# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg03527.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0530.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0530, 1898 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918821 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9966+/-0.000199; mu= 12.3108+/- 0.011 mean_var=100.6521+/-19.604, 0's: 34 Z-trim: 44 B-trim: 933 in 1/64 Lambda= 0.127839 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123226910|emb|CAM27829.1| zinc finger protein 2 (2693) 12557 2328.0 0 gi|123226909|emb|CAM27828.1| zinc finger protein 2 (2698) 12557 2328.0 0 gi|148673515|gb|EDL05462.1| mCG14011 [Mus musculus (2192) 12534 2323.7 0 gi|4102929|gb|AAD01625.1| Zn-15 transcription fact (2192) 12505 2318.4 0 gi|149045606|gb|EDL98606.1| zinc finger protein 29 (2169) 10415 1932.9 0 gi|169259769|ref|NP_001008879.2| zinc finger prote (2706) 10415 1933.0 0 gi|349555|gb|AAA74461.1| zinc-finger protein 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