FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0323.ptfa, 718 aa vs ./tmplib.26680 library 1768299 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0630+/-0.00543; mu= 2.3906+/- 0.358 mean_var=220.4343+/-52.760, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0864 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1305 ( 1161 res) mbp09087 (1161) 884 123 1.4e-28 mKIAA0615 ( 919 res) mid10054 ( 919) 800 113 1.7e-25 mKIAA1726 ( 613 res) mbp12272 ( 613) 514 77 6.8e-15 >>mKIAA1305 ( 1161 res) mbp09087 (1161 aa) initn: 871 init1: 670 opt: 884 Z-score: 605.5 bits: 123.3 E(): 1.4e-28 Smith-Waterman score: 884; 64.179% identity (65.816% ungapped) in 201 aa overlap (436-636:23-218) 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 APEPPWPCGDRDRDRDRGDRGDKQQAGARGRGSPWKRGTRGGNLVTGTQRFQEALQDPFT : :: ..:: :.::. ::..:::. :: mKIAA1 VPSRSKHQFLKEGLLGAWEGSQRLSPHSQGT---NIVTSFQRYNEALNTPFE 10 20 30 40 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 LCLANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGLQHYFSSRGIALAVQYFWDRGHRDITVFVPQWR . :.. ::.: ::..:::::.:::::::::.:: ::::.::::::.::::.:::::: :. mKIAA1 MNLSEEPGNPGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQYFWNRGHREITVFVPTWQ 50 60 70 80 90 100 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 FSKDSKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQF ..:. .::::::: ::. :..::.:::.. .::.:..:: ::::::::::::.::.:.:. mKIAA1 LKKNRRVRESHFLTKLHRLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGVIVTNEQI 110 120 130 140 150 160 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 RDLAEESDKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPVRKQGSSKTQQ . : ..: : : ...:::::::.:.:::::::::::.::::.:::::: : mKIAA1 HILMNNSKKLM--VKDRLLPFTFAGSLFMVPDDPLGRDGPTLEEFLKKPNRLDMDIGNFL 170 180 190 200 210 220 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 PSKGSTEQANQQQGKDADRSNGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQREPYCRD mKIAA1 KVWKTLPPSSASISELSDDADAEPLEDPQDVEEAGKEEGSLEEEPGIPKPDEEDEQDTNP 230 240 250 260 270 280 >>mKIAA0615 ( 919 res) mid10054 (919 aa) initn: 1118 init1: 797 opt: 800 Z-score: 550.2 bits: 112.7 E(): 1.7e-25 Smith-Waterman score: 986; 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