FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0315.ptfa, 1299 aa vs ./tmplib.26680 library 1767718 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7088+/-0.00429; mu= 13.6223+/- 0.285 mean_var=111.1096+/-26.185, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1217 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207) 1339 247 1.5e-65 mKIAA1206 ( 1374 res) mbg00219 (1374) 1132 211 1.5e-54 mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400) 928 175 9e-44 mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746) 911 172 8.3e-43 mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 908 171 1.1e-42 mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 ( 609) 886 167 8.3e-42 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 731 139 5.9e-34 mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 182 44 0.00015 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 164 41 0.0015 mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 ( 794) 148 38 0.01 >>mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207 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::::: mKIAA0 FLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYV-AKNPK 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 LMLR-------------------------------------------------------- :::: mKIAA0 LMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYT 750 760 770 780 790 800 950 960 mKIAA0 ----------------------------------------CD--AEVKEKIIDQVYRTQP :: ...:::..::.:. mKIAA0 LNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQCVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVL 810 820 830 840 850 860 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA0 CSCWPKPDSVVL--EWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRINTLMHYNVRDGATLILSK . .::: .: ::: : ... :::: :.::. .: :.:.:::.::.: ::::. : mKIAA0 LA--QRPDSCTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSELQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVP 870 880 890 900 910 920 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 VGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEEN----RVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSMK--EKERT ... ...:. .:::: .::. . : ::::.:.:: . . .:::.. :.::. mKIAA0 CLTKHILRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERA 930 940 950 960 970 980 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 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:::: :.: .:.:::::::: ::::::.::::..::::. mKIAA1 LSMNRPVPIAVKYLFDFLDELAEKHGIEDPETLHIWKTNSLLLRFWVNVLKNPQLIFDVQ 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA0 VHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMV : . :: :.::::::.:.: .:::..:::: ::::::.:: ::.::: :: ::: mKIAA1 VSDNEDAILAVIAQTFIDSCMVSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVEKYYADIRQSS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA0 QVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFR .: :.::. :::.: .... . : ::..::.. ..:::.::.::::::.::::::: : mKIAA1 PASYQEMNSALAELSGNYSSAPHCLEALRELYNHIHRYYDQIISALEEDPVAQKMQLACR 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1290 mKIAA0 LQQIAAALENKVTDL :::.:: .: ::::: mKIAA1 LQQVAALVEYKVTDL 1360 1370 >>mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400 aa) initn: 1877 init1: 705 opt: 928 Z-score: 878.2 bits: 174.9 E(): 9e-44 Smith-Waterman score: 2120; 31.756% identity (39.640% ungapped) in 1458 aa overlap (61-1292:3-1396) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 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