(): 8.5e-10 Smith-Waterman score: 658; 31.683% identity (38.369% ungapped) in 505 aa overlap (59-533:293-739) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 LSGGGPRVPVSLWGKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDG .: : :. : .:.::::.::::. :: mKIAA0 ITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGI-IGEGTYGQVYKAKDKDT 270 280 290 300 310 320 90 100 110 120 130 mKIAA1 KDEKEYALKQI----EGTGISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSD----RK--- . :::.. : :. ..: ::: .::.: : .:. .... ...: .: mKIAA0 GEL--VALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLVHQSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKG 330 340 350 360 370 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 -VWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRD .:.:.: .::: ... . ... .. .::.. :...:. : : . :::: mKIAA0 AFYLVFEYMDHDLMGLLE--------SGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLDYCHKKNFLHRD 380 390 400 410 420 430 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 LKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPL-KPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARH .: .:::. . : ..:.::.:.:::.:: .: .. :.:.::: :::::: .. mKIAA0 IKCSNILLNNSG----QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNK---VITLWYRPPELLLGEER 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 YTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDI :: :::.:. :::..::.:..::: : ... . ::. : . : : : :. mKIAA0 YTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIF---QANLELA------QLELISRLCGSPCPAVWPDV 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 RKMPEYPTL--QKDFRRTTYANSSLIKYMEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQ :.: . :. .:..:: . :.: : : .. ::...::.::.:: :.:: mKIAA0 IKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFI---------P-SAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQ 540 550 560 570 580 380 390 400 410 420 mKIAA1 ALQDPYFQEDPL-----PTLDVFAGCQIPYPKRE-------FLNEDEPEEKGDKNQPQQQ .::. .... : : : . :. . :.. .. :: : :... .. mKIAA0 TLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGIVIEDPPPSKASR----KE 590 600 610 620 630 640 430 440 450 460 470 mKIAA1 NPHQQPAAPAQQTA-APPQAPPPQQSSAQTNGTAGGATAGGGGA-GAGLQHSQDPGLNQV . : :..... :::: : : . : : : : : : .: ::: mKIAA0 TTSGTTAEPVKNNSPAPPQ-PAPVK-----------AEPGPGDAVGLGDITQQ---LNQS 650 660 670 680 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 PPNKKPRIGPSGANSGGPVMPSDYQ-HSSSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSQQSTQYH . : .. . : : . . ::. .. :..... .:: :.: .::::. mKIAA0 ELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEM--QQQLEALNQSISALTEASSQQQDSES 690 700 710 720 730 740 540 mKIAA1 SSHQTHRY mKIAA0 IAPEESLKEVPSVPVVLPPAEQTTPEASNTPADMQNVLAVLLSQLMKTQEPAGNLEENTN 750 760 770 780 790 800 >>mKIAA0834 ( 453 res) mpg00938 (453 aa) initn: 481 init1: 160 opt: 390 Z-score: 230.5 bits: 52.1 E(): 1.1e-07 Smith-Waterman score: 578; 33.856% identity (37.762% ungapped) in 319 aa overlap (71-388:124-410) 50 60 70 80 90 mKIAA1 WGKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRK-DGKDEKEYALKQI :.:.:.:. :::.. : .:: ... mKIAA0 KESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNGKLVALKVIRLQ 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 EGTGISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHRAS : : ..: :: .::. ::: :.. :. .. :. . . :.:.:.. :: . . mKIAA0 EEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDII--HTKETLTLVFEYVHTDLCQYM------ 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 KANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADM .:.: : . :: .:.:.: :. :.: ..::::::: :.:. . :..:.::. mKIAA0 --DKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLI----SDTGELKLADF 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 GFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIF :.:: . : . .. :::.::: :..:::. .:. .:.:..::::.:.. . : mKIAA0 GLARAKSVPSHTYSNE---VVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAF 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 HCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPEYPTLQKDFRRTTYANSSLI ..::. :::.::: :.: : . : ....:.. : : :.:...:: mKIAA0 PG-MKDIQ-------DQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHF----KPERFTVYSSKSLR 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 KYMEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQEDPLPTLDVFAGCQIPYP . .:.. ... : .::: .: .:.... ::. ::.. : : : mKIAA0 QAW--NKLSYVNHAEDLASKLLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLP-PRLWELTDMSSIFT 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 KREFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPAAPAQQTAAPPQAPPPQQSSAQTNGTAGGATA mKIAA0 VPNVRLQPEAGESMRAFGKNNSYGKSLSNSKH 430 440 450 >>mKIAA0623 ( 1056 res) mbg01004 (1056 aa) initn: 225 init1: 127 opt: 269 Z-score: 161.6 bits: 40.6 E(): 0.00074 Smith-Waterman score: 325; 24.852% identity (30.288% ungapped) in 507 aa overlap (56-543:18-452) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 EEGLSGGGPRVPVSLWGKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCK---VGRGTYGHVYK : : : : ::: :: ::.:... :.. mKIAA0 SRFSATPAHPSALCPGGAAMEVVGD-FEY--CKRDLVGHGAFAVVFR 10 20 30 40 90 100 110 120 130 mKIAA1 ARRKDGKDEKEYALKQIEGTGISMSAC---REIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVW .:... : . : :.:.:. ..: : .:: .:.::.: :..:: : .. .:. mKIAA0 GRHRQ-KTDWEVAIKSINKKNLSKSQILLGKEIKILKELQHENIVALYDV--QELPNSVF 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 LLFDYAEH-DLWHIIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLK :...: . :: .. .:.. : .. .. .:.:: ... ::.. ..::::: mKIAA0 LVMEYCNGGDLADYLQ----AKGT-----LSEDTIRVFLHQIAAAMRILHSKGIIHRDLK 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 PANILVMGEGPERG-----RVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGA : :::. . ... :.::::.:::: ..: . .: . . : :::... . mKIAA0 PQNILLSYANRRKSNVSGIRIKIADFGFARYLHS--NTMAAT--LCGSPMYMAPEVIM-S 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 RHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWE .:: :.:.:: .. . :...: : ....: : :.: .: mKIAA0 QHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPF-------QANSP----QDLRMF----------YE 210 220 230 240 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 DIRK-MPEYPTLQKDFRRTT-YANSSLIKYMEKH-KVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRIT :. :: : :.:. : . :. .... : . : ..:. . .: . :.:. mKIAA0 KNRSLMPSIP------RETSPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFS-HPFLEQVPVKKSC 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 SEQALQDPYFQEDPLPTLDVFAGCQIPYPKREFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPAAP :.: . :..: : : . . . . :..: : : mKIAA0 -------------PVP-VPVYSG---PVPGSSCSSSPSCRFASPPSLPDMQ--HIQE--- 300 310 320 330 440 450 460 470 480 mKIAA1 AQQTAAPPQAPPPQ-QSSAQTNGTAGGATAGGGGAGAGLQH--SQDPGLNQVPPNKKPRI .. ..:: .:: : : .. .... .. . . : :.: . .. . : mKIAA0 -ENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASNSSKNSSCDTDDFVLVPHNISSDHSYDMPMGTTARRA 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 GPSGANSGGPVMPSDYQHS-SSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSQQSTQYHSSHQTHRY . :: .:. :: .. . ..:.. .. ...: :.....:. :.: .. mKIAA0 SNEFFMCGGQCQPTVSPHSETAPIPVPTQVRNYQRIEQNL-ISTASSGTNPHGSPRSAVV 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 RRSNTSPMGFLRVGSCSPVPGDTVQTGGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHP 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA1995 ( 1005 res) meh01075 (1005 aa) initn: 353 init1: 86 opt: 267 Z-score: 160.8 bits: 40.4 E(): 0.00082 Smith-Waterman score: 272; 25.352% identity (29.221% ungapped) in 355 aa overlap (31-378:45-359) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 RRTAERRAARARPSDGCWRSGAAAVEEGLSGGGPRVPVSLWGKQTMDYDFKAKLAAERER ::: : : ... . :::.:. mKIAA1 RAAASAAMSVLGEYERHCDSINSDFGSESGGGGDSGP----GPSAVPGPRAGGGAAEQEE 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 mKIAA1 VEDLFEYEGCKV-GRGTYGHVYKARRKDGKDEKEYALKQIEGTGISMS----ACREIALL .. : .: :::..:.. :: . :.. . :... : .: . : ::..: mKIAA1 LH----YIPIRVLGRGAFGEATLYRRTE--DDSLVVWKEVDLTRLSEKERRDALNEIVIL 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 RELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKS :.: :.:: . :.... . : . . . .:.. .: . . :: mKIAA1 ALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILR--------QKDKLFEEEMVVW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 LLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADL :.::.... .: .::::.: ::.. . . .:..:.:.:. .:: . .:. mKIAA1 YLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLT----KANLIKLGDYGLAKKLNSEYS-MAET 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 DPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDIKTSNPFHHD .: : .: .::: :... :. ::::.::.. :::: . : ..::.. mKIAA1 --LVGTPYYMSPELCQGVKYNFKS-DIWAVGCVIFELLTLKRTFD-------ATNPLNL- 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 QLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPE-YPTLQKDFRRTTYANSSL-IKYMEKHKVKPDSKV . . .. .. .:.. ... . . :..: .. :.. : . .. .. . . :: mKIAA1 CVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQLVHACLDQDPEQRPAADALLDLPLLRTRRREMEEKV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 FLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQEDPLPTLDVFAGCQIPYPKREFLNEDEPEEKG :: :::: : . . : mKIAA1 TLL------NAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQ 350 360 370 380 390 >>mKIAA0137 ( 570 res) mia05011 (570 aa) initn: 151 init1: 87 opt: 258 Z-score: 158.7 bits: 39.2 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 278; 28.033% identity (32.524% ungapped) in 239 aa overlap (72-290:266-491) 50 60 70 80 90 mKIAA1 GKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDGKDEKEYALK--QI .::: ...:::: : ... :.: :. mKIAA0 IRELKRINNEDNSQFKDHPTLNERYLLLHLLGRGGFSEVYKAF--DLYEQRYAAVKIHQL 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 EGT-------GISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAE-HDLWH . . . :::: . .:: :: .. : : .: .: .: : .:: mKIAA0 NKSWRDEKKENYHKHACREYRIHKELDHPRIVKLYDYFSLDTDTFCTVL-EYCEGNDLDF 300 310 320 330 340 350 160 170 180 190 200 mKIAA1 IIKFHRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANW--VLHRDLKPANILVMGEGP .: :. . .. ..:...::.....::. ..: ::::.:::.. .: mKIAA0 YLKQHKL---------MSEKEARSIVMQIVNALRYLNEIKPPIIHYDLKPGNILLV-DGT 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 ERGRVKIADMGFARLFNSPLKPLADLDPV---VVTFWYRAPE-LLLGAR--HYTKAIDIW :..::.:.:....... . .: . . :.:: :: ...: . . .. .:.: mKIAA0 ACGEIKITDFGLSKIMDDDSYGVDGMDLTSQGAGTYWYLPPECFVVGKEPPKISNKVDVW 410 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 AIGCIFAE-LLTSEPIFHCR-QEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPEY ..: :: . : .:. : . :.:: : mKIAA0 SVGVIFFQCLYGRKPFGHNQSQQDILQENTILKATEVQFPVKPVVSSEAKAFIRRCLAYR 470 480 490 500 510 520 >>mKIAA4107 ( 1176 res) mfj68342 (1176 aa) initn: 274 init1: 115 opt: 260 Z-score: 156.3 bits: 39.8 E(): 0.0015 Smith-Waterman score: 316; 23.381% identity (29.680% ungapped) in 556 aa overlap (72-541:212-735) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDGKDEKEYALKQIEG .::::.:.: : .. : .: :.: ... mKIAA4 NSGSNSEGDYQLVQHEVLCSMTNTYEVLEFLGRGTFGQVVKCWKR-GTNEI-VAIKILKN 190 200 210 220 230 110 120 130 140 150 mKIAA1 -TGISMSACREIALLRELKHP-----NVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEHDLWHIIKF . . .. :...: .:. : . . : .:... :.:.. :..:. ..: mKIAA4 HPSYARQGQIEVSILARLSTESADDYNFVRAYECF-QHKNHTC-LVFEMLEQNLYDFLKQ 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 HRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVK .. : : :: .... .: :. .. :.. ..: :::: ::... . . ::: mKIAA4 NKFS-----P--LPLKYIRPVLQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPSRQPYRVK 300 310 320 330 340 350 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 IADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTS . :.: : .. : . . . .:::::..:: . .:::.:..::..:::. . mKIAA4 VIDFGSASHVSK-----AVCSTYLQSRYYRAPEIILGL-PFCEAIDMWSLGCVIAELFLG 360 370 380 390 400 280 290 300 310 mKIAA1 EPIFHCRQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPA----------------DKD-----WED :.. .: .::. : ...:.:: : : :. mKIAA4 WPLYPGASE---------YDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDTDSPYPLWR- 410 420 430 440 450 320 330 340 350 mKIAA1 IRKMP-----EYPTLQKDFRRTTY------ANSSLIKYMEKHKV---KPDSKVFL-LLQK : : : .:. :. . :. .. .: . : : . :. ::.: mKIAA4 -LKTPDDHEAETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMTTDLEGSDMLVEKADRREFIDLLKK 460 470 480 490 500 510 360 370 380 390 400 mKIAA1 LLTMDPTKRITSEQALQDPYFQEDPL---PTLDVFAGC---------------QIPYPKR .::.: ::.: ..:. :. : : .: . : mKIAA4 MLTIDADKRVTPIETLNHPFVTMTHLLDFPHSAHVKSCFQNMEICKRRVNMYDTVNQSKT 520 530 540 550 560 570 410 420 430 440 450 mKIAA1 EFLNEDEPEEKGDKNQP---QQQNPHQQPAAPAQQTAAPPQAPPPQQSSAQTN------- :... : . . .. : . :.::.: :...:. :.. : : ..:: mKIAA4 PFITHVAPSTSTNLTMTFNNQLTTVHNQPSA-ASMAAVAPRSMPLQTGTAQICARPDPFQ 580 590 600 610 620 630 460 470 480 490 mKIAA1 --------GTAGGATAGGGGAGAGLQ-HSQDPGLNQVPPNKKPRIGPS----GANSGGP- : : .. . :: ... .. : ..:.: . .: :. : :: mKIAA4 QALIVCPPGFQGLQASPSKHAGYSVRMENAVPIVTQAPGAQPLQIQPGLLAQQAWPGGAQ 640 650 660 670 680 690 500 510 520 530 540 mKIAA1 --VMPSDYQHSSSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSQQSTQYHSSHQTHRY ..: .:. .. . ..::: .. :. ...:: ......: mKIAA4 QILLPPAWQQLTG-VATHTSVQHAAVIPETM--AGTQQLADWRNTHAHGSHYNPIMQQPA 700 710 720 730 740 mKIAA4 LLTGHVTLPAAQPLNVGVAHVMRQQPTSTTSSRKSKQHQSSVRNVSTCEVTSSQAISSPQ 750 760 770 780 790 800 >>mKIAA1278 ( 1271 res) mfj16286 (1271 aa) initn: 244 init1: 131 opt: 248 Z-score: 149.5 bits: 38.6 E(): 0.0035 Smith-Waterman score: 376; 28.615% identity (33.696% ungapped) in 325 aa overlap (72-385:47-333) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDGKDEKEYALKQIEG .:.:..:.:::.:.: . . ::: : mKIAA1 WIYSSLSPSSFYLLRDPETLAMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRKK--YSAQVVALKFIPK 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 mKIAA1 TGISMSACR----EIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHR : : . : :: ..: : :::.. . : ..:..: .. :::: .:..:.. mKIAA1 LGRSEKELRNLQREIEIMRGLWHPNIVHMLDSF--ETDKEVVVVTDYAEGELFQILE--- 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 ASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIA .::...:... :......:::.. .::::.:: ::: ...: : .:. mKIAA1 ------DDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNIL-LAKG---GGIKLC 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 DMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEP :.:::: ... :... : : .:::. : : .. :.:..:::. :: .. : mKIAA1 DFGFARAMSTNTMVLTSIKG---TPLYMSPELVE-ERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTP 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 IFHC----RQEDIKTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWED--IRKMPEYPTLQKDFRRT :. . .. ..: . .::. :: .: ..: : :: mKIAA1 PFYTTSIFQLVSLILKDPV---RWPSTISVITEPAGSDLGTPFTSRLP--PELQ------ 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 TYANSSLIKYMEKHKVKPD-SKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQEDPLPTLDV ..: . :.. : .. .: : : . .: . ::: : mKIAA1 ------VLKDEQAHRLAPKGNQSRILRQACKLMAEEAKQKEDQNAGSALEQEDRLCKVTP 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 FAGCQIPYPKREFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPAAPAQQTAAPPQAPPPQQSSAQT mKIAA1 STAPVPGLKATPQESSLLAGILASEMKNNWEDWGAGEAPRTSRENHINLECEQGFPEPRP 340 350 360 370 380 390 >>mKIAA0936 ( 503 res) mic27001 (503 aa) initn: 390 init1: 170 opt: 238 Z-score: 148.6 bits: 37.1 E(): 0.0039 Smith-Waterman score: 369; 33.231% identity (43.548% ungapped) in 325 aa overlap (198-500:1-270) 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 LPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNS :: :.: :: :: :::::.:.:: . : mKIAA0 KPENLLCMG--PEL--VKIADFGLAREIRS 10 20 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 -PLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQEDI : : .: : : ::::::.:: . .:.. :::::.:::.::. : .:.: .: mKIAA0 RP--PYTDY---VSTRWYRAPEVLLRSTNYSSPIDIWAVGCIMAEVYTLRPLFPGASEI- 30 40 50 60 70 80 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 KTSNPFHHDQLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPE-----YPTLQKDFRRTTYANSSLIKY : . .: .:.: : :: . .. .: . .: :.: mKIAA0 --------DTIFKICQVLGTPKKTDWPEGYQLSSAMNFLWPQCIPNNLKTLIPNAS---- 90 100 110 120 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 MEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQ-EDPLPTLDVFAGCQIPYPK :... ::. :: :: :: :. :::. :::: :: .. .: :. mKIAA0 ---------SEAIQLLRDLLQWDPKKRPTASQALRYPYFQIGHPLGIISKDSG----KPQ 130 140 150 160 170 410 420 430 440 450 mKIAA1 REFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPAAPAQQTAA--------PPQAP-PPQQSSAQTN :: ::. : :. .:: ::: : : :: :::.: . mKIAA0 REVQ---------DKTGPP---PYIKPAPPAQAPAKAYTLISSRPSQASQPPQHSVHPYK 180 190 200 210 220 460 470 480 490 500 mKIAA1 GTAGGATAGGGGAGAGLQHSQD--PGLNQVPP----NKKPRIGPSGANSGGPVMPSDYQH : .. . :.: :. :. : : .:.: : ...: . :. mKIAA0 GDVSRTEQ--------LSHVQEGKPSPPFFPSLHNKNLQPKILASLEQKNGEIKPKSRRR 230 240 250 260 270 510 520 530 540 mKIAA1 SSSRLNYQSSVQGSSQSQSTLGYSSSQQSTQYHSSHQTHRY mKIAA0 WGLISRSTKGSDDWADLDDLDFSPSLTRIDVKNKKRQSDDTLCRFESVLDLKPSESVGTG 280 290 300 310 320 330 >>mKIAA4207 ( 780 res) mph00550 (780 aa) initn: 227 init1: 88 opt: 237 Z-score: 145.9 bits: 37.3 E(): 0.0055 Smith-Waterman score: 277; 23.046% identity (26.807% ungapped) in 499 aa overlap (72-540:63-521) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRK-DGKDEKEYALKQIE .:.:....: ::. :: : :.: :. mKIAA4 SSKSNMLRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGK---EVAVKIID 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 mKIAA1 GTGISMSAC----REIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSDRKVWLLFDYAEH-DLWHIIKF : .. :. ::. ... :.:::.. : .:. .... ..:...:: ... . mKIAA4 KTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVI--ETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVA 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 HRASKANKKPMQLPRSMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVK : : .. ... . ::.....: : ....::::: :.:. .. .: mKIAA4 HGRMKEKE---------ARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADM----NIK 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 IADMGFARLFNSPLKPLADLDPVVVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLT- :::.::. :. : :: . : ::::. : .. .:.:..: :. :.. mKIAA4 IADFGFSNEFTFGNK----LDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSG 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 mKIAA1 SEPI----FHCRQEDI---KTSNPFHH----DQLDRIFSVMGFPADKDWEDIRKMPEYPT : :. .. .: . : ::. ..: . : ... :. : mKIAA4 SLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILN-PS--------KRGTLEQ 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 LQKD-FRRTTYANSSLIKYMEKHKVKPDSKVFLLLQKLLTMDPTKRITSEQALQDPYFQE ..:: . . . .. : :.: :: : . ...: :.. ... . . : . mKIAA4 IMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPL---PDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEV 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 mKIAA1 DPLPTLDVFAGCQI--------PYPKREFLNEDEPEEKGDKNQPQQQNPHQQPAAPAQQT : . . .. : :. .. : . : . .. . ::.:. .. mKIAA4 MATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSVSANPKQRRSSDQAVP 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 AAPPQAPPPQ--QSSAQTNGTAGGATAGGGGAGAGLQHSQDPGLNQVPPNKKPRIGPSGA : : . . ::. : :. ... : . : :::.. :: .:: . mKIAA4 AIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEETGRKASSTAKVPASPLPGLDR----KKTTPAPS-T 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 mKIAA1 NSGGPVMPSDYQHSSSRLNYQSSVQGSSQS-QSTLGYSSSQQSTQYHSSHQTHRY :: . .. ...: :. : :.: :. ...: . .: :: :. mKIAA4 NSVLST-STNRSRNSPLLDRASLGQASIQNGKDSLTMPGSWASTASASAAVSAARPRQHQ 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 KSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSSGAPDRTNFPRGV 540 550 560 570 580 590 546 residues in 1 query sequences 1768471 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:34:25 2006 done: Mon Mar 27 10:34:26 2006 Scan time: 0.730 Display time: 0.260 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]