FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0313.ptfa, 1138 aa vs ./tmplib.26680 library 1767879 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5134+/-0.00659; mu= -2.8891+/- 0.435 mean_var=318.5186+/-75.573, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 8 in 1/35 Lambda= 0.0719 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4052 ( 1046 res) mbg11557 (1046) 3360 363 1.6e-100 mKIAA4040 ( 1035 res) mic20095 (1035) 581 75 8.4e-14 mKIAA0277 ( 584 res) mbg05659 ( 584) 575 74 8.7e-14 mKIAA0351 ( 537 res) mbg14564 ( 537) 239 39 0.0025 >>mKIAA4052 ( 1046 res) mbg11557 (1046 aa) initn: 3480 init1: 2308 opt: 3360 Z-score: 1897.2 bits: 362.8 E(): 1.6e-100 Smith-Waterman score: 3956; 63.504% identity (66.129% ungapped) in 1033 aa overlap (2-1030:41-1036) 10 20 30 mKIAA0 NNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLT ::: ::.::::::::::::::: : ..: mKIAA4 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