FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1511.ptfa, 1207 aa vs ./tmplib.26680 library 1767810 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0082+/-0.00649; mu= 4.1128+/- 0.431 mean_var=225.4958+/-52.824, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0854 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00044 ( 733 res) mph00426 ( 733) 3233 412 1.9e-115 mKIAA1577 ( 827 res) mbh02526 ( 827) 1997 260 1.4e-69 >>mFLJ00044 ( 733 res) mph00426 (733 aa) initn: 1990 init1: 1516 opt: 3233 Z-score: 2165.0 bits: 411.9 E(): 1.9e-115 Smith-Waterman score: 3233; 65.629% identity (66.804% ungapped) in 739 aa overlap (476-1207:1-733) 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 IILNPHCKLEEKSCWLQQLQKWSDLDICPLEDGNYGHELPNITNAL-SQSASHSPDSLS- :.:::. ..::. :: :...:.. . .. mFLJ00 EEGNYSLDIPNLQPALTSRTGSEDEEEVTA 10 20 30 510 520 530 540 550 mKIAA1 -RPRRTVFTRAIEGRELHWQDSHLQRIISSGIYTAPACQRE--NERLLFNSHGQPLWL-E ::::::.::... ::::.:::::::..: .:. ... :. .:.:.:: : mFLJ00 ASPRRTVFSRALQAGELHWNDSHLQRILASD-SCGPTLTGSMGSDKPTFDPQGHPIWLGE 40 50 60 70 80 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 HVPTACARVDALRSHGYPKEALRLTVAIINTLRLQQQRQLEIYKHQKKELLQRGTTTITN ::::::::.::.::::..::::. :::::::::...::: ::.:::::::.:.: .:. mFLJ00 PFPTACARVDTLRAHGYPHKALRLACAIINTLRLQRRHQLESYKQQKKELLQKGATGVTS 90 100 110 120 130 140 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 LEGWVGHPLDPIGCLFLTLTEACRLNDDSYMEMSD-MNESRLPVYQHVPVASGCPNSNES :::::::::::::: .: :::::... . . : :.: .:::: : : :. :: mFLJ00 TEGWVGHPLDPIGCLCRALLEACRLEEEPHSLFPDSAPEKRKLAYQHVLVP-GSPG--ES 150 160 170 180 190 200 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 YLSLALEVALMGMGQQRVMPEGLYAQDKVCRNEEQLLSQLQELQLDDELVQTLRKQCILL ::.:::::::.:.::::..:::::::::: :::::::. :.:..::..:::.:::: :: mFLJ00 YLALALEVALLGLGQQRALPEGLYAQDKVVRNEEQLLALLEEVELDERLVQVLRKQAGLL 210 220 230 240 250 260 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 LEGGPFSGLGEVIHRESVPMHTFAKYLFSALLPHDPDLSYKLALRAMRLPVLENSSSAGD ::::::::.:::: :::::::: :.:::.:::::::::...::::::::::::.. ::. mFLJ00 LEGGPFSGFGEVIFRESVPMHTCARYLFTALLPHDPDLAFRLALRAMRLPVLETTFPAGE 270 280 290 300 310 320 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 TSHPHHMVSVVPSRYPRWFTLGHLESQQCELASTMLTAAKGDTLRLRTLLEAIQKHIHSP :::. . :.. .:.:::: :::::..:::::::::::::::: :...: ..:..:::: mFLJ00 -SHPNPLDSIMSNRFPRWFILGHLETRQCELASTMLTAAKGDTKWLHAVLGSVQQNIHSP 330 340 350 360 370 380 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 SLIFKLAQDAFKIATPTDSSTDGTLLNVALELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCAT .:.::::::: : :::... : .::..:::::::::::::.:..:::::::::::.::: mFLJ00 ALLFKLAQDACKTATPASAPPDTVLLGIALELGLQVMRMTLNTMTWRRREMVRWLVSCAT 390 400 410 420 430 440 920 930 940 950 960 970 mKIAA1 EVGVRALVSILQSWYTLFTPTEATSIVAATAVSHTTILRLSLDYPQREELASCARTLALQ :.: ::.::...::.::::.::..:::.:...:.:.:::.:: :::: .:::::::: mFLJ00 EIGPPALMSIMKNWYSLFTPVEAVTIVAVTGTTHATLLRLQLDTAGREELWACARTLALQ 450 460 470 480 490 500 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 CAMKDPQSCALSALTLCEKDHIAFEAAYQIAIDAAAGGMTHSQLFTIARYMELRGYPLRA :::::::.::: :::::::.: ::::::::..::::::. :..:::.::::: :: :::: mFLJ00 CAMKDPQNCALPALTLCEKNHAAFEAAYQIVLDAAAGGLGHAHLFTVARYMEHRGLPLRA 510 520 530 540 550 560 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 FKLASLAMSHLNLAYNQDTHPAINDVLWACALSHSLGKNELAALIPLVVKSVHCATVLSD .:::.::...:..:.:::.:::.:::::::.::::::..::.:..::...:.::: .::: mFLJ00 YKLATLALAQLSIAFNQDSHPAVNDVLWACSLSHSLGRHELSAIVPLIIRSIHCAPMLSD 570 580 590 600 610 620 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 ILRRCTVTAPGLAGIPGRRSSGKLMSTDKAPLRQLLDATINAYINTTHSRLTHISPRHYG :::: :..::::. . .::.. : ..::.::: :::::.. :::.:.::::::::::::: mFLJ00 ILRRWTLSAPGLGPLGARRAT-KPLGTDRAPLCQLLDAAVAAYITTSHSRLTHISPRHYG 630 640 650 660 670 680 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA1 EFIEFLSKARETFLLPQDGHLQFAQFIDNLKQIYKGKKKLMLLVRERFG .:::::.:::::::: :::::::::..:::: :::::::::::::::: mFLJ00 DFIEFLGKARETFLLAPDGHLQFAQFLENLKQTYKGKKKLMLLVRERFG 690 700 710 720 730 >>mKIAA1577 ( 827 res) mbh02526 (827 aa) initn: 3959 init1: 1989 opt: 1997 Z-score: 1341.3 bits: 259.7 E(): 1.4e-69 Smith-Waterman score: 4061; 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